RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469325.5

VAV3-204, Transcript of vav guanine nucleotide exchange factor 3, human

TSL 2

Gene VAV3, Length 2,487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAV3-204	ENST00000469325	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.84	□□□□□ -1.15
VAV3-204	ENST00000469325	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.83	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		7.81	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	ARAP1	Q96P48	1450 aa		7.8	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	KCNA4	P22459	653 aa		7.78	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.78	□□□□□ -1.16
VAV3-204	ENST00000469325	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		7.77	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	CUL7	Q14999	1698 aa		7.74	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.74	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	WDR97	A6NE52	1622 aa		7.73	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	P3H3	Q8IVL6	736 aa		7.73	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		7.71	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		7.71	□□□□□ -1.17
VAV3-204	ENST00000469325	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		7.71	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		7.68	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		7.68	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		7.67	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.67	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	ERCC6	Q03468	1493 aa		7.67	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.67	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.66	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.65	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7.65	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
VAV3-204	ENST00000469325	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.65	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	IFT140	Q96RY7	1462 aa		7.65	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	WDR62	O43379	1518 aa		7.64	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	PBRM1	Q86U86	1689 aa		7.64	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.64	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	GRIN2B	Q13224	1484 aa		7.64	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		7.64	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	ITGAE	P38570	1179 aa		7.63	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		7.61	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	SAMD9	Q5K651	1589 aa		7.61	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	ADAMTS12	P58397	1594 aa		7.6	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.6	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		7.59	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	IQGAP2	Q13576	1575 aa		7.59	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	7.59	□□□□□ -1.19
VAV3-204	ENST00000469325	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		7.59	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		7.58	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	FBLN2	P98095	1184 aa		7.56	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		7.55	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	GRIN2A	Q12879	1464 aa		7.55	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		7.54	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		7.53	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		7.53	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		7.53	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		7.53	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.53	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	SYNJ2	O15056	1496 aa		7.53	□□□□□ -1.2
VAV3-204	ENST00000469325	HECW1	Q76N89	1606 aa		7.52	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	NCOA2	Q15596	1464 aa		7.52	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	ARID3C	A6NKF2	412 aa		7.52	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	POTEH	Q6S545	545 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	DISP1	Q96F81	1524 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	KIAA0556	O60303	1618 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	JPH4	Q96JJ6	628 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	CEP170	Q5SW79	1584 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	NUP160	Q12769	1436 aa		7.46	□□□□□ -1.21
VAV3-204	ENST00000469325	ARHGEF11	O15085	1522 aa		7.46	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		7.45	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		7.45	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	MAPKBP1	O60336	1514 aa		7.45	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	HFM1	A2PYH4	1435 aa		7.44	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	PTPRK	Q15262	1439 aa		7.44	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	MIA2	Q96PC5	1412 aa		7.44	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.44	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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