RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.9■■□□□ 1.74
XRCC3-218ENST00000557439 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.9■■□□□ 1.74
XRCC3-218ENST00000557439 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
XRCC3-218ENST00000557439 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.87■■□□□ 1.73
XRCC3-218ENST00000557439 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.87■■□□□ 1.73
XRCC3-218ENST00000557439 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
XRCC3-218ENST00000557439 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
XRCC3-218ENST00000557439 TOPBP1Q92547 1522 aa25.83■■□□□ 1.73
XRCC3-218ENST00000557439 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.8■■□□□ 1.72
XRCC3-218ENST00000557439 MAPKBP1O60336 1514 aa25.77■■□□□ 1.72
XRCC3-218ENST00000557439 MAP3K1Q13233 1512 aa25.76■■□□□ 1.71
XRCC3-218ENST00000557439 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.76■■□□□ 1.71
XRCC3-218ENST00000557439 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.76■■□□□ 1.71
XRCC3-218ENST00000557439 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.76■■□□□ 1.71
XRCC3-218ENST00000557439 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.74■■□□□ 1.71
XRCC3-218ENST00000557439 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.73■■□□□ 1.71
XRCC3-218ENST00000557439 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.7■■□□□ 1.7
XRCC3-218ENST00000557439 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
XRCC3-218ENST00000557439 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
XRCC3-218ENST00000557439 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.59■■□□□ 1.69
XRCC3-218ENST00000557439 KCNH8Q96L42 1107 aa25.59■■□□□ 1.69
XRCC3-218ENST00000557439 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.59■■□□□ 1.69
XRCC3-218ENST00000557439 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.59■■□□□ 1.69
XRCC3-218ENST00000557439 CUL7Q14999 1698 aa25.58■■□□□ 1.68
XRCC3-218ENST00000557439 WDR97A6NE52 1622 aa25.57■■□□□ 1.68
XRCC3-218ENST00000557439 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
XRCC3-218ENST00000557439 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.56■■□□□ 1.68
XRCC3-218ENST00000557439 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.5■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.49■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.48■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.48■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 FMN1Q68DA7 1419 aa25.47■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.676e-6■■■■□ 25.1
XRCC3-218ENST00000557439 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.46■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.45■■□□□ 1.67
XRCC3-218ENST00000557439 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.45■■□□□ 1.66
XRCC3-218ENST00000557439 PTPRKQ15262 1439 aa25.44■■□□□ 1.66
XRCC3-218ENST00000557439 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.41■■□□□ 1.66
XRCC3-218ENST00000557439 ARID3CA6NKF2 412 aa25.38■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 SAMD9Q5K651 1589 aa25.37■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.37■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 NCOA2Q15596 1464 aa25.35■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.34■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 21.3
XRCC3-218ENST00000557439 GRIN2BQ13224 1484 aa25.33■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
XRCC3-218ENST00000557439 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.3■■□□□ 1.64
XRCC3-218ENST00000557439 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.28■■□□□ 1.64
XRCC3-218ENST00000557439 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.28■■□□□ 1.64
XRCC3-218ENST00000557439 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.27■■□□□ 1.64
XRCC3-218ENST00000557439 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.26■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 HFM1A2PYH4 1435 aa25.25■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 TONSLQ96HA7 1378 aa25.25■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 NAIPQ13075 1403 aa25.24■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.21■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 UACAQ9BZF9 1416 aa25.2■■□□□ 1.63
XRCC3-218ENST00000557439 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.18■■□□□ 1.62
XRCC3-218ENST00000557439 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.16■■□□□ 1.62
XRCC3-218ENST00000557439 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
XRCC3-218ENST00000557439 PBRM1Q86U86 1689 aa25.15■■□□□ 1.62
XRCC3-218ENST00000557439 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
XRCC3-218ENST00000557439 TRIM52Q96A61 297 aa25.12■■□□□ 1.61
XRCC3-218ENST00000557439 BCANQ96GW7 911 aa25.1■■□□□ 1.61
XRCC3-218ENST00000557439 IQGAP2Q13576 1575 aa25.1■■□□□ 1.61
XRCC3-218ENST00000557439 ARHGEF11O15085 1522 aa25.09■■□□□ 1.61
XRCC3-218ENST00000557439 KDM6BO15054 1643 aa25.09■■□□□ 1.61
XRCC3-218ENST00000557439 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
XRCC3-218ENST00000557439 FOXD1Q16676 465 aa25.07■■□□□ 1.6
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
XRCC3-218ENST00000557439 ADAMTS12P58397 1594 aa25.06■■□□□ 1.6
XRCC3-218ENST00000557439 ANP32CO43423 234 aa25.06■■□□□ 1.6
XRCC3-218ENST00000557439 HECW1Q76N89 1606 aa25.05■■□□□ 1.6
XRCC3-218ENST00000557439 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.03■■□□□ 1.6
XRCC3-218ENST00000557439 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
XRCC3-218ENST00000557439 MRC2Q9UBG0 1479 aa25■■□□□ 1.59
XRCC3-218ENST00000557439 WDR62O43379 1518 aa24.98■■□□□ 1.59
XRCC3-218ENST00000557439 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
XRCC3-218ENST00000557439 FKBP8Q14318 412 aa24.98■■□□□ 1.59
XRCC3-218ENST00000557439 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.94■■□□□ 1.58
XRCC3-218ENST00000557439 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.93■■□□□ 1.58
XRCC3-218ENST00000557439 CCER2I3L3R5 266 aa24.93■■□□□ 1.58
XRCC3-218ENST00000557439 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
XRCC3-218ENST00000557439 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.89■■□□□ 1.57
XRCC3-218ENST00000557439 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.88■■□□□ 1.57
XRCC3-218ENST00000557439 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.88■■□□□ 1.57
XRCC3-218ENST00000557439 DISP1Q96F81 1524 aa24.88■■□□□ 1.57
XRCC3-218ENST00000557439 MIA2Q96PC5 1412 aa24.86■■□□□ 1.57
XRCC3-218ENST00000557439 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
XRCC3-218ENST00000557439 KIAA0556O60303 1618 aa24.83■■□□□ 1.57
XRCC3-218ENST00000557439 IFT140Q96RY7 1462 aa24.82■■□□□ 1.56
XRCC3-218ENST00000557439 DAPK1P53355 1430 aa24.82■■□□□ 1.56
XRCC3-218ENST00000557439 FBLN2P98095 1184 aa24.82■■□□□ 1.56
XRCC3-218ENST00000557439 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.81■■□□□ 1.56
XRCC3-218ENST00000557439 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
XRCC3-218ENST00000557439 ABCC5O15440 1437 aa24.8■■□□□ 1.56
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