RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485859.1

GUK1-231, Transcript of guanylate kinase 1, human

TSL 1 (best)

Gene GUK1, Length 325 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GUK1-231	ENST00000485859	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GUK1-231	ENST00000485859	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GUK1-231	ENST00000485859	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GUK1-231	ENST00000485859	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GUK1-231	ENST00000485859	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GUK1-231	ENST00000485859	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GUK1-231	ENST00000485859	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GUK1-231	ENST00000485859	KIF21B	O75037	1637 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GUK1-231	ENST00000485859	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GUK1-231	ENST00000485859	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
GUK1-231	ENST00000485859	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GUK1-231	ENST00000485859	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GUK1-231	ENST00000485859	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GUK1-231	ENST00000485859	DISP1	Q96F81	1524 aa		29	■■■□□ 2.23
GUK1-231	ENST00000485859	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29	■■■□□ 2.23
GUK1-231	ENST00000485859	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GUK1-231	ENST00000485859	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GUK1-231	ENST00000485859	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GUK1-231	ENST00000485859	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GUK1-231	ENST00000485859	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
GUK1-231	ENST00000485859	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GUK1-231	ENST00000485859	PTPRG	P23470	1445 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GUK1-231	ENST00000485859	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
GUK1-231	ENST00000485859	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GUK1-231	ENST00000485859	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GUK1-231	ENST00000485859	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GUK1-231	ENST00000485859	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GUK1-231	ENST00000485859	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GUK1-231	ENST00000485859	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GUK1-231	ENST00000485859	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.64	■■■□□ 2.17
GUK1-231	ENST00000485859	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GUK1-231	ENST00000485859	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GUK1-231	ENST00000485859	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GUK1-231	ENST00000485859	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GUK1-231	ENST00000485859	ABCA8	O94911	1581 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GUK1-231	ENST00000485859	CLIP1	P30622	1438 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GUK1-231	ENST00000485859	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GUK1-231	ENST00000485859	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.45	■■■□□ 2.15
GUK1-231	ENST00000485859	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GUK1-231	ENST00000485859	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GUK1-231	ENST00000485859	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GUK1-231	ENST00000485859	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.42	■■■□□ 2.14
GUK1-231	ENST00000485859	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
GUK1-231	ENST00000485859	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GUK1-231	ENST00000485859	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GUK1-231	ENST00000485859	ATP10B	O94823	1461 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GUK1-231	ENST00000485859	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GUK1-231	ENST00000485859	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
GUK1-231	ENST00000485859	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GUK1-231	ENST00000485859	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GUK1-231	ENST00000485859	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GUK1-231	ENST00000485859	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GUK1-231	ENST00000485859	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GUK1-231	ENST00000485859	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GUK1-231	ENST00000485859	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GUK1-231	ENST00000485859	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
GUK1-231	ENST00000485859	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
GUK1-231	ENST00000485859	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GUK1-231	ENST00000485859	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GUK1-231	ENST00000485859	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GUK1-231	ENST00000485859	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
GUK1-231	ENST00000485859	GLI2	P10070	1586 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GUK1-231	ENST00000485859	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
GUK1-231	ENST00000485859	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
GUK1-231	ENST00000485859	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GUK1-231	ENST00000485859	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GUK1-231	ENST00000485859	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GUK1-231	ENST00000485859	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GUK1-231	ENST00000485859	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GUK1-231	ENST00000485859	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GUK1-231	ENST00000485859	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
GUK1-231	ENST00000485859	TSPOAP1	O95153	1857 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GUK1-231	ENST00000485859	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GUK1-231	ENST00000485859	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
GUK1-231	ENST00000485859	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		27.95	■■■□□ 2.07
GUK1-231	ENST00000485859	CD109	Q6YHK3	1445 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GUK1-231	ENST00000485859	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06	6e-14	■□□□□ 8.5
GUK1-231	ENST00000485859	KIF14	Q15058	1648 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GUK1-231	ENST00000485859	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GUK1-231	ENST00000485859	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GUK1-231	ENST00000485859	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GUK1-231	ENST00000485859	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GUK1-231	ENST00000485859	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GUK1-231	ENST00000485859	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GUK1-231	ENST00000485859	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GUK1-231	ENST00000485859	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
GUK1-231	ENST00000485859	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GUK1-231	ENST00000485859	PLCH2	O75038	1416 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GUK1-231	ENST00000485859	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
GUK1-231	ENST00000485859	KDM6B	O15054	1643 aa		27.7	■■■□□ 2.03
GUK1-231	ENST00000485859	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.7	■■■□□ 2.03
GUK1-231	ENST00000485859	NEO1	Q92859	1461 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GUK1-231	ENST00000485859	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GUK1-231	ENST00000485859	FANCA	O15360	1455 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GUK1-231	ENST00000485859	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GUK1-231	ENST00000485859	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GUK1-231	ENST00000485859	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
GUK1-231	ENST00000485859	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GUK1-231	ENST00000485859	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.64	■■■□□ 2.01
GUK1-231	ENST00000485859	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.62	■■■□□ 2.01

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