RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

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Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
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PRRX1-207ENST00000497230 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRX1-207ENST00000497230 MSH5O43196 834 aa16.66■□□□□ 0.26
PRRX1-207ENST00000497230 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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PRRX1-207ENST00000497230 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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PRRX1-207ENST00000497230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.57■□□□□ 0.24
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PRRX1-207ENST00000497230 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.54■□□□□ 0.24
PRRX1-207ENST00000497230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.53■□□□□ 0.24
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PRRX1-207ENST00000497230 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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PRRX1-207ENST00000497230 CCER2I3L3R5 266 aa16.28■□□□□ 0.2
PRRX1-207ENST00000497230 ARXQ96QS3 562 aa16.28■□□□□ 0.2
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PRRX1-207ENST00000497230 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
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PRRX1-207ENST00000497230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRRX1-207ENST00000497230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.08■□□□□ 0.17
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PRRX1-207ENST00000497230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRRX1-207ENST00000497230 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.07■□□□□ 0.16
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PRRX1-207ENST00000497230 TMC1Q8TDI8 760 aa16.07■□□□□ 0.16
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PRRX1-207ENST00000497230 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.92■□□□□ 0.14
PRRX1-207ENST00000497230 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.91■□□□□ 0.14
PRRX1-207ENST00000497230 RGS3P49796 1198 aa15.91■□□□□ 0.14
PRRX1-207ENST00000497230 AKNAQ7Z591 1439 aa15.91■□□□□ 0.14
PRRX1-207ENST00000497230 PDE4AP27815 886 aa15.9■□□□□ 0.14
PRRX1-207ENST00000497230 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
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PRRX1-207ENST00000497230 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.89■□□□□ 0.13
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