RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.15■■□□□ 1.94
RPS6KL1-209ENST00000555009 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.06■■□□□ 1.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYT1Q01538 1121 aa27.04■■□□□ 1.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 WDR97A6NE52 1622 aa27.02■■□□□ 1.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.01■■□□□ 1.92
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.95■■□□□ 1.9
RPS6KL1-209ENST00000555009 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RPS6KL1-209ENST00000555009 CUL7Q14999 1698 aa26.93■■□□□ 1.9
RPS6KL1-209ENST00000555009 P3H3Q8IVL6 736 aa26.9■■□□□ 1.9
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.9■■□□□ 1.9
RPS6KL1-209ENST00000555009 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.84■■□□□ 1.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.83■■□□□ 1.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 TIAM1Q13009 1591 aa26.83■■□□□ 1.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 ITGAEP38570 1179 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.81■■□□□ 1.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.76■■□□□ 1.87
RPS6KL1-209ENST00000555009 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
RPS6KL1-209ENST00000555009 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.74■■□□□ 1.87
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAP3K1Q13233 1512 aa26.73■■□□□ 1.87
RPS6KL1-209ENST00000555009 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.71■■□□□ 1.87
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.71■■□□□ 1.87
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAPKBP1O60336 1514 aa26.7■■□□□ 1.87
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
RPS6KL1-209ENST00000555009 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.68■■□□□ 1.86
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.66■■□□□ 1.86
RPS6KL1-209ENST00000555009 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
RPS6KL1-209ENST00000555009 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.63■■□□□ 1.85
RPS6KL1-209ENST00000555009 PBRM1Q86U86 1689 aa26.63■■□□□ 1.85
RPS6KL1-209ENST00000555009 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.62■■□□□ 1.85
RPS6KL1-209ENST00000555009 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.62■■□□□ 1.85
RPS6KL1-209ENST00000555009 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.59■■□□□ 1.85
RPS6KL1-209ENST00000555009 SAMD9Q5K651 1589 aa26.58■■□□□ 1.85
RPS6KL1-209ENST00000555009 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KL1-209ENST00000555009 KCNH8Q96L42 1107 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KL1-209ENST00000555009 FMN1Q68DA7 1419 aa26.53■■□□□ 1.84
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.5■■□□□ 1.83
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADAMTS12P58397 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.49■■□□□ 1.83
RPS6KL1-209ENST00000555009 WDR62O43379 1518 aa26.49■■□□□ 1.83
RPS6KL1-209ENST00000555009 GRIN2BQ13224 1484 aa26.43■■□□□ 1.82
RPS6KL1-209ENST00000555009 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
RPS6KL1-209ENST00000555009 IFT140Q96RY7 1462 aa26.42■■□□□ 1.82
RPS6KL1-209ENST00000555009 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.41■■□□□ 1.82
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.39■■□□□ 1.82
RPS6KL1-209ENST00000555009 IQGAP2Q13576 1575 aa26.39■■□□□ 1.81
RPS6KL1-209ENST00000555009 ERCC6Q03468 1493 aa26.38■■□□□ 1.81
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
RPS6KL1-209ENST00000555009 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.34■■□□□ 1.81
RPS6KL1-209ENST00000555009 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
RPS6KL1-209ENST00000555009 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
RPS6KL1-209ENST00000555009 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
RPS6KL1-209ENST00000555009 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.27■■□□□ 1.8
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.26■■□□□ 1.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 NCOA2Q15596 1464 aa26.24■■□□□ 1.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 FKBP8Q14318 412 aa26.22■■□□□ 1.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 BCANQ96GW7 911 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCER2I3L3R5 266 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.2■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.2■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 GRIN2AQ12879 1464 aa26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARID3CA6NKF2 412 aa26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 HECW1Q76N89 1606 aa26.18■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANP32CO43423 234 aa26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PTPRKQ15262 1439 aa26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 TONSLQ96HA7 1378 aa26.14■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 DISP1Q96F81 1524 aa26.14■■□□□ 1.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIAA0556O60303 1618 aa26.12■■□□□ 1.77
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGEF11O15085 1522 aa26.11■■□□□ 1.77
RPS6KL1-209ENST00000555009 HFM1A2PYH4 1435 aa26.1■■□□□ 1.77
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRIM52Q96A61 297 aa26.1■■□□□ 1.77
RPS6KL1-209ENST00000555009 UACAQ9BZF9 1416 aa26.09■■□□□ 1.77
RPS6KL1-209ENST00000555009 NEFLP07196 543 aa26.08■■□□□ 1.77
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
RPS6KL1-209ENST00000555009 CEP170Q5SW79 1584 aa26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1-209ENST00000555009 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1-209ENST00000555009 FBLN2P98095 1184 aa26.05■■□□□ 1.76
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
RPS6KL1-209ENST00000555009 SYNJ2O15056 1496 aa26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1-209ENST00000555009 NAIPQ13075 1403 aa26.01■■□□□ 1.75
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
RPS6KL1-209ENST00000555009 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.95■■□□□ 1.75
RPS6KL1-209ENST00000555009 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RPS6KL1-209ENST00000555009 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.92■■□□□ 1.74
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.91■■□□□ 1.74
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUP160Q12769 1436 aa25.89■■□□□ 1.74
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.89■■□□□ 1.74
RPS6KL1-209ENST00000555009 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms