RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519363.1

PABPC1-210, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 4

Gene PABPC1, Length 453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-210ENST00000519363 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.82■■□□□ 1.4
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PABPC1-210ENST00000519363 CEP170Q5SW79 1584 aa23.79■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 NUP160Q12769 1436 aa23.79■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.78■■□□□ 1.4
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PABPC1-210ENST00000519363 SAMD9Q5K651 1589 aa23.77■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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PABPC1-210ENST00000519363 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.71■■□□□ 1.39
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PABPC1-210ENST00000519363 FBLN2P98095 1184 aa23.64■■□□□ 1.37
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PABPC1-210ENST00000519363 KIAA0556O60303 1618 aa23.59■■□□□ 1.37
PABPC1-210ENST00000519363 SHROOM2Q13796 1616 aa23.57■■□□□ 1.36
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PABPC1-210ENST00000519363 MAP3K1Q13233 1512 aa23.43■■□□□ 1.34
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PABPC1-210ENST00000519363 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.41■■□□□ 1.34
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PABPC1-210ENST00000519363 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.64■■□□□ 1.22
PABPC1-210ENST00000519363 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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PABPC1-210ENST00000519363 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.58■■□□□ 1.21
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