RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513815.1

LINC00491-204, long intergenic non-protein coding RNA 491, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00491, Length 582 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00491-204ENST00000513815 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 SOGA1O94964 1423 aa8.57□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.57□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 SHROOM2Q13796 1616 aa8.56□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 CEP170Q5SW79 1584 aa8.56□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 TOP2BQ02880 1626 aa8.54□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.53□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
LINC00491-204ENST00000513815 NUP160Q12769 1436 aa8.52□□□□□ -1.05
LINC00491-204ENST00000513815 TSPOAP1O95153 1857 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00491-204ENST00000513815 PBRM1Q86U86 1689 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00491-204ENST00000513815 GRIN2AQ12879 1464 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00491-204ENST00000513815 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.46□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.45□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.45□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 GLI2P10070 1586 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 CERKQ8TCT0 537 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
LINC00491-204ENST00000513815 JPH4Q96JJ6 628 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 ADAMTS12P58397 1594 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00491-204ENST00000513815 CUX1P39880 1505 aa8.34□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.34□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 PTPRMP28827 1452 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC2Q92887 1545 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 ASXL2Q76L83 1435 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00491-204ENST00000513815 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.27□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.26□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.26□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 KIF21BO75037 1637 aa8.24□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.24□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 PTPRGP23470 1445 aa8.21□□□□□ -1.09
LINC00491-204ENST00000513815 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.2□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.19□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.19□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 CUL7Q14999 1698 aa8.19□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.18□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.17□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.17□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.17□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 MADDQ8WXG6 1647 aa8.16□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 UACAQ9BZF9 1416 aa8.15□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 HSPA2P54652 639 aa8.15□□□□□ -1.1
LINC00491-204ENST00000513815 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.14□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 CD109Q6YHK3 1445 aa8.14□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.13□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 PTPRTO14522 1441 aa8.13□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.11□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 STRCQ7RTU9 1775 aa8.1□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LINC00491-204ENST00000513815 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.08□□□□□ -1.12
LINC00491-204ENST00000513815 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.08□□□□□ -1.12
LINC00491-204ENST00000513815 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.07□□□□□ -1.12
LINC00491-204ENST00000513815 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.05□□□□□ -1.12
LINC00491-204ENST00000513815 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LINC00491-204ENST00000513815 NEO1Q92859 1461 aa8.03□□□□□ -1.12
LINC00491-204ENST00000513815 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.03□□□□□ -1.12
LINC00491-204ENST00000513815 FANCAO15360 1455 aa8.02□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.01□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 RNF39Q9H2S5 420 aa8.01□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.99□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 DISP1Q96F81 1524 aa7.99□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.99□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 IQGAP2Q13576 1575 aa7.99□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.99□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 AKNAQ7Z591 1439 aa7.98□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 RAPGEF3O95398 923 aa7.98□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 IGF1RP08069 1367 aa7.97□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00491-204ENST00000513815 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 HSPA1LP34931 641 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 KCNH8Q96L42 1107 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 NCOA1Q15788 1441 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms