RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569441.5

JMJD8-214, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

TSL 5

Gene JMJD8, Length 1,428 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-214ENST00000569441 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.62■■■■■ 5.69
JMJD8-214ENST00000569441 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.62■■■■■ 5.69
JMJD8-214ENST00000569441 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.62■■■■■ 5.69
JMJD8-214ENST00000569441 SHROOM2Q13796 1616 aa50.57■■■■■ 5.69
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JMJD8-214ENST00000569441 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.43■■■■■ 5.66
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JMJD8-214ENST00000569441 GLI2P10070 1586 aa48.6■■■■■ 5.37
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JMJD8-214ENST00000569441 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.59■■■■■ 5.37
JMJD8-214ENST00000569441 CCDC18Q5T9S5 1454 aa48.53■■■■■ 5.36
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JMJD8-214ENST00000569441 TSPOAP1O95153 1857 aa48.38■■■■■ 5.34
JMJD8-214ENST00000569441 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa48.35■■■■■ 5.33
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JMJD8-214ENST00000569441 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.81■■■■■ 5.24
JMJD8-214ENST00000569441 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
JMJD8-214ENST00000569441 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
JMJD8-214ENST00000569441 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.8■■■■■ 5.24
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