RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 TIAM1Q13009 1591 aa22.47■■□□□ 1.19
CNN3-207ENST00000545882 MAP3K1Q13233 1512 aa22.45■■□□□ 1.18
CNN3-207ENST00000545882 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.43■■□□□ 1.18
CNN3-207ENST00000545882 WDR97A6NE52 1622 aa22.42■■□□□ 1.18
CNN3-207ENST00000545882 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CNN3-207ENST00000545882 CUL7Q14999 1698 aa22.38■■□□□ 1.17
CNN3-207ENST00000545882 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.34■■□□□ 1.17
CNN3-207ENST00000545882 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.34■■□□□ 1.17
CNN3-207ENST00000545882 MAPKBP1O60336 1514 aa22.32■■□□□ 1.16
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CNN3-207ENST00000545882 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.31■■□□□ 1.16
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CNN3-207ENST00000545882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.3■■□□□ 1.16
CNN3-207ENST00000545882 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CNN3-207ENST00000545882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.28■■□□□ 1.16
CNN3-207ENST00000545882 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.27■■□□□ 1.16
CNN3-207ENST00000545882 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.27■■□□□ 1.16
CNN3-207ENST00000545882 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.25■■□□□ 1.15
CNN3-207ENST00000545882 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.24■■□□□ 1.15
CNN3-207ENST00000545882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.24■■□□□ 1.15
CNN3-207ENST00000545882 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.22■■□□□ 1.15
CNN3-207ENST00000545882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CNN3-207ENST00000545882 P3H3Q8IVL6 736 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-207ENST00000545882 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-207ENST00000545882 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.16■■□□□ 1.14
CNN3-207ENST00000545882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CNN3-207ENST00000545882 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.14■■□□□ 1.13
CNN3-207ENST00000545882 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CNN3-207ENST00000545882 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.12■■□□□ 1.13
CNN3-207ENST00000545882 SAMD9Q5K651 1589 aa22.1■■□□□ 1.13
CNN3-207ENST00000545882 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CNN3-207ENST00000545882 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-207ENST00000545882 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-207ENST00000545882 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
CNN3-207ENST00000545882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-207ENST00000545882 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CNN3-207ENST00000545882 PBRM1Q86U86 1689 aa22.03■■□□□ 1.12
CNN3-207ENST00000545882 FMN1Q68DA7 1419 aa22.02■■□□□ 1.12
CNN3-207ENST00000545882 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.01■■□□□ 1.11
CNN3-207ENST00000545882 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-207ENST00000545882 KCNH8Q96L42 1107 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 ADAMTS12P58397 1594 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 GRIN2BQ13224 1484 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 WDR62O43379 1518 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 PTPRKQ15262 1439 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-207ENST00000545882 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CNN3-207ENST00000545882 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.87■■□□□ 1.09
CNN3-207ENST00000545882 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.86■■□□□ 1.09
CNN3-207ENST00000545882 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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CNN3-207ENST00000545882 IFT140Q96RY7 1462 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-207ENST00000545882 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-207ENST00000545882 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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CNN3-207ENST00000545882 NCOA2Q15596 1464 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-207ENST00000545882 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.8■■□□□ 1.08
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CNN3-207ENST00000545882 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-207ENST00000545882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CNN3-207ENST00000545882 ARHGEF11O15085 1522 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-207ENST00000545882 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-207ENST00000545882 NAIPQ13075 1403 aa21.78■■□□□ 1.08
CNN3-207ENST00000545882 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CNN3-207ENST00000545882 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.77■■□□□ 1.08
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CNN3-207ENST00000545882 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.73■■□□□ 1.07
CNN3-207ENST00000545882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CNN3-207ENST00000545882 TONSLQ96HA7 1378 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-207ENST00000545882 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-207ENST00000545882 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CNN3-207ENST00000545882 CCER2I3L3R5 266 aa21.67■■□□□ 1.06
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CNN3-207ENST00000545882 GRIN2AQ12879 1464 aa21.64■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 KIAA0556O60303 1618 aa21.63■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 KDM6BO15054 1643 aa21.62■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 DISP1Q96F81 1524 aa21.62■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 ERCC6Q03468 1493 aa21.61■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 ANP32CO43423 234 aa21.6■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.6■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CNN3-207ENST00000545882 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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CNN3-207ENST00000545882 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.53■■□□□ 1.04
CNN3-207ENST00000545882 FKBP8Q14318 412 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-207ENST00000545882 MIA2Q96PC5 1412 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-207ENST00000545882 CEP170Q5SW79 1584 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-207ENST00000545882 SYNJ2O15056 1496 aa21.52■■□□□ 1.03
CNN3-207ENST00000545882 TRIM52Q96A61 297 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-207ENST00000545882 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-207ENST00000545882 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CNN3-207ENST00000545882 BCANQ96GW7 911 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-207ENST00000545882 NUP160Q12769 1436 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-207ENST00000545882 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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