RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524681.1

CTSW-202, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2

Gene CTSW, Length 521 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-202ENST00000524681 GOLGA3Q08378 1498 aa12.26□□□□□ -0.45
CTSW-202ENST00000524681 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.26□□□□□ -0.45
CTSW-202ENST00000524681 SHROOM2Q13796 1616 aa12.21□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.2□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 JPH4Q96JJ6 628 aa12.18□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.18□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 IQGAP2Q13576 1575 aa12.18□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.17□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.17□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 UBTFP17480 764 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 DISP1Q96F81 1524 aa12.16□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.15□□□□□ -0.46
CTSW-202ENST00000524681 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CTSW-202ENST00000524681 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.12□□□□□ -0.47
CTSW-202ENST00000524681 SAMD9Q5K651 1589 aa12.12□□□□□ -0.47
CTSW-202ENST00000524681 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.1□□□□□ -0.47
CTSW-202ENST00000524681 ARHGEF11O15085 1522 aa12.08□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 KIAA0556O60303 1618 aa12.08□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 CEP162Q5TB80 1403 aa12.07□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 ARAP1Q96P48 1450 aa12.06□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.06□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 CLIP1P30622 1438 aa12.05□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.04□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.04□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.04□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.03□□□□□ -0.48
CTSW-202ENST00000524681 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CTSW-202ENST00000524681 P3H3Q8IVL6 736 aa12.02□□□□□ -0.49
CTSW-202ENST00000524681 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.02□□□□□ -0.49
CTSW-202ENST00000524681 PTPRGP23470 1445 aa12□□□□□ -0.49
CTSW-202ENST00000524681 ABCA8O94911 1581 aa11.97□□□□□ -0.49
CTSW-202ENST00000524681 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.96□□□□□ -0.49
CTSW-202ENST00000524681 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.95□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 UACAQ9BZF9 1416 aa11.94□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.93□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 FMN1Q68DA7 1419 aa11.93□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.93□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.92□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.91□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 ABCC2Q92887 1545 aa11.91□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.9□□□□□ -0.5
CTSW-202ENST00000524681 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.89□□□□□ -0.51
CTSW-202ENST00000524681 ATP10BO94823 1461 aa11.89□□□□□ -0.51
CTSW-202ENST00000524681 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.89□□□□□ -0.51
CTSW-202ENST00000524681 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CTSW-202ENST00000524681 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CTSW-202ENST00000524681 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.87□□□□□ -0.51
CTSW-202ENST00000524681 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CTSW-202ENST00000524681 HECW1Q76N89 1606 aa11.82□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 MAP3K1Q13233 1512 aa11.81□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.81□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 ARID3CA6NKF2 412 aa11.79□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 MAPKBP1O60336 1514 aa11.79□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.78□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 TIAM1Q13009 1591 aa11.78□□□□□ -0.52
CTSW-202ENST00000524681 ASXL2Q76L83 1435 aa11.77□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.76□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.74□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.74□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.71□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.71□□□□□ -0.53
CTSW-202ENST00000524681 KIF14Q15058 1648 aa11.7□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 GLI2P10070 1586 aa11.69□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 DIP2BQ9P265 1576 aa11.68□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.67□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 KCNH8Q96L42 1107 aa11.66□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.66□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.66□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.65□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 NCOA2Q15596 1464 aa11.65□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.65□□□□□ -0.54
CTSW-202ENST00000524681 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.64□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.63□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 PLCH2O75038 1416 aa11.62□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 APLP2Q06481 763 aa11.62□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.62□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.6□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 CD109Q6YHK3 1445 aa11.6□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.59□□□□□ -0.55
CTSW-202ENST00000524681 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.58□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.58□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 PREX2Q70Z35 1606 aa11.57□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.56□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 MIA2Q96PC5 1412 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms