RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, human

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STIP1-208	ENST00000540501	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.78	■■■■■ 4.28
STIP1-208	ENST00000540501	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.77	■■■■■ 4.28
STIP1-208	ENST00000540501	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.7	■■■■■ 4.27
STIP1-208	ENST00000540501	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.69	■■■■■ 4.26
STIP1-208	ENST00000540501	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.65	■■■■■ 4.26
STIP1-208	ENST00000540501	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.63	■■■■■ 4.25
STIP1-208	ENST00000540501	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.59	■■■■■ 4.25
STIP1-208	ENST00000540501	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.53	■■■■■ 4.24
STIP1-208	ENST00000540501	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.49	■■■■■ 4.23
STIP1-208	ENST00000540501	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.46	■■■■■ 4.23
STIP1-208	ENST00000540501	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.35	■■■■■ 4.21
STIP1-208	ENST00000540501	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.33	■■■■■ 4.21
STIP1-208	ENST00000540501	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.3	■■■■■ 4.2
STIP1-208	ENST00000540501	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.25	■■■■■ 4.19
STIP1-208	ENST00000540501	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.23	■■■■■ 4.19
STIP1-208	ENST00000540501	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.23	■■■■■ 4.19
STIP1-208	ENST00000540501	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.22	■■■■■ 4.19
STIP1-208	ENST00000540501	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.22	■■■■■ 4.19
STIP1-208	ENST00000540501	CLIP1	P30622	1438 aa		41.21	■■■■■ 4.19
STIP1-208	ENST00000540501	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.15	■■■■■ 4.18
STIP1-208	ENST00000540501	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.13	■■■■■ 4.17
STIP1-208	ENST00000540501	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.12	■■■■■ 4.17
STIP1-208	ENST00000540501	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.12	■■■■■ 4.17
STIP1-208	ENST00000540501	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.12	■■■■■ 4.17
STIP1-208	ENST00000540501	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.09	■■■■■ 4.17
STIP1-208	ENST00000540501	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.04	■■■■■ 4.16
STIP1-208	ENST00000540501	PTPRG	P23470	1445 aa		41	■■■■■ 4.15
STIP1-208	ENST00000540501	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.99	■■■■■ 4.15
STIP1-208	ENST00000540501	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.93	■■■■■ 4.14
STIP1-208	ENST00000540501	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.9	■■■■■ 4.14
STIP1-208	ENST00000540501	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
STIP1-208	ENST00000540501	UACA	Q9BZF9	1416 aa		40.75	■■■■■ 4.11
STIP1-208	ENST00000540501	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.73	■■■■■ 4.11
STIP1-208	ENST00000540501	ABCA8	O94911	1581 aa		40.71	■■■■■ 4.11
STIP1-208	ENST00000540501	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.71	■■■■■ 4.11
STIP1-208	ENST00000540501	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.69	■■■■■ 4.1
STIP1-208	ENST00000540501	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		40.69	■■■■■ 4.1
STIP1-208	ENST00000540501	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		40.67	■■■■■ 4.1
STIP1-208	ENST00000540501	ABCC2	Q92887	1545 aa		40.65	■■■■■ 4.1
STIP1-208	ENST00000540501	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.65	■■■■■ 4.1
STIP1-208	ENST00000540501	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.61	■■■■■ 4.09
STIP1-208	ENST00000540501	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.59	■■■■■ 4.09
STIP1-208	ENST00000540501	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.08
STIP1-208	ENST00000540501	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		40.54	■■■■■ 4.08
STIP1-208	ENST00000540501	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
STIP1-208	ENST00000540501	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	40.49	■■■■■ 4.07
STIP1-208	ENST00000540501	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
STIP1-208	ENST00000540501	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		40.46	■■■■■ 4.07
STIP1-208	ENST00000540501	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.45	■■■■■ 4.07
STIP1-208	ENST00000540501	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
STIP1-208	ENST00000540501	ATP10B	O94823	1461 aa		40.38	■■■■■ 4.05
STIP1-208	ENST00000540501	APLP2	Q06481	763 aa		40.37	■■■■■ 4.05
STIP1-208	ENST00000540501	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
STIP1-208	ENST00000540501	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
STIP1-208	ENST00000540501	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
STIP1-208	ENST00000540501	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
STIP1-208	ENST00000540501	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.32	■■■■■ 4.04
STIP1-208	ENST00000540501	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.3	■■■■■ 4.04
STIP1-208	ENST00000540501	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
STIP1-208	ENST00000540501	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.27	■■■■■ 4.04
STIP1-208	ENST00000540501	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.03
STIP1-208	ENST00000540501	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.21	■■■■■ 4.03
STIP1-208	ENST00000540501	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.21	■■■■■ 4.03
STIP1-208	ENST00000540501	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.21	■■■■■ 4.03
STIP1-208	ENST00000540501	MAPKBP1	O60336	1514 aa		40.21	■■■■■ 4.03
STIP1-208	ENST00000540501	ASXL2	Q76L83	1435 aa		40.12	■■■■■ 4.01
STIP1-208	ENST00000540501	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		40.09	■■■■■ 4.01
STIP1-208	ENST00000540501	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.08	■■■■■ 4.01
STIP1-208	ENST00000540501	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
STIP1-208	ENST00000540501	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.04	■■■■■ 4
STIP1-208	ENST00000540501	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.03	■■■■■ 4
STIP1-208	ENST00000540501	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		39.96	■■■■□ 3.99
STIP1-208	ENST00000540501	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	39.92	■■■■□ 3.98
STIP1-208	ENST00000540501	KIF14	Q15058	1648 aa		39.91	■■■■□ 3.98
STIP1-208	ENST00000540501	KCNH8	Q96L42	1107 aa		39.91	■■■■□ 3.98
STIP1-208	ENST00000540501	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		39.88	■■■■□ 3.98
STIP1-208	ENST00000540501	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	39.88	■■■■□ 3.98
STIP1-208	ENST00000540501	GLI2	P10070	1586 aa		39.84	■■■■□ 3.97
STIP1-208	ENST00000540501	DIP2B	Q9P265	1576 aa		39.81	■■■■□ 3.96
STIP1-208	ENST00000540501	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		39.78	■■■■□ 3.96
STIP1-208	ENST00000540501	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		39.76	■■■■□ 3.96
STIP1-208	ENST00000540501	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	39.75	■■■■□ 3.95
STIP1-208	ENST00000540501	NCOA2	Q15596	1464 aa		39.75	■■■■□ 3.95
STIP1-208	ENST00000540501	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		39.7	■■■■□ 3.95
STIP1-208	ENST00000540501	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		39.68	■■■■□ 3.94
STIP1-208	ENST00000540501	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		39.67	■■■■□ 3.94
STIP1-208	ENST00000540501	CD109	Q6YHK3	1445 aa		39.65	■■■■□ 3.94
STIP1-208	ENST00000540501	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	39.64	■■■■□ 3.94
STIP1-208	ENST00000540501	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		39.64	■■■■□ 3.94
STIP1-208	ENST00000540501	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		39.64	■■■■□ 3.94
STIP1-208	ENST00000540501	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		39.62	■■■■□ 3.93
STIP1-208	ENST00000540501	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		39.6	■■■■□ 3.93
STIP1-208	ENST00000540501	PLCH2	O75038	1416 aa		39.59	■■■■□ 3.93
STIP1-208	ENST00000540501	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		39.58	■■■■□ 3.93
STIP1-208	ENST00000540501	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	39.58	■■■■□ 3.93
STIP1-208	ENST00000540501	PREX2	Q70Z35	1606 aa		39.55	■■■■□ 3.92
STIP1-208	ENST00000540501	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		39.55	■■■■□ 3.92
STIP1-208	ENST00000540501	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		39.51	■■■■□ 3.92
STIP1-208	ENST00000540501	MIA2	Q96PC5	1412 aa		39.5	■■■■□ 3.91
STIP1-208	ENST00000540501	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	39.5	■■■■□ 3.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms