RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.45■■■□□ 2.63
CERKL-213ENST00000494398 CUL7Q14999 1698 aa31.45■■■□□ 2.63
CERKL-213ENST00000494398 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.45■■■□□ 2.62
CERKL-213ENST00000494398 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CERKL-213ENST00000494398 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.41■■■□□ 2.62
CERKL-213ENST00000494398 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CERKL-213ENST00000494398 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.39■■■□□ 2.62
CERKL-213ENST00000494398 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CERKL-213ENST00000494398 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.36■■■□□ 2.61
CERKL-213ENST00000494398 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CERKL-213ENST00000494398 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CERKL-213ENST00000494398 NEUROD1Q13562 356 aa31.34■■■□□ 2.61
CERKL-213ENST00000494398 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.33■■■□□ 2.61
CERKL-213ENST00000494398 WDR97A6NE52 1622 aa31.31■■■□□ 2.6
CERKL-213ENST00000494398 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.29■■■□□ 2.6
CERKL-213ENST00000494398 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.29■■■□□ 2.6
CERKL-213ENST00000494398 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.27■■■□□ 2.6
CERKL-213ENST00000494398 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.27■■■□□ 2.6
CERKL-213ENST00000494398 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.27■■■□□ 2.6
CERKL-213ENST00000494398 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
CERKL-213ENST00000494398 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.25■■■□□ 2.59
CERKL-213ENST00000494398 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.25■■■□□ 2.59
CERKL-213ENST00000494398 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.59
CERKL-213ENST00000494398 FMN1Q68DA7 1419 aa31.22■■■□□ 2.59
CERKL-213ENST00000494398 MIER1Q8N108 512 aa31.21■■■□□ 2.59
CERKL-213ENST00000494398 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.18■■■□□ 2.58
CERKL-213ENST00000494398 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.18■■■□□ 2.58
CERKL-213ENST00000494398 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.07■■■□□ 2.56
CERKL-213ENST00000494398 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CERKL-213ENST00000494398 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CERKL-213ENST00000494398 SAMD9Q5K651 1589 aa31.05■■■□□ 2.56
CERKL-213ENST00000494398 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
CERKL-213ENST00000494398 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.03■■■□□ 2.56
CERKL-213ENST00000494398 MAPKBP1O60336 1514 aa31.01■■■□□ 2.55
CERKL-213ENST00000494398 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31■■■□□ 2.55
CERKL-213ENST00000494398 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.95■■■□□ 2.54
CERKL-213ENST00000494398 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.93■■■□□ 2.54
CERKL-213ENST00000494398 GRIN2BQ13224 1484 aa30.92■■■□□ 2.54
CERKL-213ENST00000494398 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CERKL-213ENST00000494398 PBRM1Q86U86 1689 aa30.85■■■□□ 2.53
CERKL-213ENST00000494398 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.84■■■□□ 2.53
CERKL-213ENST00000494398 NCOA2Q15596 1464 aa30.83■■■□□ 2.53
CERKL-213ENST00000494398 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.82■■■□□ 2.52
CERKL-213ENST00000494398 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.79■■■□□ 2.52
CERKL-213ENST00000494398 ADAMTS12P58397 1594 aa30.78■■■□□ 2.52
CERKL-213ENST00000494398 IQGAP2Q13576 1575 aa30.77■■■□□ 2.52
CERKL-213ENST00000494398 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.77■■■□□ 2.52
CERKL-213ENST00000494398 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.76■■■□□ 2.51
CERKL-213ENST00000494398 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.75■■■□□ 2.51
CERKL-213ENST00000494398 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CERKL-213ENST00000494398 IFT140Q96RY7 1462 aa30.73■■■□□ 2.51
CERKL-213ENST00000494398 PTPRKQ15262 1439 aa30.72■■■□□ 2.51
CERKL-213ENST00000494398 HFM1A2PYH4 1435 aa30.71■■■□□ 2.51
CERKL-213ENST00000494398 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CERKL-213ENST00000494398 HECW1Q76N89 1606 aa30.66■■■□□ 2.5
CERKL-213ENST00000494398 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.66■■■□□ 2.5
CERKL-213ENST00000494398 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.66■■■□□ 2.5
CERKL-213ENST00000494398 WDR62O43379 1518 aa30.65■■■□□ 2.5
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF11O15085 1522 aa30.63■■■□□ 2.49
CERKL-213ENST00000494398 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
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CERKL-213ENST00000494398 UACAQ9BZF9 1416 aa30.61■■■□□ 2.49
CERKL-213ENST00000494398 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.61■■■□□ 2.49
CERKL-213ENST00000494398 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CERKL-213ENST00000494398 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CERKL-213ENST00000494398 ARID3CA6NKF2 412 aa30.56■■■□□ 2.48
CERKL-213ENST00000494398 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.55■■■□□ 2.48
CERKL-213ENST00000494398 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CERKL-213ENST00000494398 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CERKL-213ENST00000494398 TONSLQ96HA7 1378 aa30.51■■■□□ 2.47
CERKL-213ENST00000494398 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.5■■■□□ 2.47
CERKL-213ENST00000494398 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.5■■■□□ 2.47
CERKL-213ENST00000494398 ERCC6Q03468 1493 aa30.5■■■□□ 2.47
CERKL-213ENST00000494398 GRIN2AQ12879 1464 aa30.46■■■□□ 2.47
CERKL-213ENST00000494398 MIA2Q96PC5 1412 aa30.46■■■□□ 2.47
CERKL-213ENST00000494398 DISP1Q96F81 1524 aa30.45■■■□□ 2.46
CERKL-213ENST00000494398 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CERKL-213ENST00000494398 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CERKL-213ENST00000494398 KIAA0556O60303 1618 aa30.42■■■□□ 2.46
CERKL-213ENST00000494398 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CERKL-213ENST00000494398 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CERKL-213ENST00000494398 TRIM52Q96A61 297 aa30.36■■■□□ 2.45
CERKL-213ENST00000494398 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CERKL-213ENST00000494398 AKNAQ7Z591 1439 aa30.36■■■□□ 2.45
CERKL-213ENST00000494398 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CERKL-213ENST00000494398 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
CERKL-213ENST00000494398 FBLN2P98095 1184 aa30.31■■■□□ 2.44
CERKL-213ENST00000494398 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.3■■■□□ 2.44
CERKL-213ENST00000494398 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.29■■■□□ 2.44
CERKL-213ENST00000494398 SYNJ2O15056 1496 aa30.28■■■□□ 2.44
CERKL-213ENST00000494398 KCNH8Q96L42 1107 aa30.27■■■□□ 2.44
CERKL-213ENST00000494398 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.23■■■□□ 2.43
CERKL-213ENST00000494398 DAPK1P53355 1430 aa30.22■■■□□ 2.43
CERKL-213ENST00000494398 CEP170Q5SW79 1584 aa30.21■■■□□ 2.43
CERKL-213ENST00000494398 KDM6BO15054 1643 aa30.21■■■□□ 2.43
CERKL-213ENST00000494398 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CERKL-213ENST00000494398 ROCK1Q13464 1354 aa30.2■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 JPH4Q96JJ6 628 aa30.19■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 ABCC5O15440 1437 aa30.17■■■□□ 2.42
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