RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547352.1

HECTD4-204, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 1,203 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-204ENST00000547352 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.44■□□□□ 0.06
HECTD4-204ENST00000547352 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
HECTD4-204ENST00000547352 SYNJ2O15056 1496 aa15.41■□□□□ 0.06
HECTD4-204ENST00000547352 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.4■□□□□ 0.06
HECTD4-204ENST00000547352 GRIN2BQ13224 1484 aa15.4■□□□□ 0.06
HECTD4-204ENST00000547352 WDR97A6NE52 1622 aa15.39■□□□□ 0.05
HECTD4-204ENST00000547352 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
HECTD4-204ENST00000547352 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.38■□□□□ 0.05
HECTD4-204ENST00000547352 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HECTD4-204ENST00000547352 CUX1P39880 1505 aa15.34■□□□□ 0.05
HECTD4-204ENST00000547352 PBRM1Q86U86 1689 aa15.33■□□□□ 0.04
HECTD4-204ENST00000547352 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.32■□□□□ 0.04
HECTD4-204ENST00000547352 CEP170Q5SW79 1584 aa15.28■□□□□ 0.04
HECTD4-204ENST00000547352 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-204ENST00000547352 GRIN2AQ12879 1464 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-204ENST00000547352 SHROOM2Q13796 1616 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-204ENST00000547352 NUP160Q12769 1436 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-204ENST00000547352 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-204ENST00000547352 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HECTD4-204ENST00000547352 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.17■□□□□ 0.02
HECTD4-204ENST00000547352 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.15■□□□□ 0.02
HECTD4-204ENST00000547352 ADAMTS12P58397 1594 aa15.14■□□□□ 0.01
HECTD4-204ENST00000547352 DIP2BQ9P265 1576 aa15.11■□□□□ 0.01
HECTD4-204ENST00000547352 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
HECTD4-204ENST00000547352 KDM6BO15054 1643 aa15.1■□□□□ 0.01
HECTD4-204ENST00000547352 TSPOAP1O95153 1857 aa15.08■□□□□ 0
HECTD4-204ENST00000547352 MAPKBP1O60336 1514 aa15.07■□□□□ 0
HECTD4-204ENST00000547352 JPH4Q96JJ6 628 aa15.06■□□□□ 0
HECTD4-204ENST00000547352 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.05■□□□□ -0
HECTD4-204ENST00000547352 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.04■□□□□ -0
HECTD4-204ENST00000547352 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
HECTD4-204ENST00000547352 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
HECTD4-204ENST00000547352 SLC4A2P04920 1241 aa14.98□□□□□ -0.01
HECTD4-204ENST00000547352 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
HECTD4-204ENST00000547352 ADGRL1O94910 1474 aa14.97□□□□□ -0.01
HECTD4-204ENST00000547352 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.97□□□□□ -0.01
HECTD4-204ENST00000547352 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.96□□□□□ -0.02
HECTD4-204ENST00000547352 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.94□□□□□ -0.02
HECTD4-204ENST00000547352 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HECTD4-204ENST00000547352 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HECTD4-204ENST00000547352 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.9□□□□□ -0.02
HECTD4-204ENST00000547352 TOP2BQ02880 1626 aa14.89□□□□□ -0.03
HECTD4-204ENST00000547352 FBXO41Q8TF61 875 aa14.8□□□□□ -0.04
HECTD4-204ENST00000547352 ASXL2Q76L83 1435 aa14.8□□□□□ -0.04
HECTD4-204ENST00000547352 GLI2P10070 1586 aa14.8□□□□□ -0.04
HECTD4-204ENST00000547352 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.79□□□□□ -0.04
HECTD4-204ENST00000547352 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HECTD4-204ENST00000547352 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
HECTD4-204ENST00000547352 CAPN15O75808 1086 aa14.77□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 ABCC2Q92887 1545 aa14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 PTPRGP23470 1445 aa14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 CUL7Q14999 1698 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HECTD4-204ENST00000547352 IGF1RP08069 1367 aa14.71□□□□□ -0.06
HECTD4-204ENST00000547352 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
HECTD4-204ENST00000547352 APLP2Q06481 763 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-204ENST00000547352 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-204ENST00000547352 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-204ENST00000547352 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.64□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 UACAQ9BZF9 1416 aa14.63□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.63□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 DSG3P32926 999 aa14.61□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.6□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 DISP1Q96F81 1524 aa14.6□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 KIF21BO75037 1637 aa14.59□□□□□ -0.07
HECTD4-204ENST00000547352 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.57□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 IQGAP2Q13576 1575 aa14.56□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 ILDR2Q71H61 639 aa14.55□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.54□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 KIF27Q86VH2 1401 aa14.54□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 PTPRMP28827 1452 aa14.53□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.53□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.52□□□□□ -0.08
HECTD4-204ENST00000547352 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.52□□□□□ -0.09
HECTD4-204ENST00000547352 CD109Q6YHK3 1445 aa14.51□□□□□ -0.09
HECTD4-204ENST00000547352 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.51□□□□□ -0.09
HECTD4-204ENST00000547352 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.49□□□□□ -0.09
HECTD4-204ENST00000547352 KCNH8Q96L42 1107 aa14.48□□□□□ -0.09
HECTD4-204ENST00000547352 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HECTD4-204ENST00000547352 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.46□□□□□ -0.09
HECTD4-204ENST00000547352 KIAA0556O60303 1618 aa14.45□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 SOCS7O14512 581 aa14.45□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.44□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 ABCB7O75027 752 aa14.43□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 MADDQ8WXG6 1647 aa14.41□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.41□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 HSPA2P54652 639 aa14.41□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 CERKQ8TCT0 537 aa14.4□□□□□ -0.1
HECTD4-204ENST00000547352 RAPGEF3O95398 923 aa14.39□□□□□ -0.11
HECTD4-204ENST00000547352 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.38□□□□□ -0.11
HECTD4-204ENST00000547352 ABCA8O94911 1581 aa14.38□□□□□ -0.11
HECTD4-204ENST00000547352 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms