RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515529.4

DDR1-279, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-279ENST00000515529 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.23■■■■■ 4.51
DDR1-279ENST00000515529 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
DDR1-279ENST00000515529 JPH4Q96JJ6 628 aa43.19■■■■■ 4.5
DDR1-279ENST00000515529 PRXQ9BXM0 1461 aa43.19■■■■■ 4.5
DDR1-279ENST00000515529 SHROOM2Q13796 1616 aa43.19■■■■■ 4.5
DDR1-279ENST00000515529 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.15■■■■■ 4.5
DDR1-279ENST00000515529 ARAP1Q96P48 1450 aa43.14■■■■■ 4.5
DDR1-279ENST00000515529 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
DDR1-279ENST00000515529 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.03■■■■■ 4.48
DDR1-279ENST00000515529 IQGAP2Q13576 1575 aa43.03■■■■■ 4.48
DDR1-279ENST00000515529 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.89■■■■■ 4.46
DDR1-279ENST00000515529 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.85■■■■■ 4.45
DDR1-279ENST00000515529 KIF21BO75037 1637 aa42.82■■■■■ 4.45
DDR1-279ENST00000515529 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.76■■■■■ 4.44
DDR1-279ENST00000515529 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.67■■■■■ 4.42
DDR1-279ENST00000515529 DISP1Q96F81 1524 aa42.66■■■■■ 4.42
DDR1-279ENST00000515529 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.65■■■■■ 4.42
DDR1-279ENST00000515529 GOLGA3Q08378 1498 aa42.64■■■■■ 4.42
DDR1-279ENST00000515529 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
DDR1-279ENST00000515529 PTPRGP23470 1445 aa42.63■■■■■ 4.41
DDR1-279ENST00000515529 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
DDR1-279ENST00000515529 KIAA0556O60303 1618 aa42.6■■■■■ 4.41
DDR1-279ENST00000515529 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
DDR1-279ENST00000515529 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
DDR1-279ENST00000515529 P3H3Q8IVL6 736 aa42.37■■■■■ 4.37
DDR1-279ENST00000515529 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.35■■■■■ 4.37
DDR1-279ENST00000515529 SAMD9Q5K651 1589 aa42.33■■■■■ 4.37
DDR1-279ENST00000515529 UACAQ9BZF9 1416 aa42.32■■■■■ 4.37
DDR1-279ENST00000515529 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
DDR1-279ENST00000515529 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.25■■■■■ 4.35
DDR1-279ENST00000515529 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.23■■■■■ 4.35
DDR1-279ENST00000515529 ABCC2Q92887 1545 aa42.22■■■■■ 4.35
DDR1-279ENST00000515529 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.17■■■■■ 4.34
DDR1-279ENST00000515529 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.15■■■■■ 4.34
DDR1-279ENST00000515529 ABCA8O94911 1581 aa42.1■■■■■ 4.33
DDR1-279ENST00000515529 MAPKBP1O60336 1514 aa42.08■■■■■ 4.33
DDR1-279ENST00000515529 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.02■■■■■ 4.32
DDR1-279ENST00000515529 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.01■■■■■ 4.32
DDR1-279ENST00000515529 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
DDR1-279ENST00000515529 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.95■■■■■ 4.31
DDR1-279ENST00000515529 ASXL2Q76L83 1435 aa41.91■■■■■ 4.3
DDR1-279ENST00000515529 CLIP1P30622 1438 aa41.89■■■■■ 4.3
DDR1-279ENST00000515529 FMN1Q68DA7 1419 aa41.88■■■■■ 4.3
DDR1-279ENST00000515529 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.88■■■■■ 4.29
DDR1-279ENST00000515529 ARID3CA6NKF2 412 aa41.87■■■■■ 4.29
DDR1-279ENST00000515529 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.86■■■■■ 4.29
DDR1-279ENST00000515529 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.86■■■■■ 4.29
DDR1-279ENST00000515529 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
DDR1-279ENST00000515529 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
DDR1-279ENST00000515529 DIP2BQ9P265 1576 aa41.79■■■■■ 4.28
DDR1-279ENST00000515529 ATP10BO94823 1461 aa41.77■■■■■ 4.28
DDR1-279ENST00000515529 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
DDR1-279ENST00000515529 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.76■■■■■ 4.28
DDR1-279ENST00000515529 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
DDR1-279ENST00000515529 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.73■■■■■ 4.27
DDR1-279ENST00000515529 CEP162Q5TB80 1403 aa41.72■■■■■ 4.27
DDR1-279ENST00000515529 HECW1Q76N89 1606 aa41.66■■■■■ 4.26
DDR1-279ENST00000515529 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
DDR1-279ENST00000515529 KCNH8Q96L42 1107 aa41.61■■■■■ 4.25
DDR1-279ENST00000515529 GLI2P10070 1586 aa41.6■■■■■ 4.25
DDR1-279ENST00000515529 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.53■■■■■ 4.24
DDR1-279ENST00000515529 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.53■■■■■ 4.24
DDR1-279ENST00000515529 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
DDR1-279ENST00000515529 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
DDR1-279ENST00000515529 TSPOAP1O95153 1857 aa41.46■■■■■ 4.23
DDR1-279ENST00000515529 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.46■■■■■ 4.23
DDR1-279ENST00000515529 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
DDR1-279ENST00000515529 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.4■■■■■ 4.22
DDR1-279ENST00000515529 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.39■■■■■ 4.22
DDR1-279ENST00000515529 CD109Q6YHK3 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
DDR1-279ENST00000515529 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.35■■■■■ 4.21
DDR1-279ENST00000515529 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.3■■■■■ 4.2
DDR1-279ENST00000515529 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.3■■■■■ 4.2
DDR1-279ENST00000515529 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.26■■■■■ 4.2
DDR1-279ENST00000515529 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
DDR1-279ENST00000515529 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
DDR1-279ENST00000515529 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.21■■■■■ 4.19
DDR1-279ENST00000515529 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.2■■■■■ 4.19
DDR1-279ENST00000515529 KDM6BO15054 1643 aa41.14■■■■■ 4.18
DDR1-279ENST00000515529 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.182e-7■■■■□ 26.2
DDR1-279ENST00000515529 KIF14Q15058 1648 aa41.12■■■■■ 4.17
DDR1-279ENST00000515529 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.08■■■■■ 4.17
DDR1-279ENST00000515529 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.02■■■■■ 4.16
DDR1-279ENST00000515529 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.98■■■■■ 4.15
DDR1-279ENST00000515529 NEO1Q92859 1461 aa40.96■■■■■ 4.15
DDR1-279ENST00000515529 PLCH2O75038 1416 aa40.93■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 FANCAO15360 1455 aa40.91■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.91■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.91■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.89■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 APLP2Q06481 763 aa40.89■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 TIAM1Q13009 1591 aa40.89■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
DDR1-279ENST00000515529 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.84■■■■■ 4.13
DDR1-279ENST00000515529 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.84■■■■■ 4.13
DDR1-279ENST00000515529 AKNAQ7Z591 1439 aa40.83■■■■■ 4.13
DDR1-279ENST00000515529 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.81■■■■■ 4.12
DDR1-279ENST00000515529 MAP3K1Q13233 1512 aa40.79■■■■■ 4.12
DDR1-279ENST00000515529 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.75■■■■■ 4.11
DDR1-279ENST00000515529 PREX2Q70Z35 1606 aa40.73■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 600.2 ms