RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557916.5

SMAD6-202, Transcript of SMAD family member 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD6, Length 1,401 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6-202ENST00000557916 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.28■■■■■ 4.36
SMAD6-202ENST00000557916 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.28■■■■■ 4.36
SMAD6-202ENST00000557916 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.28■■■■■ 4.36
SMAD6-202ENST00000557916 JPH4Q96JJ6 628 aa42.24■■■■■ 4.35
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SMAD6-202ENST00000557916 ATP10BO94823 1461 aa40.93■■■■■ 4.14
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SMAD6-202ENST00000557916 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.97■■■■□ 3.99
SMAD6-202ENST00000557916 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.96■■■■□ 3.99
SMAD6-202ENST00000557916 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
SMAD6-202ENST00000557916 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
SMAD6-202ENST00000557916 NCOA2Q15596 1464 aa39.93■■■■□ 3.98
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