RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468886.5

GCOM1-205, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,508 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-205ENST00000468886 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.59■■□□□ 1.05
GCOM1-205ENST00000468886 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.58■■□□□ 1.05
GCOM1-205ENST00000468886 ITGAEP38570 1179 aa21.58■■□□□ 1.05
GCOM1-205ENST00000468886 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.58■■□□□ 1.05
GCOM1-205ENST00000468886 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
GCOM1-205ENST00000468886 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GCOM1-205ENST00000468886 CUL7Q14999 1698 aa21.55■■□□□ 1.04
GCOM1-205ENST00000468886 NESP48681 1621 aa21.55■■□□□ 1.04
GCOM1-205ENST00000468886 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.52■■□□□ 1.04
GCOM1-205ENST00000468886 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.51■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 P3H3Q8IVL6 736 aa21.5■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.49■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.48■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.48■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.47■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.46■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 WDR97A6NE52 1622 aa21.46■■□□□ 1.03
GCOM1-205ENST00000468886 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GCOM1-205ENST00000468886 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.43■■□□□ 1.02
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GCOM1-205ENST00000468886 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-205ENST00000468886 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.36■■□□□ 1.01
GCOM1-205ENST00000468886 FMN1Q68DA7 1419 aa21.35■■□□□ 1.01
GCOM1-205ENST00000468886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.3■■□□□ 1
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GCOM1-205ENST00000468886 SAMD9Q5K651 1589 aa21.28■■□□□ 1
GCOM1-205ENST00000468886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
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GCOM1-205ENST00000468886 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.19■□□□□ 0.98
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GCOM1-205ENST00000468886 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.13■□□□□ 0.97
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GCOM1-205ENST00000468886 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.94■□□□□ 0.94
GCOM1-205ENST00000468886 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
GCOM1-205ENST00000468886 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
GCOM1-205ENST00000468886 KCNH8Q96L42 1107 aa20.92■□□□□ 0.94
GCOM1-205ENST00000468886 WDR62O43379 1518 aa20.91■□□□□ 0.94
GCOM1-205ENST00000468886 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GCOM1-205ENST00000468886 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
GCOM1-205ENST00000468886 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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GCOM1-205ENST00000468886 IFT140Q96RY7 1462 aa20.86■□□□□ 0.93
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GCOM1-205ENST00000468886 MIA2Q96PC5 1412 aa20.85■□□□□ 0.93
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GCOM1-205ENST00000468886 ROCK1Q13464 1354 aa20.68■□□□□ 0.9
GCOM1-205ENST00000468886 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
GCOM1-205ENST00000468886 ABCC5O15440 1437 aa20.64■□□□□ 0.9
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GCOM1-205ENST00000468886 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
GCOM1-205ENST00000468886 ERCC6Q03468 1493 aa20.62■□□□□ 0.89
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