RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.6■■□□□ 1.69
MEIS3-211ENST00000561204 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
MEIS3-211ENST00000561204 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.57■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 CUL7Q14999 1698 aa25.56■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 ITGAEP38570 1179 aa25.56■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 P3H3Q8IVL6 736 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-211ENST00000561204 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-211ENST00000561204 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-211ENST00000561204 WDR97A6NE52 1622 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS3-211ENST00000561204 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-211ENST00000561204 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-211ENST00000561204 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
MEIS3-211ENST00000561204 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.46■■□□□ 1.67
MEIS3-211ENST00000561204 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.43■■□□□ 1.66
MEIS3-211ENST00000561204 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
MEIS3-211ENST00000561204 MAPKBP1O60336 1514 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-211ENST00000561204 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-211ENST00000561204 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-211ENST00000561204 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-211ENST00000561204 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-211ENST00000561204 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-211ENST00000561204 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-211ENST00000561204 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.34■■□□□ 1.65
MEIS3-211ENST00000561204 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.33■■□□□ 1.65
MEIS3-211ENST00000561204 FMN1Q68DA7 1419 aa25.33■■□□□ 1.65
MEIS3-211ENST00000561204 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.33■■□□□ 1.64
MEIS3-211ENST00000561204 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.32■■□□□ 1.64
MEIS3-211ENST00000561204 SAMD9Q5K651 1589 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-211ENST00000561204 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-211ENST00000561204 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-211ENST00000561204 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MEIS3-211ENST00000561204 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.21■■□□□ 1.63
MEIS3-211ENST00000561204 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.2■■□□□ 1.62
MEIS3-211ENST00000561204 GRIN2BQ13224 1484 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-211ENST00000561204 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-211ENST00000561204 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-211ENST00000561204 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
MEIS3-211ENST00000561204 NCOA2Q15596 1464 aa25.09■■□□□ 1.61
MEIS3-211ENST00000561204 PBRM1Q86U86 1689 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-211ENST00000561204 PTPRKQ15262 1439 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-211ENST00000561204 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-211ENST00000561204 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-211ENST00000561204 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-211ENST00000561204 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-211ENST00000561204 HFM1A2PYH4 1435 aa25.02■■□□□ 1.6
MEIS3-211ENST00000561204 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
MEIS3-211ENST00000561204 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25■■□□□ 1.59
MEIS3-211ENST00000561204 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25■■□□□ 1.59
MEIS3-211ENST00000561204 ADAMTS12P58397 1594 aa25■■□□□ 1.59
MEIS3-211ENST00000561204 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.99■■□□□ 1.59
MEIS3-211ENST00000561204 ARHGEF11O15085 1522 aa24.99■■□□□ 1.59
MEIS3-211ENST00000561204 IQGAP2Q13576 1575 aa24.98■■□□□ 1.59
MEIS3-211ENST00000561204 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.98■■□□□ 1.59
MEIS3-211ENST00000561204 NAIPQ13075 1403 aa24.95■■□□□ 1.58
MEIS3-211ENST00000561204 UACAQ9BZF9 1416 aa24.95■■□□□ 1.58
MEIS3-211ENST00000561204 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
MEIS3-211ENST00000561204 HECW1Q76N89 1606 aa24.93■■□□□ 1.58
MEIS3-211ENST00000561204 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 WDR62O43379 1518 aa24.84■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 KCNH8Q96L42 1107 aa24.84■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 TONSLQ96HA7 1378 aa24.83■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MEIS3-211ENST00000561204 IFT140Q96RY7 1462 aa24.82■■□□□ 1.56
MEIS3-211ENST00000561204 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
MEIS3-211ENST00000561204 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.79■■□□□ 1.56
MEIS3-211ENST00000561204 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.76■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 MIA2Q96PC5 1412 aa24.75■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.74■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.74■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 AKNAQ7Z591 1439 aa24.74■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.73■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 DISP1Q96F81 1524 aa24.72■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 ARID3CA6NKF2 412 aa24.72■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 KIAA0556O60303 1618 aa24.72■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 KDM6BO15054 1643 aa24.71■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
MEIS3-211ENST00000561204 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
MEIS3-211ENST00000561204 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
MEIS3-211ENST00000561204 GRIN2AQ12879 1464 aa24.67■■□□□ 1.54
MEIS3-211ENST00000561204 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
MEIS3-211ENST00000561204 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.61■■□□□ 1.53
MEIS3-211ENST00000561204 TRIM52Q96A61 297 aa24.61■■□□□ 1.53
MEIS3-211ENST00000561204 CCER2I3L3R5 266 aa24.59■■□□□ 1.53
MEIS3-211ENST00000561204 DAPK1P53355 1430 aa24.58■■□□□ 1.53
MEIS3-211ENST00000561204 ANP32CO43423 234 aa24.57■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.57■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 ROCK1Q13464 1354 aa24.55■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 ABCC5O15440 1437 aa24.54■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 CEP170Q5SW79 1584 aa24.52■■□□□ 1.52
MEIS3-211ENST00000561204 ERCC6Q03468 1493 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms