RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.16■■■□□ 2.9
TSTA3-215ENST00000532308 CEP170Q5SW79 1584 aa33.15■■■□□ 2.9
TSTA3-215ENST00000532308 OSCARQ8IYS5 282 aa33.1■■■□□ 2.89
TSTA3-215ENST00000532308 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.09■■■□□ 2.89
TSTA3-215ENST00000532308 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.07■■■□□ 2.89
TSTA3-215ENST00000532308 IQGAP2Q13576 1575 aa33.01■■■□□ 2.88
TSTA3-215ENST00000532308 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.98■■■□□ 2.87
TSTA3-215ENST00000532308 JPH4Q96JJ6 628 aa32.88■■■□□ 2.85
TSTA3-215ENST00000532308 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.85■■■□□ 2.85
TSTA3-215ENST00000532308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
TSTA3-215ENST00000532308 SHROOM2Q13796 1616 aa32.84■■■□□ 2.85
TSTA3-215ENST00000532308 CEP162Q5TB80 1403 aa32.78■■■□□ 2.84
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TSTA3-215ENST00000532308 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.74■■■□□ 2.83
TSTA3-215ENST00000532308 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.73■■■□□ 2.83
TSTA3-215ENST00000532308 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
TSTA3-215ENST00000532308 SAMD9Q5K651 1589 aa32.72■■■□□ 2.83
TSTA3-215ENST00000532308 DISP1Q96F81 1524 aa32.69■■■□□ 2.82
TSTA3-215ENST00000532308 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.67■■■□□ 2.82
TSTA3-215ENST00000532308 KIAA0556O60303 1618 aa32.67■■■□□ 2.82
TSTA3-215ENST00000532308 P3H3Q8IVL6 736 aa32.63■■■□□ 2.81
TSTA3-215ENST00000532308 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.58■■■□□ 2.81
TSTA3-215ENST00000532308 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.55■■■□□ 2.8
TSTA3-215ENST00000532308 ARHGEF11O15085 1522 aa32.51■■■□□ 2.8
TSTA3-215ENST00000532308 ARAP1Q96P48 1450 aa32.51■■■□□ 2.79
TSTA3-215ENST00000532308 PTPRGP23470 1445 aa32.46■■■□□ 2.79
TSTA3-215ENST00000532308 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.45■■■□□ 2.79
TSTA3-215ENST00000532308 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.45■■■□□ 2.79
TSTA3-215ENST00000532308 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.45■■■□□ 2.79
TSTA3-215ENST00000532308 FMN1Q68DA7 1419 aa32.44■■■□□ 2.78
TSTA3-215ENST00000532308 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
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TSTA3-215ENST00000532308 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.28■■■□□ 2.76
TSTA3-215ENST00000532308 ABCA8O94911 1581 aa32.27■■■□□ 2.76
TSTA3-215ENST00000532308 UACAQ9BZF9 1416 aa32.26■■■□□ 2.76
TSTA3-215ENST00000532308 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.26■■■□□ 2.75
TSTA3-215ENST00000532308 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.25■■■□□ 2.75
TSTA3-215ENST00000532308 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
TSTA3-215ENST00000532308 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.23■■■□□ 2.75
TSTA3-215ENST00000532308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
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TSTA3-215ENST00000532308 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.2■■■□□ 2.75
TSTA3-215ENST00000532308 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.18■■■□□ 2.74
TSTA3-215ENST00000532308 ABCC2Q92887 1545 aa32.18■■■□□ 2.74
TSTA3-215ENST00000532308 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.11■■■□□ 2.73
TSTA3-215ENST00000532308 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
TSTA3-215ENST00000532308 APLP2Q06481 763 aa32.08■■■□□ 2.73
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.07■■■□□ 2.72
TSTA3-215ENST00000532308 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.06■■■□□ 2.72
TSTA3-215ENST00000532308 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
TSTA3-215ENST00000532308 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.01■■■□□ 2.72
TSTA3-215ENST00000532308 ARID3CA6NKF2 412 aa32.01■■■□□ 2.71
TSTA3-215ENST00000532308 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.71
TSTA3-215ENST00000532308 ATP10BO94823 1461 aa32.01■■■□□ 2.71
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TSTA3-215ENST00000532308 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
TSTA3-215ENST00000532308 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.96■■■□□ 2.71
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TSTA3-215ENST00000532308 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
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TSTA3-215ENST00000532308 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.81■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.8■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 MAPKBP1O60336 1514 aa31.77■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.77■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 ASXL2Q76L83 1435 aa31.76■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.76■■■□□ 2.68
TSTA3-215ENST00000532308 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.73■■■□□ 2.67
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TSTA3-215ENST00000532308 CD109Q6YHK3 1445 aa31.38■■■□□ 2.61
TSTA3-215ENST00000532308 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.38■■■□□ 2.61
TSTA3-215ENST00000532308 PREX2Q70Z35 1606 aa31.37■■■□□ 2.61
TSTA3-215ENST00000532308 PLCH2O75038 1416 aa31.36■■■□□ 2.61
TSTA3-215ENST00000532308 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.35■■■□□ 2.61
TSTA3-215ENST00000532308 MIA2Q96PC5 1412 aa31.33■■■□□ 2.61
TSTA3-215ENST00000532308 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
TSTA3-215ENST00000532308 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.33■■■□□ 2.61
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