RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PACS1-209ENST00000529757 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.25■■□□□ 1.79
PACS1-209ENST00000529757 ARAP1Q96P48 1450 aa26.21■■□□□ 1.79
PACS1-209ENST00000529757 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.19■■□□□ 1.78
PACS1-209ENST00000529757 FBLN2P98095 1184 aa26.19■■□□□ 1.78
PACS1-209ENST00000529757 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.18■■□□□ 1.78
PACS1-209ENST00000529757 IQGAP2Q13576 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
PACS1-209ENST00000529757 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.15■■□□□ 1.78
PACS1-209ENST00000529757 CEP170Q5SW79 1584 aa26.13■■□□□ 1.77
PACS1-209ENST00000529757 NUP160Q12769 1436 aa26.13■■□□□ 1.77
PACS1-209ENST00000529757 SAMD9Q5K651 1589 aa26.1■■□□□ 1.77
PACS1-209ENST00000529757 CHD1O14646 1710 aa26.08■■□□□ 1.77
PACS1-209ENST00000529757 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.05■■□□□ 1.76
PACS1-209ENST00000529757 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.04■■□□□ 1.76
PACS1-209ENST00000529757 P3H3Q8IVL6 736 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS1-209ENST00000529757 FMN1Q68DA7 1419 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS1-209ENST00000529757 APLP2Q06481 763 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS1-209ENST00000529757 DISP1Q96F81 1524 aa25.91■■□□□ 1.74
PACS1-209ENST00000529757 KIAA0556O60303 1618 aa25.91■■□□□ 1.74
PACS1-209ENST00000529757 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PACS1-209ENST00000529757 JPH4Q96JJ6 628 aa25.9■■□□□ 1.74
PACS1-209ENST00000529757 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PACS1-209ENST00000529757 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.86■■□□□ 1.73
PACS1-209ENST00000529757 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.85■■□□□ 1.73
PACS1-209ENST00000529757 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.84■■□□□ 1.73
PACS1-209ENST00000529757 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PACS1-209ENST00000529757 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.8■■□□□ 1.72
PACS1-209ENST00000529757 SHROOM2Q13796 1616 aa25.79■■□□□ 1.72
PACS1-209ENST00000529757 MAP3K1Q13233 1512 aa25.78■■□□□ 1.72
PACS1-209ENST00000529757 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PACS1-209ENST00000529757 TIAM1Q13009 1591 aa25.75■■□□□ 1.71
PACS1-209ENST00000529757 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PACS1-209ENST00000529757 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PACS1-209ENST00000529757 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.72■■□□□ 1.71
PACS1-209ENST00000529757 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.71■■□□□ 1.71
PACS1-209ENST00000529757 HECW1Q76N89 1606 aa25.69■■□□□ 1.7
PACS1-209ENST00000529757 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PACS1-209ENST00000529757 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.64■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.63■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 OSCARQ8IYS5 282 aa25.63■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.63■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.62■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 PTPRGP23470 1445 aa25.59■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.58■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PACS1-209ENST00000529757 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.58■■□□□ 1.68
PACS1-209ENST00000529757 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PACS1-209ENST00000529757 ABCA8O94911 1581 aa25.54■■□□□ 1.68
PACS1-209ENST00000529757 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PACS1-209ENST00000529757 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.5■■□□□ 1.67
PACS1-209ENST00000529757 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.48■■□□□ 1.67
PACS1-209ENST00000529757 ARID3CA6NKF2 412 aa25.46■■□□□ 1.67
PACS1-209ENST00000529757 UACAQ9BZF9 1416 aa25.44■■□□□ 1.66
PACS1-209ENST00000529757 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.43■■□□□ 1.66
PACS1-209ENST00000529757 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PACS1-209ENST00000529757 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PACS1-209ENST00000529757 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PACS1-209ENST00000529757 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PACS1-209ENST00000529757 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PACS1-209ENST00000529757 ABCC2Q92887 1545 aa25.37■■□□□ 1.65
PACS1-209ENST00000529757 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.37■■□□□ 1.65
PACS1-209ENST00000529757 ATP10BO94823 1461 aa25.37■■□□□ 1.65
PACS1-209ENST00000529757 NCOA2Q15596 1464 aa25.35■■□□□ 1.65
PACS1-209ENST00000529757 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.33■■□□□ 1.65
PACS1-209ENST00000529757 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.31■■□□□ 1.64
PACS1-209ENST00000529757 ARHGEF11O15085 1522 aa25.31■■□□□ 1.64
PACS1-209ENST00000529757 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PACS1-209ENST00000529757 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.25■■□□□ 1.63
PACS1-209ENST00000529757 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.24■■□□□ 1.63
PACS1-209ENST00000529757 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.23■■□□□ 1.63
PACS1-209ENST00000529757 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.22■■□□□ 1.63
PACS1-209ENST00000529757 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.22■■□□□ 1.63
PACS1-209ENST00000529757 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS1-209ENST00000529757 KIF14Q15058 1648 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS1-209ENST00000529757 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
PACS1-209ENST00000529757 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACS1-209ENST00000529757 MIA2Q96PC5 1412 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS1-209ENST00000529757 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.1■■□□□ 1.61
PACS1-209ENST00000529757 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS1-209ENST00000529757 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS1-209ENST00000529757 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS1-209ENST00000529757 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS1-209ENST00000529757 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS1-209ENST00000529757 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
PACS1-209ENST00000529757 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PACS1-209ENST00000529757 ITGAEP38570 1179 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS1-209ENST00000529757 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
PACS1-209ENST00000529757 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25■■□□□ 1.59
PACS1-209ENST00000529757 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25■■□□□ 1.59
PACS1-209ENST00000529757 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PACS1-209ENST00000529757 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
PACS1-209ENST00000529757 KCNH8Q96L42 1107 aa24.97■■□□□ 1.59
PACS1-209ENST00000529757 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.96■■□□□ 1.59
PACS1-209ENST00000529757 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.95■■□□□ 1.58
PACS1-209ENST00000529757 ASXL2Q76L83 1435 aa24.95■■□□□ 1.58
PACS1-209ENST00000529757 PREX2Q70Z35 1606 aa24.94■■□□□ 1.58
PACS1-209ENST00000529757 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.92■■□□□ 1.58
PACS1-209ENST00000529757 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PACS1-209ENST00000529757 PTPRKQ15262 1439 aa24.89■■□□□ 1.58
PACS1-209ENST00000529757 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.89■■□□□ 1.58
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