RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462780.5

RUSC1-206, Transcript of RUN and SH3 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene RUSC1, Length 2,420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-206ENST00000462780 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.14■■□□□ 1.78
RUSC1-206ENST00000462780 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
RUSC1-206ENST00000462780 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.778e-10■■■■■ 51.9
RUSC1-206ENST00000462780 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
RUSC1-206ENST00000462780 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
RUSC1-206ENST00000462780 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
RUSC1-206ENST00000462780 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.02■■□□□ 1.76
RUSC1-206ENST00000462780 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26■■□□□ 1.75
RUSC1-206ENST00000462780 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
RUSC1-206ENST00000462780 P3H3Q8IVL6 736 aa25.99■■□□□ 1.75
RUSC1-206ENST00000462780 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.98■■□□□ 1.75
RUSC1-206ENST00000462780 CUL7Q14999 1698 aa25.97■■□□□ 1.75
RUSC1-206ENST00000462780 ITGAEP38570 1179 aa25.96■■□□□ 1.75
RUSC1-206ENST00000462780 TIAM1Q13009 1591 aa25.95■■□□□ 1.75
RUSC1-206ENST00000462780 NEUROD1Q13562 356 aa25.92■■□□□ 1.74
RUSC1-206ENST00000462780 PBRM1Q86U86 1689 aa25.92■■□□□ 1.74
RUSC1-206ENST00000462780 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RUSC1-206ENST00000462780 MAP3K1Q13233 1512 aa25.9■■□□□ 1.74
RUSC1-206ENST00000462780 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.9■■□□□ 1.74
RUSC1-206ENST00000462780 GRIN2BQ13224 1484 aa25.89■■□□□ 1.74
RUSC1-206ENST00000462780 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
RUSC1-206ENST00000462780 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.87■■□□□ 1.73
RUSC1-206ENST00000462780 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
RUSC1-206ENST00000462780 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.86■■□□□ 1.73
RUSC1-206ENST00000462780 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
RUSC1-206ENST00000462780 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.83■■□□□ 1.73
RUSC1-206ENST00000462780 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.81■■□□□ 1.72
RUSC1-206ENST00000462780 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.81■■□□□ 1.72
RUSC1-206ENST00000462780 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RUSC1-206ENST00000462780 MIER1Q8N108 512 aa25.78■■□□□ 1.72
RUSC1-206ENST00000462780 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
RUSC1-206ENST00000462780 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.72
RUSC1-206ENST00000462780 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.75■■□□□ 1.71
RUSC1-206ENST00000462780 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.74■■□□□ 1.71
RUSC1-206ENST00000462780 ADAMTS12P58397 1594 aa25.73■■□□□ 1.71
RUSC1-206ENST00000462780 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
RUSC1-206ENST00000462780 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.71■■□□□ 1.71
RUSC1-206ENST00000462780 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.69■■□□□ 1.7
RUSC1-206ENST00000462780 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RUSC1-206ENST00000462780 CHD1O14646 1710 aa25.68■■□□□ 1.7
RUSC1-206ENST00000462780 SYNJ2O15056 1496 aa25.67■■□□□ 1.7
RUSC1-206ENST00000462780 FBLN2P98095 1184 aa25.66■■□□□ 1.7
RUSC1-206ENST00000462780 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.64■■□□□ 1.69
RUSC1-206ENST00000462780 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
RUSC1-206ENST00000462780 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.62■■□□□ 1.69
RUSC1-206ENST00000462780 FMN1Q68DA7 1419 aa25.61■■□□□ 1.69
RUSC1-206ENST00000462780 MAPKBP1O60336 1514 aa25.58■■□□□ 1.69
RUSC1-206ENST00000462780 GRIN2AQ12879 1464 aa25.58■■□□□ 1.69
RUSC1-206ENST00000462780 SAMD9Q5K651 1589 aa25.57■■□□□ 1.68
RUSC1-206ENST00000462780 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.49■■□□□ 1.67
RUSC1-206ENST00000462780 CEP170Q5SW79 1584 aa25.48■■□□□ 1.67
RUSC1-206ENST00000462780 OSCARQ8IYS5 282 aa25.47■■□□□ 1.67
RUSC1-206ENST00000462780 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.45■■□□□ 1.67
RUSC1-206ENST00000462780 NUP160Q12769 1436 aa25.45■■□□□ 1.66
RUSC1-206ENST00000462780 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.665e-6■■■■■ 46.2
RUSC1-206ENST00000462780 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.44■■□□□ 1.66
RUSC1-206ENST00000462780 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.44■■□□□ 1.66
RUSC1-206ENST00000462780 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.38■■□□□ 1.65
RUSC1-206ENST00000462780 NCOA2Q15596 1464 aa25.36■■□□□ 1.65
RUSC1-206ENST00000462780 IQGAP2Q13576 1575 aa25.36■■□□□ 1.65
RUSC1-206ENST00000462780 PTPRKQ15262 1439 aa25.34■■□□□ 1.65
RUSC1-206ENST00000462780 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.31■■□□□ 1.64
RUSC1-206ENST00000462780 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.3■■□□□ 1.64
RUSC1-206ENST00000462780 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.28■■□□□ 1.64
RUSC1-206ENST00000462780 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RUSC1-206ENST00000462780 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.28■■□□□ 1.64
RUSC1-206ENST00000462780 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.26■■□□□ 1.63
RUSC1-206ENST00000462780 HFM1A2PYH4 1435 aa25.24■■□□□ 1.63
RUSC1-206ENST00000462780 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.24■■□□□ 1.63
RUSC1-206ENST00000462780 ARID3CA6NKF2 412 aa25.23■■□□□ 1.63
RUSC1-206ENST00000462780 SHROOM2Q13796 1616 aa25.22■■□□□ 1.63
RUSC1-206ENST00000462780 HECW1Q76N89 1606 aa25.22■■□□□ 1.63
RUSC1-206ENST00000462780 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.21■■□□□ 1.63
RUSC1-206ENST00000462780 JPH4Q96JJ6 628 aa25.2■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.2■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 ARHGEF11O15085 1522 aa25.19■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 NAIPQ13075 1403 aa25.19■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.17■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 UACAQ9BZF9 1416 aa25.16■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.15■■□□□ 1.62
RUSC1-206ENST00000462780 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.13■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.12■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 KIAA0556O60303 1618 aa25.1■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 TONSLQ96HA7 1378 aa25.08■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RUSC1-206ENST00000462780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.07■■□□□ 1.6
RUSC1-206ENST00000462780 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.07■■□□□ 1.6
RUSC1-206ENST00000462780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.07■■□□□ 1.6
RUSC1-206ENST00000462780 DISP1Q96F81 1524 aa25.07■■□□□ 1.6
RUSC1-206ENST00000462780 KCNH8Q96L42 1107 aa25.05■■□□□ 1.6
RUSC1-206ENST00000462780 MIA2Q96PC5 1412 aa24.99■■□□□ 1.59
RUSC1-206ENST00000462780 TRIM52Q96A61 297 aa24.97■■□□□ 1.59
RUSC1-206ENST00000462780 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms