RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557682.6

LINC01578-209, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, human

TSL 2 BASIC

Gene LINC01578, Length 2,683 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01578-209	ENST00000557682	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.93	■■■■□ 3.02
LINC01578-209	ENST00000557682	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
LINC01578-209	ENST00000557682	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
LINC01578-209	ENST00000557682	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.87	■■■■□ 3.01
LINC01578-209	ENST00000557682	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
LINC01578-209	ENST00000557682	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.81	■■■■□ 3
LINC01578-209	ENST00000557682	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
LINC01578-209	ENST00000557682	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.79	■■■■□ 3
LINC01578-209	ENST00000557682	MIER1	Q8N108	512 aa		33.78	■■■■□ 3
LINC01578-209	ENST00000557682	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.77	■■■■□ 3
LINC01578-209	ENST00000557682	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
LINC01578-209	ENST00000557682	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.74	■■■□□ 2.99
LINC01578-209	ENST00000557682	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.72	■■■□□ 2.99
LINC01578-209	ENST00000557682	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.71	■■■□□ 2.99
LINC01578-209	ENST00000557682	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
LINC01578-209	ENST00000557682	CUL7	Q14999	1698 aa		33.68	■■■□□ 2.98
LINC01578-209	ENST00000557682	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.68	■■■□□ 2.98
LINC01578-209	ENST00000557682	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.68	■■■□□ 2.98
LINC01578-209	ENST00000557682	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.65	■■■□□ 2.98
LINC01578-209	ENST00000557682	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.63	■■■□□ 2.97
LINC01578-209	ENST00000557682	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.62	■■■□□ 2.97
LINC01578-209	ENST00000557682	MYT1	Q01538	1121 aa		33.6	■■■□□ 2.97
LINC01578-209	ENST00000557682	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.59	■■■□□ 2.97
LINC01578-209	ENST00000557682	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		33.58	■■■□□ 2.97
LINC01578-209	ENST00000557682	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		33.58	■■■□□ 2.97
LINC01578-209	ENST00000557682	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.57	■■■□□ 2.96
LINC01578-209	ENST00000557682	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.55	■■■□□ 2.96
LINC01578-209	ENST00000557682	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.54	■■■□□ 2.96
LINC01578-209	ENST00000557682	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.5	■■■□□ 2.95
LINC01578-209	ENST00000557682	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.48	■■■□□ 2.95
LINC01578-209	ENST00000557682	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.44	■■■□□ 2.94
LINC01578-209	ENST00000557682	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.41	■■■□□ 2.94	1e-8	■■■■□ 19.4
LINC01578-209	ENST00000557682	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.41	■■■□□ 2.94
LINC01578-209	ENST00000557682	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
LINC01578-209	ENST00000557682	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LINC01578-209	ENST00000557682	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LINC01578-209	ENST00000557682	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.35	■■■□□ 2.93
LINC01578-209	ENST00000557682	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.32	■■■□□ 2.93
LINC01578-209	ENST00000557682	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.28	■■■□□ 2.92
LINC01578-209	ENST00000557682	GRIN2B	Q13224	1484 aa		33.24	■■■□□ 2.91
LINC01578-209	ENST00000557682	PBRM1	Q86U86	1689 aa		33.19	■■■□□ 2.9
LINC01578-209	ENST00000557682	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.19	■■■□□ 2.9
LINC01578-209	ENST00000557682	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.18	■■■□□ 2.9
LINC01578-209	ENST00000557682	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.17	■■■□□ 2.9
LINC01578-209	ENST00000557682	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.13	■■■□□ 2.89
LINC01578-209	ENST00000557682	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.13	■■■□□ 2.89
LINC01578-209	ENST00000557682	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.12	■■■□□ 2.89	4e-8	■■□□□ 11.6
LINC01578-209	ENST00000557682	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
LINC01578-209	ENST00000557682	ADAMTS12	P58397	1594 aa		33.08	■■■□□ 2.89
LINC01578-209	ENST00000557682	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LINC01578-209	ENST00000557682	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LINC01578-209	ENST00000557682	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LINC01578-209	ENST00000557682	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LINC01578-209	ENST00000557682	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LINC01578-209	ENST00000557682	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.01	■■■□□ 2.88
LINC01578-209	ENST00000557682	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
LINC01578-209	ENST00000557682	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
LINC01578-209	ENST00000557682	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.97	■■■□□ 2.87
LINC01578-209	ENST00000557682	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LINC01578-209	ENST00000557682	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.96	■■■□□ 2.87
LINC01578-209	ENST00000557682	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.95	■■■□□ 2.87
LINC01578-209	ENST00000557682	NAIP	Q13075	1403 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LINC01578-209	ENST00000557682	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.93	■■■□□ 2.86
LINC01578-209	ENST00000557682	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.92	■■■□□ 2.86
LINC01578-209	ENST00000557682	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
LINC01578-209	ENST00000557682	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LINC01578-209	ENST00000557682	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LINC01578-209	ENST00000557682	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
LINC01578-209	ENST00000557682	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
LINC01578-209	ENST00000557682	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.86	■■■□□ 2.85
LINC01578-209	ENST00000557682	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.85	■■■□□ 2.85
LINC01578-209	ENST00000557682	WDR62	O43379	1518 aa		32.84	■■■□□ 2.85
LINC01578-209	ENST00000557682	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.79	■■■□□ 2.84
LINC01578-209	ENST00000557682	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.76	■■■□□ 2.84
LINC01578-209	ENST00000557682	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
LINC01578-209	ENST00000557682	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LINC01578-209	ENST00000557682	KDM6B	O15054	1643 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LINC01578-209	ENST00000557682	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.72	■■■□□ 2.83
LINC01578-209	ENST00000557682	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
LINC01578-209	ENST00000557682	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LINC01578-209	ENST00000557682	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LINC01578-209	ENST00000557682	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.7	■■■□□ 2.82
LINC01578-209	ENST00000557682	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.68	■■■□□ 2.82
LINC01578-209	ENST00000557682	FBLN2	P98095	1184 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LINC01578-209	ENST00000557682	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
LINC01578-209	ENST00000557682	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
LINC01578-209	ENST00000557682	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
LINC01578-209	ENST00000557682	FOXD1	Q16676	465 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LINC01578-209	ENST00000557682	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
LINC01578-209	ENST00000557682	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.59	■■■□□ 2.81
LINC01578-209	ENST00000557682	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
LINC01578-209	ENST00000557682	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LINC01578-209	ENST00000557682	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LINC01578-209	ENST00000557682	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.54	■■■□□ 2.8
LINC01578-209	ENST00000557682	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.53	■■■□□ 2.8
LINC01578-209	ENST00000557682	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.51	■■■□□ 2.8
LINC01578-209	ENST00000557682	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
LINC01578-209	ENST00000557682	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LINC01578-209	ENST00000557682	DAPK1	P53355	1430 aa		32.48	■■■□□ 2.79
LINC01578-209	ENST00000557682	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.46	■■■□□ 2.79

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