RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526493.1

UBASH3B-204, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 3

Gene UBASH3B, Length 1,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBASH3B-204ENST00000526493 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.09■□□□□ 0.81
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UBASH3B-204ENST00000526493 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.82■□□□□ 0.76
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UBASH3B-204ENST00000526493 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.81■□□□□ 0.76
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UBASH3B-204ENST00000526493 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.74■□□□□ 0.75
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UBASH3B-204ENST00000526493 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
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UBASH3B-204ENST00000526493 MIA2Q96PC5 1412 aa19.7■□□□□ 0.74
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UBASH3B-204ENST00000526493 HRCP23327 699 aa19.68■□□□□ 0.74
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UBASH3B-204ENST00000526493 ITGAEP38570 1179 aa19.65■□□□□ 0.74
UBASH3B-204ENST00000526493 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.62■□□□□ 0.73
UBASH3B-204ENST00000526493 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.62■□□□□ 0.73
UBASH3B-204ENST00000526493 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.62■□□□□ 0.73
UBASH3B-204ENST00000526493 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.62■□□□□ 0.73
UBASH3B-204ENST00000526493 PREX2Q70Z35 1606 aa19.61■□□□□ 0.73
UBASH3B-204ENST00000526493 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.61■□□□□ 0.73
UBASH3B-204ENST00000526493 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.73
UBASH3B-204ENST00000526493 PTPRKQ15262 1439 aa19.59■□□□□ 0.73
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UBASH3B-204ENST00000526493 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.56■□□□□ 0.72
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