RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560099.5

PSMA4-218, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSMA4, Length 2,596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-218ENST00000560099 P3H3Q8IVL6 736 aa30.03■■■□□ 2.4
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PSMA4-218ENST00000560099 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
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PSMA4-218ENST00000560099 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.91■■■□□ 2.38
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PSMA4-218ENST00000560099 WDR97A6NE52 1622 aa29.7■■■□□ 2.35
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PSMA4-218ENST00000560099 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
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PSMA4-218ENST00000560099 PTPRKQ15262 1439 aa29.48■■■□□ 2.31
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PSMA4-218ENST00000560099 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
PSMA4-218ENST00000560099 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PSMA4-218ENST00000560099 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.81■■■□□ 2.2
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PSMA4-218ENST00000560099 ROCK1Q13464 1354 aa28.76■■■□□ 2.2
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