RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498224.5

SLC20A1-209, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC20A1, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-209ENST00000498224 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.246e-8■■■■□ 23.2
SLC20A1-209ENST00000498224 GRIN2BQ13224 1484 aa16.57■□□□□ 0.24
SLC20A1-209ENST00000498224 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SLC20A1-209ENST00000498224 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.53■□□□□ 0.24
SLC20A1-209ENST00000498224 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SLC20A1-209ENST00000498224 PBRM1Q86U86 1689 aa16.5■□□□□ 0.23
SLC20A1-209ENST00000498224 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SLC20A1-209ENST00000498224 ADAMTS12P58397 1594 aa16.46■□□□□ 0.23
SLC20A1-209ENST00000498224 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.45■□□□□ 0.22
SLC20A1-209ENST00000498224 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.42■□□□□ 0.22
SLC20A1-209ENST00000498224 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SLC20A1-209ENST00000498224 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.42■□□□□ 0.22
SLC20A1-209ENST00000498224 ARAP1Q96P48 1450 aa16.41■□□□□ 0.22
SLC20A1-209ENST00000498224 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SLC20A1-209ENST00000498224 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.39■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.38■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 APLP2Q06481 763 aa16.37■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 SYNJ2O15056 1496 aa16.36■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.36■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 GRIN2AQ12879 1464 aa16.35■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.34■□□□□ 0.21
SLC20A1-209ENST00000498224 ZBTB22O15209 634 aa16.32■□□□□ 0.2
SLC20A1-209ENST00000498224 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SLC20A1-209ENST00000498224 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SLC20A1-209ENST00000498224 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.29■□□□□ 0.2
SLC20A1-209ENST00000498224 FBLN2P98095 1184 aa16.29■□□□□ 0.2
SLC20A1-209ENST00000498224 P3H3Q8IVL6 736 aa16.28■□□□□ 0.2
SLC20A1-209ENST00000498224 IQGAP2Q13576 1575 aa16.28■□□□□ 0.2
SLC20A1-209ENST00000498224 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.26■□□□□ 0.19
SLC20A1-209ENST00000498224 SAMD9Q5K651 1589 aa16.26■□□□□ 0.19
SLC20A1-209ENST00000498224 FMN1Q68DA7 1419 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-209ENST00000498224 NUP160Q12769 1436 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-209ENST00000498224 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-209ENST00000498224 CEP170Q5SW79 1584 aa16.2■□□□□ 0.18
SLC20A1-209ENST00000498224 MAP3K1Q13233 1512 aa16.19■□□□□ 0.18
SLC20A1-209ENST00000498224 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.19■□□□□ 0.18
SLC20A1-209ENST00000498224 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SLC20A1-209ENST00000498224 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.17■□□□□ 0.18
SLC20A1-209ENST00000498224 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SLC20A1-209ENST00000498224 JPH4Q96JJ6 628 aa16.14■□□□□ 0.17
SLC20A1-209ENST00000498224 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SLC20A1-209ENST00000498224 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.12■□□□□ 0.17
SLC20A1-209ENST00000498224 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SLC20A1-209ENST00000498224 DISP1Q96F81 1524 aa16.12■□□□□ 0.17
SLC20A1-209ENST00000498224 TIAM1Q13009 1591 aa16.12■□□□□ 0.17
SLC20A1-209ENST00000498224 KIAA0556O60303 1618 aa16.11■□□□□ 0.17
SLC20A1-209ENST00000498224 CHD1O14646 1710 aa16.08■□□□□ 0.16
SLC20A1-209ENST00000498224 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-209ENST00000498224 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-209ENST00000498224 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-209ENST00000498224 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC20A1-209ENST00000498224 HECW1Q76N89 1606 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC20A1-209ENST00000498224 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SLC20A1-209ENST00000498224 MSH5O43196 834 aa16■□□□□ 0.15
SLC20A1-209ENST00000498224 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC20A1-209ENST00000498224 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SLC20A1-209ENST00000498224 SHROOM2Q13796 1616 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC20A1-209ENST00000498224 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC20A1-209ENST00000498224 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 PTPRGP23470 1445 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.92■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.91■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.9■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.9■□□□□ 0.14
SLC20A1-209ENST00000498224 OSCARQ8IYS5 282 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 ABCA8O94911 1581 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 ARID3CA6NKF2 412 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 HRCP23327 699 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 NCOA2Q15596 1464 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 UACAQ9BZF9 1416 aa15.85■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.84■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
SLC20A1-209ENST00000498224 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.82■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 ARHGEF11O15085 1522 aa15.82■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.82■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.81■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.81■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 ATP10BO94823 1461 aa15.8■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SLC20A1-209ENST00000498224 ABCC2Q92887 1545 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-209ENST00000498224 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-209ENST00000498224 MIA2Q96PC5 1412 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-209ENST00000498224 ITGAEP38570 1179 aa15.75■□□□□ 0.11
SLC20A1-209ENST00000498224 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SLC20A1-209ENST00000498224 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
SLC20A1-209ENST00000498224 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.7■□□□□ 0.1
SLC20A1-209ENST00000498224 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms