RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, humanhuman

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FADS3-208ENST00000529404 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.48■■□□□ 1.19
FADS3-208ENST00000529404 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.48■■□□□ 1.19
FADS3-208ENST00000529404 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.47■■□□□ 1.19
FADS3-208ENST00000529404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.46■■□□□ 1.19
FADS3-208ENST00000529404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
FADS3-208ENST00000529404 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.45■■□□□ 1.18
FADS3-208ENST00000529404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.44■■□□□ 1.18
FADS3-208ENST00000529404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.189e-7■■□□□ 14.3
FADS3-208ENST00000529404 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
FADS3-208ENST00000529404 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.4■■□□□ 1.18
FADS3-208ENST00000529404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.39■■□□□ 1.18
FADS3-208ENST00000529404 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.37■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.36■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.36■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 P3H3Q8IVL6 736 aa22.36■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.36■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.35■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
FADS3-208ENST00000529404 MYT1Q01538 1121 aa22.31■■□□□ 1.16
FADS3-208ENST00000529404 FMN1Q68DA7 1419 aa22.3■■□□□ 1.16
FADS3-208ENST00000529404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
FADS3-208ENST00000529404 SAMD9Q5K651 1589 aa22.29■■□□□ 1.16
FADS3-208ENST00000529404 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.28■■□□□ 1.16
FADS3-208ENST00000529404 NEUROD1Q13562 356 aa22.27■■□□□ 1.16
FADS3-208ENST00000529404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.27■■□□□ 1.16
FADS3-208ENST00000529404 ITGAEP38570 1179 aa22.26■■□□□ 1.15
FADS3-208ENST00000529404 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FADS3-208ENST00000529404 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.24■■□□□ 1.15
FADS3-208ENST00000529404 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.154e-9■■■■■ 29.3
FADS3-208ENST00000529404 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FADS3-208ENST00000529404 MAPKBP1O60336 1514 aa22.2■■□□□ 1.14
FADS3-208ENST00000529404 MIER1Q8N108 512 aa22.18■■□□□ 1.14
FADS3-208ENST00000529404 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FADS3-208ENST00000529404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FADS3-208ENST00000529404 GRIN2BQ13224 1484 aa22.16■■□□□ 1.14
FADS3-208ENST00000529404 PBRM1Q86U86 1689 aa22.15■■□□□ 1.14
FADS3-208ENST00000529404 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.14■■□□□ 1.13
FADS3-208ENST00000529404 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.13■■□□□ 1.13
FADS3-208ENST00000529404 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.11■■□□□ 1.13
FADS3-208ENST00000529404 ADAMTS12P58397 1594 aa22.09■■□□□ 1.13
FADS3-208ENST00000529404 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.08■■□□□ 1.12
FADS3-208ENST00000529404 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.04■■□□□ 1.12
FADS3-208ENST00000529404 NCOA2Q15596 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
FADS3-208ENST00000529404 IQGAP2Q13576 1575 aa22.02■■□□□ 1.12
FADS3-208ENST00000529404 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 IFT140Q96RY7 1462 aa22■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 ARHGEF11O15085 1522 aa22■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.99■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 WDR62O43379 1518 aa21.99■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.97■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.96■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 HECW1Q76N89 1606 aa21.96■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 PTPRKQ15262 1439 aa21.96■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.96■■□□□ 1.11
FADS3-208ENST00000529404 HFM1A2PYH4 1435 aa21.95■■□□□ 1.1
FADS3-208ENST00000529404 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FADS3-208ENST00000529404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
FADS3-208ENST00000529404 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.92■■□□□ 1.1
FADS3-208ENST00000529404 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.91■■□□□ 1.1
FADS3-208ENST00000529404 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
FADS3-208ENST00000529404 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
FADS3-208ENST00000529404 NAIPQ13075 1403 aa21.87■■□□□ 1.09
FADS3-208ENST00000529404 UACAQ9BZF9 1416 aa21.86■■□□□ 1.09
FADS3-208ENST00000529404 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.85■■□□□ 1.09
FADS3-208ENST00000529404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 KIAA0556O60303 1618 aa21.81■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 DISP1Q96F81 1524 aa21.8■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 MIA2Q96PC5 1412 aa21.79■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 GRIN2AQ12879 1464 aa21.79■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 AKNAQ7Z591 1439 aa21.77■■□□□ 1.08
FADS3-208ENST00000529404 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.75■■□□□ 1.07
FADS3-208ENST00000529404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
FADS3-208ENST00000529404 ERCC6Q03468 1493 aa21.71■■□□□ 1.07
FADS3-208ENST00000529404 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
FADS3-208ENST00000529404 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.7■■□□□ 1.06
FADS3-208ENST00000529404 TONSLQ96HA7 1378 aa21.69■■□□□ 1.06
FADS3-208ENST00000529404 SYNJ2O15056 1496 aa21.66■■□□□ 1.06
FADS3-208ENST00000529404 CEP170Q5SW79 1584 aa21.65■■□□□ 1.06
FADS3-208ENST00000529404 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.65■■□□□ 1.06
FADS3-208ENST00000529404 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.63■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 KDM6BO15054 1643 aa21.63■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.63■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 ARID3CA6NKF2 412 aa21.61■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 ROCK1Q13464 1354 aa21.6■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 DAPK1P53355 1430 aa21.59■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 NUP160Q12769 1436 aa21.59■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
FADS3-208ENST00000529404 ABCC5O15440 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
FADS3-208ENST00000529404 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
FADS3-208ENST00000529404 TRIM52Q96A61 297 aa21.52■■□□□ 1.04
FADS3-208ENST00000529404 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.52■■□□□ 1.04
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