RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525750.1

IRF7-208, Transcript of interferon regulatory factor 7, human

TSL 1 (best)

Gene IRF7, Length 656 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF7-208	ENST00000525750	PRX	Q9BXM0	1461 aa		44.69	■■■■■ 4.74
IRF7-208	ENST00000525750	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.68	■■■■■ 4.74
IRF7-208	ENST00000525750	SHROOM2	Q13796	1616 aa		44.62	■■■■■ 4.73
IRF7-208	ENST00000525750	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.59	■■■■■ 4.73
IRF7-208	ENST00000525750	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	44.48	■■■■■ 4.71
IRF7-208	ENST00000525750	ARAP1	Q96P48	1450 aa		44.46	■■■■■ 4.71
IRF7-208	ENST00000525750	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.44	■■■■■ 4.7
IRF7-208	ENST00000525750	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.41	■■■■■ 4.7
IRF7-208	ENST00000525750	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		44.41	■■■■■ 4.7
IRF7-208	ENST00000525750	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.34	■■■■■ 4.69
IRF7-208	ENST00000525750	KIF21B	O75037	1637 aa		44.3	■■■■■ 4.68
IRF7-208	ENST00000525750	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		44.29	■■■■■ 4.68
IRF7-208	ENST00000525750	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		44.24	■■■■■ 4.67
IRF7-208	ENST00000525750	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		44.21	■■■■■ 4.67
IRF7-208	ENST00000525750	GOLGA3	Q08378	1498 aa		44.07	■■■■■ 4.65
IRF7-208	ENST00000525750	DISP1	Q96F81	1524 aa		44.06	■■■■■ 4.64
IRF7-208	ENST00000525750	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		44.05	■■■■■ 4.64
IRF7-208	ENST00000525750	PTPRG	P23470	1445 aa		43.98	■■■■■ 4.63
IRF7-208	ENST00000525750	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.97	■■■■■ 4.63
IRF7-208	ENST00000525750	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	43.93	■■■■■ 4.62
IRF7-208	ENST00000525750	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.79	■■■■■ 4.6
IRF7-208	ENST00000525750	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.76	■■■■■ 4.6
IRF7-208	ENST00000525750	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.74	■■■■■ 4.59
IRF7-208	ENST00000525750	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.7	■■■■■ 4.59
IRF7-208	ENST00000525750	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.69	■■■■■ 4.58
IRF7-208	ENST00000525750	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.68	■■■■■ 4.58
IRF7-208	ENST00000525750	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.68	■■■■■ 4.58
IRF7-208	ENST00000525750	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.67	■■■■■ 4.58
IRF7-208	ENST00000525750	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	43.62	■■■■■ 4.57
IRF7-208	ENST00000525750	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.62	■■■■■ 4.57
IRF7-208	ENST00000525750	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.58	■■■■■ 4.57
IRF7-208	ENST00000525750	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.49	■■■■■ 4.55
IRF7-208	ENST00000525750	ABCA8	O94911	1581 aa		43.49	■■■■■ 4.55
IRF7-208	ENST00000525750	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.47	■■■■■ 4.55
IRF7-208	ENST00000525750	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.47	■■■■■ 4.55
IRF7-208	ENST00000525750	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.43	■■■■■ 4.54
IRF7-208	ENST00000525750	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	43.43	■■■■■ 4.54
IRF7-208	ENST00000525750	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.42	■■■■■ 4.54
IRF7-208	ENST00000525750	FMN1	Q68DA7	1419 aa		43.31	■■■■■ 4.52
IRF7-208	ENST00000525750	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		43.3	■■■■■ 4.52
IRF7-208	ENST00000525750	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
IRF7-208	ENST00000525750	CLIP1	P30622	1438 aa		43.26	■■■■■ 4.52
IRF7-208	ENST00000525750	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.22	■■■■■ 4.51
IRF7-208	ENST00000525750	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.22	■■■■■ 4.51
IRF7-208	ENST00000525750	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.2	■■■■■ 4.51
IRF7-208	ENST00000525750	ATP10B	O94823	1461 aa		43.13	■■■■■ 4.5
IRF7-208	ENST00000525750	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.5
IRF7-208	ENST00000525750	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.1	■■■■■ 4.49
IRF7-208	ENST00000525750	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.1	■■■■■ 4.49
IRF7-208	ENST00000525750	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.1	■■■■■ 4.49
IRF7-208	ENST00000525750	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.07	■■■■■ 4.49
IRF7-208	ENST00000525750	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		43.06	■■■■■ 4.48
IRF7-208	ENST00000525750	HECW1	Q76N89	1606 aa		43	■■■■■ 4.47
IRF7-208	ENST00000525750	ARID3C	A6NKF2	412 aa		43	■■■■■ 4.47
IRF7-208	ENST00000525750	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
IRF7-208	ENST00000525750	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
IRF7-208	ENST00000525750	GLI2	P10070	1586 aa		42.99	■■■■■ 4.47
IRF7-208	ENST00000525750	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
IRF7-208	ENST00000525750	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.95	■■■■■ 4.47
IRF7-208	ENST00000525750	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
IRF7-208	ENST00000525750	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.88	■■■■■ 4.45
IRF7-208	ENST00000525750	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.85	■■■■■ 4.45
IRF7-208	ENST00000525750	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
IRF7-208	ENST00000525750	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.82	■■■■■ 4.45
IRF7-208	ENST00000525750	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
IRF7-208	ENST00000525750	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
IRF7-208	ENST00000525750	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.79	■■■■■ 4.44
IRF7-208	ENST00000525750	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.74	■■■■■ 4.43
IRF7-208	ENST00000525750	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.7	■■■■■ 4.43
IRF7-208	ENST00000525750	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.65	■■■■■ 4.42
IRF7-208	ENST00000525750	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.65	■■■■■ 4.42
IRF7-208	ENST00000525750	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.65	■■■■■ 4.42
IRF7-208	ENST00000525750	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.63	■■■■■ 4.41
IRF7-208	ENST00000525750	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.62	■■■■■ 4.41
IRF7-208	ENST00000525750	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.62	■■■■■ 4.41
IRF7-208	ENST00000525750	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.59	■■■■■ 4.41
IRF7-208	ENST00000525750	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
IRF7-208	ENST00000525750	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.4
IRF7-208	ENST00000525750	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.46	■■■■■ 4.39
IRF7-208	ENST00000525750	KIF14	Q15058	1648 aa		42.44	■■■■■ 4.38
IRF7-208	ENST00000525750	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.39	■■■■■ 4.38
IRF7-208	ENST00000525750	KDM6B	O15054	1643 aa		42.37	■■■■■ 4.37
IRF7-208	ENST00000525750	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.35	■■■■■ 4.37
IRF7-208	ENST00000525750	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.34	■■■■■ 4.37
IRF7-208	ENST00000525750	NEO1	Q92859	1461 aa		42.31	■■■■■ 4.36
IRF7-208	ENST00000525750	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.3	■■■■■ 4.36
IRF7-208	ENST00000525750	PLCH2	O75038	1416 aa		42.29	■■■■■ 4.36
IRF7-208	ENST00000525750	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.26	■■■■■ 4.36
IRF7-208	ENST00000525750	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.26	■■■■■ 4.36
IRF7-208	ENST00000525750	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.25	■■■■■ 4.35
IRF7-208	ENST00000525750	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.23	■■■■■ 4.35
IRF7-208	ENST00000525750	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		42.22	■■■■■ 4.35
IRF7-208	ENST00000525750	FANCA	O15360	1455 aa		42.21	■■■■■ 4.35
IRF7-208	ENST00000525750	APLP2	Q06481	763 aa		42.19	■■■■■ 4.34
IRF7-208	ENST00000525750	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.17	■■■■■ 4.34
IRF7-208	ENST00000525750	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
IRF7-208	ENST00000525750	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.13	■■■■■ 4.34
IRF7-208	ENST00000525750	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.11	■■■■■ 4.33
IRF7-208	ENST00000525750	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		42.07	■■■■■ 4.33
IRF7-208	ENST00000525750	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.06	■■■■■ 4.32

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