RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517865.5

AP3M2-204, Transcript of adaptor related protein complex 3 subunit mu 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP3M2, Length 2,778 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2-204ENST00000517865 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
AP3M2-204ENST00000517865 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
AP3M2-204ENST00000517865 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.08■■■□□ 2.09
AP3M2-204ENST00000517865 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
AP3M2-204ENST00000517865 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
AP3M2-204ENST00000517865 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
AP3M2-204ENST00000517865 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.97■■■□□ 2.07
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AP3M2-204ENST00000517865 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.93■■■□□ 2.06
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AP3M2-204ENST00000517865 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
AP3M2-204ENST00000517865 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.91■■■□□ 2.06
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AP3M2-204ENST00000517865 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.81■■■□□ 2.04
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AP3M2-204ENST00000517865 WDR97A6NE52 1622 aa27.76■■■□□ 2.03
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AP3M2-204ENST00000517865 CUL7Q14999 1698 aa27.72■■■□□ 2.03
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AP3M2-204ENST00000517865 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.68■■■□□ 2.02
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AP3M2-204ENST00000517865 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
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AP3M2-204ENST00000517865 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
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AP3M2-204ENST00000517865 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
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AP3M2-204ENST00000517865 PBRM1Q86U86 1689 aa27.42■■□□□ 1.98
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AP3M2-204ENST00000517865 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
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AP3M2-204ENST00000517865 HFM1A2PYH4 1435 aa27.21■■□□□ 1.95
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AP3M2-204ENST00000517865 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.89■■□□□ 1.89
AP3M2-204ENST00000517865 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
AP3M2-204ENST00000517865 ANP32CO43423 234 aa26.87■■□□□ 1.89
AP3M2-204ENST00000517865 KDM6BO15054 1643 aa26.87■■□□□ 1.89
AP3M2-204ENST00000517865 BCANQ96GW7 911 aa26.82■■□□□ 1.88
AP3M2-204ENST00000517865 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
AP3M2-204ENST00000517865 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
AP3M2-204ENST00000517865 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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