RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
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PTPRR-209ENST00000549308 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRR-209ENST00000549308 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRR-209ENST00000549308 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRR-209ENST00000549308 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.1■□□□□ 0.49
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