RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.36□□□□□ -0.59
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USP54-210ENST00000466048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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USP54-210ENST00000466048 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.33□□□□□ -0.59
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USP54-210ENST00000466048 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.19□□□□□ -0.62
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USP54-210ENST00000466048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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USP54-210ENST00000466048 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.12□□□□□ -0.63
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USP54-210ENST00000466048 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.91□□□□□ -0.66
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USP54-210ENST00000466048 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
USP54-210ENST00000466048 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
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