RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555837.5

CDKN3-208, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

TSL 2

Gene CDKN3, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-208ENST00000555837 JPH4Q96JJ6 628 aa38.27■■■■□ 3.72
CDKN3-208ENST00000555837 SHROOM2Q13796 1616 aa38.27■■■■□ 3.72
CDKN3-208ENST00000555837 ARAP1Q96P48 1450 aa38.26■■■■□ 3.72
CDKN3-208ENST00000555837 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.2■■■■□ 3.71
CDKN3-208ENST00000555837 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
CDKN3-208ENST00000555837 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.13■■■■□ 3.69
CDKN3-208ENST00000555837 PRXQ9BXM0 1461 aa38.08■■■■□ 3.69
CDKN3-208ENST00000555837 IQGAP2Q13576 1575 aa38.03■■■■□ 3.68
CDKN3-208ENST00000555837 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38■■■■□ 3.67
CDKN3-208ENST00000555837 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.98■■■■□ 3.67
CDKN3-208ENST00000555837 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.86■■■■□ 3.65
CDKN3-208ENST00000555837 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
CDKN3-208ENST00000555837 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.82■■■■□ 3.64
CDKN3-208ENST00000555837 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.79■■■■□ 3.64
CDKN3-208ENST00000555837 GOLGA3Q08378 1498 aa37.77■■■■□ 3.64
CDKN3-208ENST00000555837 PTPRGP23470 1445 aa37.76■■■■□ 3.63
CDKN3-208ENST00000555837 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.72■■■■□ 3.63
CDKN3-208ENST00000555837 KIF21BO75037 1637 aa37.72■■■■□ 3.63
CDKN3-208ENST00000555837 DISP1Q96F81 1524 aa37.67■■■■□ 3.62
CDKN3-208ENST00000555837 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
CDKN3-208ENST00000555837 KIAA0556O60303 1618 aa37.61■■■■□ 3.61
CDKN3-208ENST00000555837 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
CDKN3-208ENST00000555837 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CDKN3-208ENST00000555837 UACAQ9BZF9 1416 aa37.49■■■■□ 3.59
CDKN3-208ENST00000555837 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.47■■■■□ 3.59
CDKN3-208ENST00000555837 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.46■■■■□ 3.59
CDKN3-208ENST00000555837 ABCC2Q92887 1545 aa37.39■■■■□ 3.58
CDKN3-208ENST00000555837 MAPKBP1O60336 1514 aa37.38■■■■□ 3.57
CDKN3-208ENST00000555837 SAMD9Q5K651 1589 aa37.34■■■■□ 3.57
CDKN3-208ENST00000555837 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.32■■■■□ 3.57
CDKN3-208ENST00000555837 P3H3Q8IVL6 736 aa37.28■■■■□ 3.56
CDKN3-208ENST00000555837 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
CDKN3-208ENST00000555837 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.26■■■■□ 3.56
CDKN3-208ENST00000555837 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.24■■■■□ 3.55
CDKN3-208ENST00000555837 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.21■■■■□ 3.55
CDKN3-208ENST00000555837 ABCA8O94911 1581 aa37.2■■■■□ 3.55
CDKN3-208ENST00000555837 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.2■■■■□ 3.54
CDKN3-208ENST00000555837 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.15■■■■□ 3.54
CDKN3-208ENST00000555837 ASXL2Q76L83 1435 aa37.12■■■■□ 3.53
CDKN3-208ENST00000555837 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.1■■■■□ 3.53
CDKN3-208ENST00000555837 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
CDKN3-208ENST00000555837 DIP2BQ9P265 1576 aa37.06■■■■□ 3.52
CDKN3-208ENST00000555837 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.05■■■■□ 3.52
CDKN3-208ENST00000555837 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.04■■■■□ 3.52
CDKN3-208ENST00000555837 FMN1Q68DA7 1419 aa37.03■■■■□ 3.52
CDKN3-208ENST00000555837 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.96■■■■□ 3.51
CDKN3-208ENST00000555837 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.96■■■■□ 3.51
CDKN3-208ENST00000555837 GLI2P10070 1586 aa36.95■■■■□ 3.51
CDKN3-208ENST00000555837 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
CDKN3-208ENST00000555837 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
CDKN3-208ENST00000555837 ATP10BO94823 1461 aa36.91■■■■□ 3.5
CDKN3-208ENST00000555837 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
CDKN3-208ENST00000555837 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
CDKN3-208ENST00000555837 CLIP1P30622 1438 aa36.84■■■■□ 3.49
CDKN3-208ENST00000555837 ARID3CA6NKF2 412 aa36.82■■■■□ 3.48
CDKN3-208ENST00000555837 KCNH8Q96L42 1107 aa36.79■■■■□ 3.48
CDKN3-208ENST00000555837 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.78■■■■□ 3.48
CDKN3-208ENST00000555837 HECW1Q76N89 1606 aa36.77■■■■□ 3.48
CDKN3-208ENST00000555837 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
CDKN3-208ENST00000555837 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CDKN3-208ENST00000555837 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.74■■■■□ 3.47
CDKN3-208ENST00000555837 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.7■■■■□ 3.47
CDKN3-208ENST00000555837 TSPOAP1O95153 1857 aa36.7■■■■□ 3.47
CDKN3-208ENST00000555837 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.67■■■■□ 3.46
CDKN3-208ENST00000555837 CD109Q6YHK3 1445 aa36.66■■■■□ 3.46
CDKN3-208ENST00000555837 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.63■■■■□ 3.45
CDKN3-208ENST00000555837 CEP162Q5TB80 1403 aa36.62■■■■□ 3.45
CDKN3-208ENST00000555837 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.58■■■■□ 3.45
CDKN3-208ENST00000555837 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.58■■■■□ 3.45
CDKN3-208ENST00000555837 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.56■■■■□ 3.44
CDKN3-208ENST00000555837 KDM6BO15054 1643 aa36.56■■■■□ 3.44
CDKN3-208ENST00000555837 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.55■■■■□ 3.44
CDKN3-208ENST00000555837 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.54■■■■□ 3.44
CDKN3-208ENST00000555837 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
CDKN3-208ENST00000555837 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
CDKN3-208ENST00000555837 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.5■■■■□ 3.43
CDKN3-208ENST00000555837 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
CDKN3-208ENST00000555837 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CDKN3-208ENST00000555837 NEO1Q92859 1461 aa36.35■■■■□ 3.41
CDKN3-208ENST00000555837 KIF14Q15058 1648 aa36.34■■■■□ 3.41
CDKN3-208ENST00000555837 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
CDKN3-208ENST00000555837 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.29■■■■□ 3.4
CDKN3-208ENST00000555837 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.29■■■■□ 3.4
CDKN3-208ENST00000555837 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.27■■■■□ 3.4
CDKN3-208ENST00000555837 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.24■■■■□ 3.39
CDKN3-208ENST00000555837 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.23■■■■□ 3.39
CDKN3-208ENST00000555837 PLCH2O75038 1416 aa36.22■■■■□ 3.39
CDKN3-208ENST00000555837 FANCAO15360 1455 aa36.21■■■■□ 3.39
CDKN3-208ENST00000555837 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.19■■■■□ 3.38
CDKN3-208ENST00000555837 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.18■■■■□ 3.38
CDKN3-208ENST00000555837 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CDKN3-208ENST00000555837 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.17■■■■□ 3.38
CDKN3-208ENST00000555837 AKNAQ7Z591 1439 aa36.15■■■■□ 3.38
CDKN3-208ENST00000555837 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
CDKN3-208ENST00000555837 APLP2Q06481 763 aa36.06■■■■□ 3.36
CDKN3-208ENST00000555837 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.05■■■■□ 3.36
CDKN3-208ENST00000555837 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.05■■■■□ 3.36
CDKN3-208ENST00000555837 ADGRL1O94910 1474 aa36.01■■■■□ 3.36
CDKN3-208ENST00000555837 MAP3K1Q13233 1512 aa36■■■■□ 3.35
CDKN3-208ENST00000555837 RAPGEF3O95398 923 aa35.99■■■■□ 3.35
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