RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 PRXQ9BXM0 1461 aa43.51■■■■■ 4.56
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NME3-209ENST00000566600 IQGAP2Q13576 1575 aa43.26■■■■■ 4.52
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NME3-209ENST00000566600 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
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NME3-209ENST00000566600 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.54■■■■■ 4.4
NME3-209ENST00000566600 P3H3Q8IVL6 736 aa42.52■■■■■ 4.4
NME3-209ENST00000566600 UACAQ9BZF9 1416 aa42.52■■■■■ 4.4
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NME3-209ENST00000566600 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.36■■■■■ 4.37
NME3-209ENST00000566600 ABCA8O94911 1581 aa42.35■■■■■ 4.37
NME3-209ENST00000566600 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.31■■■■■ 4.36
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NME3-209ENST00000566600 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.04■■■■■ 4.32
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NME3-209ENST00000566600 DIP2BQ9P265 1576 aa41.95■■■■■ 4.31
NME3-209ENST00000566600 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.94■■■■■ 4.3
NME3-209ENST00000566600 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.94■■■■■ 4.3
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NME3-209ENST00000566600 HECW1Q76N89 1606 aa41.91■■■■■ 4.3
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NME3-209ENST00000566600 KCNH8Q96L42 1107 aa41.72■■■■■ 4.27
NME3-209ENST00000566600 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
NME3-209ENST00000566600 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.67■■■■■ 4.26
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NME3-209ENST00000566600 CD109Q6YHK3 1445 aa41.51■■■■■ 4.24
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NME3-209ENST00000566600 KDM6BO15054 1643 aa41.24■■■■■ 4.19
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NME3-209ENST00000566600 MAP3K1Q13233 1512 aa41.18■■■■■ 4.18
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NME3-209ENST00000566600 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.99■■■■■ 4.15
NME3-209ENST00000566600 PREX2Q70Z35 1606 aa40.99■■■■■ 4.15
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