RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 ARAP1Q96P48 1450 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.31□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.3□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 ERCC6Q03468 1493 aa6.29□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.28□□□□□ -1.4
USP25-208ENST00000478932 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.27□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 FBLN2P98095 1184 aa6.25□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.25□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.25□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 ITGAEP38570 1179 aa6.24□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 WDR97A6NE52 1622 aa6.23□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 CUL7Q14999 1698 aa6.23□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 IFT140Q96RY7 1462 aa6.22□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 WDR62O43379 1518 aa6.22□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.21□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 GRIN2BQ13224 1484 aa6.21□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 ARID3CA6NKF2 412 aa6.21□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
USP25-208ENST00000478932 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.18□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.18□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 FMN1Q68DA7 1419 aa6.18□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 TIAM1Q13009 1591 aa6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 PBRM1Q86U86 1689 aa6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.17□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 ADAMTS12P58397 1594 aa6.16□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.15□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 GRIN2AQ12879 1464 aa6.15□□□□□ -1.42
USP25-208ENST00000478932 JPH4Q96JJ6 628 aa6.15□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.15□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 MAP3K1Q13233 1512 aa6.14□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 IQGAP2Q13576 1575 aa6.14□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.14□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 SAMD9Q5K651 1589 aa6.13□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.13□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 RNF39Q9H2S5 420 aa6.13□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 SYNJ2O15056 1496 aa6.13□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 DISP1Q96F81 1524 aa6.11□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.1□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 CEP170Q5SW79 1584 aa6.09□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.09□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
USP25-208ENST00000478932 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.09□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.09□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.08□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 NCOA2Q15596 1464 aa6.08□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.08□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.08□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.08□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 NUP160Q12769 1436 aa6.08□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.07□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.07□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 KIAA0556O60303 1618 aa6.06□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 PTPRKQ15262 1439 aa6.06□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.06□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.06□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 NEUROD1Q13562 356 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 HECW1Q76N89 1606 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 PTPRGP23470 1445 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP25-208ENST00000478932 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.7 ms