RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568104.5

BBS2-218, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BBS2, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-218ENST00000568104 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.41■■□□□ 1.5
BBS2-218ENST00000568104 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.4■■□□□ 1.5
BBS2-218ENST00000568104 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.4■■□□□ 1.5
BBS2-218ENST00000568104 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
BBS2-218ENST00000568104 P3H3Q8IVL6 736 aa24.39■■□□□ 1.5
BBS2-218ENST00000568104 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.39■■□□□ 1.49
BBS2-218ENST00000568104 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
BBS2-218ENST00000568104 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.37■■□□□ 1.49
BBS2-218ENST00000568104 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
BBS2-218ENST00000568104 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.35■■□□□ 1.49
BBS2-218ENST00000568104 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.35■■□□□ 1.49
BBS2-218ENST00000568104 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.35■■□□□ 1.49
BBS2-218ENST00000568104 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.31■■□□□ 1.48
BBS2-218ENST00000568104 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
BBS2-218ENST00000568104 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.29■■□□□ 1.48
BBS2-218ENST00000568104 ITGAEP38570 1179 aa24.28■■□□□ 1.48
BBS2-218ENST00000568104 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
BBS2-218ENST00000568104 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.27■■□□□ 1.48
BBS2-218ENST00000568104 FMN1Q68DA7 1419 aa24.25■■□□□ 1.47
BBS2-218ENST00000568104 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
BBS2-218ENST00000568104 SAMD9Q5K651 1589 aa24.19■■□□□ 1.46
BBS2-218ENST00000568104 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.17■■□□□ 1.46
BBS2-218ENST00000568104 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.16■■□□□ 1.46
BBS2-218ENST00000568104 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
BBS2-218ENST00000568104 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.13■■□□□ 1.45
BBS2-218ENST00000568104 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
BBS2-218ENST00000568104 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.13■■□□□ 1.45
BBS2-218ENST00000568104 PBRM1Q86U86 1689 aa24.11■■□□□ 1.45
BBS2-218ENST00000568104 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
BBS2-218ENST00000568104 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
BBS2-218ENST00000568104 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
BBS2-218ENST00000568104 GRIN2BQ13224 1484 aa24.05■■□□□ 1.44
BBS2-218ENST00000568104 NEUROD1Q13562 356 aa24.04■■□□□ 1.44
BBS2-218ENST00000568104 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.04■■□□□ 1.44
BBS2-218ENST00000568104 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
BBS2-218ENST00000568104 MAPKBP1O60336 1514 aa24.02■■□□□ 1.44
BBS2-218ENST00000568104 ADAMTS12P58397 1594 aa24.02■■□□□ 1.44
BBS2-218ENST00000568104 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.01■■□□□ 1.43
BBS2-218ENST00000568104 MIER1Q8N108 512 aa24■■□□□ 1.43
BBS2-218ENST00000568104 FGD6Q6ZV73 1430 aa24■■□□□ 1.43
BBS2-218ENST00000568104 IQGAP2Q13576 1575 aa23.97■■□□□ 1.43
BBS2-218ENST00000568104 IFT140Q96RY7 1462 aa23.97■■□□□ 1.43
BBS2-218ENST00000568104 WDR62O43379 1518 aa23.95■■□□□ 1.42
BBS2-218ENST00000568104 NCOA2Q15596 1464 aa23.93■■□□□ 1.42
BBS2-218ENST00000568104 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.93■■□□□ 1.42
BBS2-218ENST00000568104 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
BBS2-218ENST00000568104 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.91■■□□□ 1.42
BBS2-218ENST00000568104 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
BBS2-218ENST00000568104 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.89■■□□□ 1.42
BBS2-218ENST00000568104 HECW1Q76N89 1606 aa23.87■■□□□ 1.41
BBS2-218ENST00000568104 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.84■■□□□ 1.41
BBS2-218ENST00000568104 ARHGEF11O15085 1522 aa23.83■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.83■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 PTPRKQ15262 1439 aa23.81■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 HFM1A2PYH4 1435 aa23.8■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.8■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.78■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.78■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.78■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 ERCC6Q03468 1493 aa23.78■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
BBS2-218ENST00000568104 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.76■■□□□ 1.39
BBS2-218ENST00000568104 GRIN2AQ12879 1464 aa23.73■■□□□ 1.39
BBS2-218ENST00000568104 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
BBS2-218ENST00000568104 NAIPQ13075 1403 aa23.72■■□□□ 1.39
BBS2-218ENST00000568104 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
BBS2-218ENST00000568104 KIAA0556O60303 1618 aa23.71■■□□□ 1.39
BBS2-218ENST00000568104 UACAQ9BZF9 1416 aa23.71■■□□□ 1.39
BBS2-218ENST00000568104 DISP1Q96F81 1524 aa23.7■■□□□ 1.38
BBS2-218ENST00000568104 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
BBS2-218ENST00000568104 MIA2Q96PC5 1412 aa23.65■■□□□ 1.38
BBS2-218ENST00000568104 ARID3CA6NKF2 412 aa23.63■■□□□ 1.37
BBS2-218ENST00000568104 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
BBS2-218ENST00000568104 SYNJ2O15056 1496 aa23.6■■□□□ 1.37
BBS2-218ENST00000568104 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
BBS2-218ENST00000568104 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.59■■□□□ 1.37
BBS2-218ENST00000568104 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
BBS2-218ENST00000568104 AKNAQ7Z591 1439 aa23.58■■□□□ 1.37
BBS2-218ENST00000568104 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.58■■□□□ 1.36
BBS2-218ENST00000568104 TONSLQ96HA7 1378 aa23.57■■□□□ 1.36
BBS2-218ENST00000568104 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.57■■□□□ 1.36
BBS2-218ENST00000568104 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.57■■□□□ 1.36
BBS2-218ENST00000568104 CEP170Q5SW79 1584 aa23.56■■□□□ 1.36
BBS2-218ENST00000568104 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
BBS2-218ENST00000568104 FBLN2P98095 1184 aa23.51■■□□□ 1.35
BBS2-218ENST00000568104 NUP160Q12769 1436 aa23.48■■□□□ 1.35
BBS2-218ENST00000568104 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
BBS2-218ENST00000568104 KDM6BO15054 1643 aa23.45■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 DAPK1P53355 1430 aa23.45■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 TRIM52Q96A61 297 aa23.45■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.44■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 JPH4Q96JJ6 628 aa23.44■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 ROCK1Q13464 1354 aa23.43■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
BBS2-218ENST00000568104 ABCC5O15440 1437 aa23.41■■□□□ 1.34
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