RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 GRIN2AQ12879 1464 aa31.29■■■□□ 2.6
CTU2-204ENST00000564105 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CTU2-204ENST00000564105 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.26■■■□□ 2.59
CTU2-204ENST00000564105 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.22■■■□□ 2.59
CTU2-204ENST00000564105 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.22■■■□□ 2.59
CTU2-204ENST00000564105 ARAP1Q96P48 1450 aa31.17■■■□□ 2.58
CTU2-204ENST00000564105 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.17■■■□□ 2.58
CTU2-204ENST00000564105 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CTU2-204ENST00000564105 CEP170Q5SW79 1584 aa31.15■■■□□ 2.58
CTU2-204ENST00000564105 NUP160Q12769 1436 aa31.08■■■□□ 2.57
CTU2-204ENST00000564105 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.03■■■□□ 2.56
CTU2-204ENST00000564105 IQGAP2Q13576 1575 aa31.01■■■□□ 2.55
CTU2-204ENST00000564105 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.99■■■□□ 2.55
CTU2-204ENST00000564105 SHROOM2Q13796 1616 aa30.85■■■□□ 2.53
CTU2-204ENST00000564105 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
CTU2-204ENST00000564105 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.82■■■□□ 2.52
CTU2-204ENST00000564105 CEP162Q5TB80 1403 aa30.81■■■□□ 2.52
CTU2-204ENST00000564105 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.79■■■□□ 2.52
CTU2-204ENST00000564105 SAMD9Q5K651 1589 aa30.77■■■□□ 2.52
CTU2-204ENST00000564105 JPH4Q96JJ6 628 aa30.76■■■□□ 2.52
CTU2-204ENST00000564105 CLIP1P30622 1438 aa30.75■■■□□ 2.51
CTU2-204ENST00000564105 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.74■■■□□ 2.51
CTU2-204ENST00000564105 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CTU2-204ENST00000564105 KIAA0556O60303 1618 aa30.7■■■□□ 2.51
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.7■■■□□ 2.5
CTU2-204ENST00000564105 DISP1Q96F81 1524 aa30.68■■■□□ 2.5
CTU2-204ENST00000564105 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CTU2-204ENST00000564105 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.63■■■□□ 2.49
CTU2-204ENST00000564105 P3H3Q8IVL6 736 aa30.61■■■□□ 2.49
CTU2-204ENST00000564105 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.57■■■□□ 2.48
CTU2-204ENST00000564105 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CTU2-204ENST00000564105 FMN1Q68DA7 1419 aa30.41■■■□□ 2.46
CTU2-204ENST00000564105 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.38■■■□□ 2.45
CTU2-204ENST00000564105 PTPRGP23470 1445 aa30.38■■■□□ 2.45
CTU2-204ENST00000564105 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CTU2-204ENST00000564105 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.34■■■□□ 2.45
CTU2-204ENST00000564105 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.29■■■□□ 2.44
CTU2-204ENST00000564105 ABCA8O94911 1581 aa30.29■■■□□ 2.44
CTU2-204ENST00000564105 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.27■■■□□ 2.44
CTU2-204ENST00000564105 HECW1Q76N89 1606 aa30.27■■■□□ 2.44
CTU2-204ENST00000564105 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.25■■■□□ 2.43
CTU2-204ENST00000564105 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.25■■■□□ 2.43
CTU2-204ENST00000564105 UACAQ9BZF9 1416 aa30.21■■■□□ 2.43
CTU2-204ENST00000564105 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.2■■■□□ 2.43
CTU2-204ENST00000564105 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.2■■■□□ 2.43
CTU2-204ENST00000564105 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CTU2-204ENST00000564105 ABCC2Q92887 1545 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-204ENST00000564105 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CTU2-204ENST00000564105 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.14■■■□□ 2.42
CTU2-204ENST00000564105 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.13■■■□□ 2.41
CTU2-204ENST00000564105 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CTU2-204ENST00000564105 MAPKBP1O60336 1514 aa30.08■■■□□ 2.41
CTU2-204ENST00000564105 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.08■■■□□ 2.41
CTU2-204ENST00000564105 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 TIAM1Q13009 1591 aa30.07■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 ARID3CA6NKF2 412 aa30.04■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 APLP2Q06481 763 aa30.04■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K1Q13233 1512 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 ATP10BO94823 1461 aa30.01■■■□□ 2.4
CTU2-204ENST00000564105 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.01■■■□□ 2.39
CTU2-204ENST00000564105 DIP2BQ9P265 1576 aa29.99■■■□□ 2.39
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CTU2-204ENST00000564105 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.96■■■□□ 2.39
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CTU2-204ENST00000564105 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU2-204ENST00000564105 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.87■■■□□ 2.37
CTU2-204ENST00000564105 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CTU2-204ENST00000564105 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.85■■■□□ 2.37
CTU2-204ENST00000564105 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CTU2-204ENST00000564105 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU2-204ENST00000564105 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CTU2-204ENST00000564105 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.81■■■□□ 2.36
CTU2-204ENST00000564105 TSPOAP1O95153 1857 aa29.8■■■□□ 2.36
CTU2-204ENST00000564105 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CTU2-204ENST00000564105 ASXL2Q76L83 1435 aa29.77■■■□□ 2.36
CTU2-204ENST00000564105 KIF14Q15058 1648 aa29.75■■■□□ 2.35
CTU2-204ENST00000564105 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.74■■■□□ 2.35
CTU2-204ENST00000564105 GLI2P10070 1586 aa29.67■■■□□ 2.34
CTU2-204ENST00000564105 NCOA2Q15596 1464 aa29.65■■■□□ 2.34
CTU2-204ENST00000564105 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CTU2-204ENST00000564105 KCNH8Q96L42 1107 aa29.64■■■□□ 2.34
CTU2-204ENST00000564105 KDM6BO15054 1643 aa29.64■■■□□ 2.34
CTU2-204ENST00000564105 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.63■■■□□ 2.33
CTU2-204ENST00000564105 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.61■■■□□ 2.33
CTU2-204ENST00000564105 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.61■■■□□ 2.33
CTU2-204ENST00000564105 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.6■■■□□ 2.33
CTU2-204ENST00000564105 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.6■■■□□ 2.33
CTU2-204ENST00000564105 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.59■■■□□ 2.33
CTU2-204ENST00000564105 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.55■■■□□ 2.32
CTU2-204ENST00000564105 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.55■■■□□ 2.32
CTU2-204ENST00000564105 PREX2Q70Z35 1606 aa29.52■■■□□ 2.32
CTU2-204ENST00000564105 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.52■■■□□ 2.32
CTU2-204ENST00000564105 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.5■■■□□ 2.31
CTU2-204ENST00000564105 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.47■■■□□ 2.31
CTU2-204ENST00000564105 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms