RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461758.6

TLE4-213, Transcript of transducin like enhancer of split 4, human

TSL 5

Gene TLE4, Length 1,536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE4-213	ENST00000461758	CEP170	Q5SW79	1584 aa		45.12	■■■■■ 4.81
TLE4-213	ENST00000461758	NUP160	Q12769	1436 aa		45.1	■■■■■ 4.81
TLE4-213	ENST00000461758	KIF21B	O75037	1637 aa		45.06	■■■■■ 4.8
TLE4-213	ENST00000461758	ARAP1	Q96P48	1450 aa		44.98	■■■■■ 4.79
TLE4-213	ENST00000461758	GOLGA3	Q08378	1498 aa		44.92	■■■■■ 4.78
TLE4-213	ENST00000461758	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.91	■■■■■ 4.78
TLE4-213	ENST00000461758	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		44.88	■■■■■ 4.78
TLE4-213	ENST00000461758	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		44.85	■■■■■ 4.77
TLE4-213	ENST00000461758	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	44.84	■■■■■ 4.77
TLE4-213	ENST00000461758	SHROOM2	Q13796	1616 aa		44.84	■■■■■ 4.77
TLE4-213	ENST00000461758	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.76	■■■■■ 4.76
TLE4-213	ENST00000461758	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.76	■■■■■ 4.76
TLE4-213	ENST00000461758	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		44.74	■■■■■ 4.75
TLE4-213	ENST00000461758	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.73	■■■■■ 4.75
TLE4-213	ENST00000461758	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.55	■■■■■ 4.72
TLE4-213	ENST00000461758	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		44.54	■■■■■ 4.72
TLE4-213	ENST00000461758	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		44.51	■■■■■ 4.72
TLE4-213	ENST00000461758	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		44.5	■■■■■ 4.71
TLE4-213	ENST00000461758	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		44.48	■■■■■ 4.71
TLE4-213	ENST00000461758	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	44.42	■■■■■ 4.7
TLE4-213	ENST00000461758	DISP1	Q96F81	1524 aa		44.33	■■■■■ 4.69
TLE4-213	ENST00000461758	KIAA0556	O60303	1618 aa		44.27	■■■■■ 4.68
TLE4-213	ENST00000461758	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		44.23	■■■■■ 4.67
TLE4-213	ENST00000461758	P3H3	Q8IVL6	736 aa		44.21	■■■■■ 4.67
TLE4-213	ENST00000461758	SAMD9	Q5K651	1589 aa		44.21	■■■■■ 4.67
TLE4-213	ENST00000461758	PTPRG	P23470	1445 aa		44.17	■■■■■ 4.66
TLE4-213	ENST00000461758	CLIP1	P30622	1438 aa		44.14	■■■■■ 4.66
TLE4-213	ENST00000461758	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	44.14	■■■■■ 4.66
TLE4-213	ENST00000461758	CEP162	Q5TB80	1403 aa		44.1	■■■■■ 4.65
TLE4-213	ENST00000461758	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		44.08	■■■■■ 4.65
TLE4-213	ENST00000461758	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		44.03	■■■■■ 4.64
TLE4-213	ENST00000461758	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	44.02	■■■■■ 4.64
TLE4-213	ENST00000461758	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.99	■■■■■ 4.63
TLE4-213	ENST00000461758	FMN1	Q68DA7	1419 aa		43.88	■■■■■ 4.62
TLE4-213	ENST00000461758	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.86	■■■■■ 4.61
TLE4-213	ENST00000461758	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.79	■■■■■ 4.6
TLE4-213	ENST00000461758	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.75	■■■■■ 4.59
TLE4-213	ENST00000461758	ABCA8	O94911	1581 aa		43.74	■■■■■ 4.59
TLE4-213	ENST00000461758	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.72	■■■■■ 4.59
TLE4-213	ENST00000461758	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.72	■■■■■ 4.59
TLE4-213	ENST00000461758	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.71	■■■■■ 4.59
TLE4-213	ENST00000461758	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.69	■■■■■ 4.58
TLE4-213	ENST00000461758	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		43.67	■■■■■ 4.58
TLE4-213	ENST00000461758	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	43.63	■■■■■ 4.57
TLE4-213	ENST00000461758	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.56	■■■■■ 4.56
TLE4-213	ENST00000461758	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.53	■■■■■ 4.56
TLE4-213	ENST00000461758	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.52	■■■■■ 4.56
TLE4-213	ENST00000461758	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	43.51	■■■■■ 4.56
TLE4-213	ENST00000461758	HECW1	Q76N89	1606 aa		43.51	■■■■■ 4.56
TLE4-213	ENST00000461758	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.51	■■■■■ 4.56
TLE4-213	ENST00000461758	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.49	■■■■■ 4.55
TLE4-213	ENST00000461758	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TLE4-213	ENST00000461758	ARID3C	A6NKF2	412 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TLE4-213	ENST00000461758	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
TLE4-213	ENST00000461758	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
TLE4-213	ENST00000461758	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	43.47	■■■■■ 4.55
TLE4-213	ENST00000461758	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
TLE4-213	ENST00000461758	ATP10B	O94823	1461 aa		43.43	■■■■■ 4.54
TLE4-213	ENST00000461758	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.37	■■■■■ 4.53
TLE4-213	ENST00000461758	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.36	■■■■■ 4.53
TLE4-213	ENST00000461758	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.35	■■■■■ 4.53
TLE4-213	ENST00000461758	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.33	■■■■■ 4.53
TLE4-213	ENST00000461758	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	43.31	■■■■■ 4.52
TLE4-213	ENST00000461758	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	43.27	■■■■■ 4.52
TLE4-213	ENST00000461758	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		43.27	■■■■■ 4.52
TLE4-213	ENST00000461758	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.26	■■■■■ 4.52
TLE4-213	ENST00000461758	APLP2	Q06481	763 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TLE4-213	ENST00000461758	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.18	■■■■■ 4.5
TLE4-213	ENST00000461758	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		43.17	■■■■■ 4.5
TLE4-213	ENST00000461758	GLI2	P10070	1586 aa		43.16	■■■■■ 4.5
TLE4-213	ENST00000461758	KCNH8	Q96L42	1107 aa		43.09	■■■■■ 4.49
TLE4-213	ENST00000461758	MAP3K1	Q13233	1512 aa		43.05	■■■■■ 4.48
TLE4-213	ENST00000461758	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.05	■■■■■ 4.48
TLE4-213	ENST00000461758	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		43.03	■■■■■ 4.48
TLE4-213	ENST00000461758	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.02	■■■■■ 4.48
TLE4-213	ENST00000461758	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
TLE4-213	ENST00000461758	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.01	■■■■■ 4.48
TLE4-213	ENST00000461758	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.98	■■■■■ 4.47
TLE4-213	ENST00000461758	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TLE4-213	ENST00000461758	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.87	■■■■■ 4.45
TLE4-213	ENST00000461758	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.86	■■■■■ 4.45
TLE4-213	ENST00000461758	KDM6B	O15054	1643 aa		42.86	■■■■■ 4.45
TLE4-213	ENST00000461758	KIF14	Q15058	1648 aa		42.84	■■■■■ 4.45
TLE4-213	ENST00000461758	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.83	■■■■■ 4.45
TLE4-213	ENST00000461758	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.76	■■■■■ 4.44
TLE4-213	ENST00000461758	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.74	■■■■■ 4.43
TLE4-213	ENST00000461758	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.74	■■■■■ 4.43
TLE4-213	ENST00000461758	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.73	■■■■■ 4.43
TLE4-213	ENST00000461758	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
TLE4-213	ENST00000461758	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TLE4-213	ENST00000461758	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TLE4-213	ENST00000461758	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TLE4-213	ENST00000461758	PLCH2	O75038	1416 aa		42.56	■■■■■ 4.4
TLE4-213	ENST00000461758	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
TLE4-213	ENST00000461758	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
TLE4-213	ENST00000461758	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		42.53	■■■■■ 4.4
TLE4-213	ENST00000461758	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
TLE4-213	ENST00000461758	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.49	■■■■■ 4.39
TLE4-213	ENST00000461758	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.48	■■■■■ 4.39
TLE4-213	ENST00000461758	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39

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