RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535551.1

PGA3-202, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,449 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-202ENST00000535551 SHROOM2Q13796 1616 aa16.93■□□□□ 0.3
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PGA3-202ENST00000535551 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.9■□□□□ 0.3
PGA3-202ENST00000535551 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PGA3-202ENST00000535551 EEA1Q15075 1411 aa16.86■□□□□ 0.29
PGA3-202ENST00000535551 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.85■□□□□ 0.29
PGA3-202ENST00000535551 ARAP1Q96P48 1450 aa16.85■□□□□ 0.29
PGA3-202ENST00000535551 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.84■□□□□ 0.29
PGA3-202ENST00000535551 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PGA3-202ENST00000535551 PRXQ9BXM0 1461 aa16.8■□□□□ 0.28
PGA3-202ENST00000535551 IQGAP2Q13576 1575 aa16.77■□□□□ 0.27
PGA3-202ENST00000535551 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
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PGA3-202ENST00000535551 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PGA3-202ENST00000535551 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.75■□□□□ 0.27
PGA3-202ENST00000535551 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.74■□□□□ 0.27
PGA3-202ENST00000535551 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.73■□□□□ 0.27
PGA3-202ENST00000535551 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.7■□□□□ 0.26
PGA3-202ENST00000535551 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.69■□□□□ 0.26
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PGA3-202ENST00000535551 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.68■□□□□ 0.26
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PGA3-202ENST00000535551 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PGA3-202ENST00000535551 DISP1Q96F81 1524 aa16.61■□□□□ 0.25
PGA3-202ENST00000535551 GOLGA3Q08378 1498 aa16.61■□□□□ 0.25
PGA3-202ENST00000535551 KIAA0556O60303 1618 aa16.6■□□□□ 0.25
PGA3-202ENST00000535551 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.59■□□□□ 0.25
PGA3-202ENST00000535551 PTPRGP23470 1445 aa16.56■□□□□ 0.24
PGA3-202ENST00000535551 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.53■□□□□ 0.24
PGA3-202ENST00000535551 SAMD9Q5K651 1589 aa16.52■□□□□ 0.24
PGA3-202ENST00000535551 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.52■□□□□ 0.24
PGA3-202ENST00000535551 MAPKBP1O60336 1514 aa16.5■□□□□ 0.23
PGA3-202ENST00000535551 ABCC2Q92887 1545 aa16.48■□□□□ 0.23
PGA3-202ENST00000535551 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.47■□□□□ 0.23
PGA3-202ENST00000535551 UACAQ9BZF9 1416 aa16.47■□□□□ 0.23
PGA3-202ENST00000535551 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PGA3-202ENST00000535551 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
PGA3-202ENST00000535551 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.44■□□□□ 0.22
PGA3-202ENST00000535551 ABCA8O94911 1581 aa16.42■□□□□ 0.22
PGA3-202ENST00000535551 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.42■□□□□ 0.22
PGA3-202ENST00000535551 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PGA3-202ENST00000535551 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PGA3-202ENST00000535551 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.39■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.37■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.37■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 DIP2BQ9P265 1576 aa16.35■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.34■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 P3H3Q8IVL6 736 aa16.34■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.34■□□□□ 0.21
PGA3-202ENST00000535551 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.33■□□□□ 0.2
PGA3-202ENST00000535551 GLI2P10070 1586 aa16.31■□□□□ 0.2
PGA3-202ENST00000535551 ASXL2Q76L83 1435 aa16.31■□□□□ 0.2
PGA3-202ENST00000535551 FMN1Q68DA7 1419 aa16.28■□□□□ 0.2
PGA3-202ENST00000535551 CEP162Q5TB80 1403 aa16.28■□□□□ 0.2
PGA3-202ENST00000535551 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.27■□□□□ 0.2
PGA3-202ENST00000535551 CLIP1P30622 1438 aa16.25■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.23■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.23■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 ATP10BO94823 1461 aa16.23■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 HECW1Q76N89 1606 aa16.22■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.22■□□□□ 0.19
PGA3-202ENST00000535551 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.2■□□□□ 0.18
PGA3-202ENST00000535551 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PGA3-202ENST00000535551 TSPOAP1O95153 1857 aa16.16■□□□□ 0.18
PGA3-202ENST00000535551 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PGA3-202ENST00000535551 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.15■□□□□ 0.18
PGA3-202ENST00000535551 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.14■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 ARID3CA6NKF2 412 aa16.13■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.13■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.13■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.12■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 NEUROD1Q13562 356 aa16.11■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.11■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 KDM6BO15054 1643 aa16.08■□□□□ 0.17
PGA3-202ENST00000535551 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.08■□□□□ 0.16
PGA3-202ENST00000535551 CD109Q6YHK3 1445 aa16.08■□□□□ 0.16
PGA3-202ENST00000535551 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PGA3-202ENST00000535551 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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PGA3-202ENST00000535551 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.05■□□□□ 0.16
PGA3-202ENST00000535551 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.04■□□□□ 0.16
PGA3-202ENST00000535551 KCNH8Q96L42 1107 aa16.03■□□□□ 0.16
PGA3-202ENST00000535551 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.03■□□□□ 0.16
PGA3-202ENST00000535551 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.01■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 KIF14Q15058 1648 aa16.01■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 NEO1Q92859 1461 aa16.01■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.99■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.97■□□□□ 0.15
PGA3-202ENST00000535551 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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