RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446477.6

PRRT4-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRRT4, Length 3,544 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-201ENST00000446477 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.02■■□□□ 1.44
PRRT4-201ENST00000446477 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRT4-201ENST00000446477 HMGXB3Q12766 1538 aa24■■□□□ 1.43
PRRT4-201ENST00000446477 TRIM52Q96A61 297 aa23.97■■□□□ 1.43
PRRT4-201ENST00000446477 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.97■■□□□ 1.43
PRRT4-201ENST00000446477 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PRRT4-201ENST00000446477 KCNH8Q96L42 1107 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT4-201ENST00000446477 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.89■■□□□ 1.42
PRRT4-201ENST00000446477 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PRRT4-201ENST00000446477 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-201ENST00000446477 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-201ENST00000446477 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-201ENST00000446477 TOPBP1Q92547 1522 aa23.83■■□□□ 1.4
PRRT4-201ENST00000446477 MIER1Q8N108 512 aa23.82■■□□□ 1.4
PRRT4-201ENST00000446477 TOP2BQ02880 1626 aa23.81■■□□□ 1.4
PRRT4-201ENST00000446477 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PRRT4-201ENST00000446477 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.8■■□□□ 1.4
PRRT4-201ENST00000446477 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PRRT4-201ENST00000446477 ARAP1Q96P48 1450 aa23.75■■□□□ 1.39
PRRT4-201ENST00000446477 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PRRT4-201ENST00000446477 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PRRT4-201ENST00000446477 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PRRT4-201ENST00000446477 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT4-201ENST00000446477 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.72■■□□□ 1.39
PRRT4-201ENST00000446477 BCANQ96GW7 911 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRT4-201ENST00000446477 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PRRT4-201ENST00000446477 PRXQ9BXM0 1461 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRT4-201ENST00000446477 KIF21BO75037 1637 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT4-201ENST00000446477 FOXD1Q16676 465 aa23.64■■□□□ 1.38
PRRT4-201ENST00000446477 JPH4Q96JJ6 628 aa23.63■■□□□ 1.37
PRRT4-201ENST00000446477 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.59■■□□□ 1.37
PRRT4-201ENST00000446477 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.36
PRRT4-201ENST00000446477 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT4-201ENST00000446477 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT4-201ENST00000446477 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PRRT4-201ENST00000446477 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT4-201ENST00000446477 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PRRT4-201ENST00000446477 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PRRT4-201ENST00000446477 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT4-201ENST00000446477 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT4-201ENST00000446477 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRRT4-201ENST00000446477 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT4-201ENST00000446477 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT4-201ENST00000446477 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT4-201ENST00000446477 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRRT4-201ENST00000446477 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.38■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.36■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.35■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.34■■□□□ 1.33
PRRT4-201ENST00000446477 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.31■■□□□ 1.32
PRRT4-201ENST00000446477 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
PRRT4-201ENST00000446477 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PRRT4-201ENST00000446477 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PRRT4-201ENST00000446477 GRIN2BQ13224 1484 aa23.26■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 RGL3Q3MIN7 710 aa23.26■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 FKBP8Q14318 412 aa23.25■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 FMN1Q68DA7 1419 aa23.24■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 TSPY4P0CV99 314 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 TSPY10P0CW01 314 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.22■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.31
PRRT4-201ENST00000446477 MSH5O43196 834 aa23.18■■□□□ 1.3
PRRT4-201ENST00000446477 NEFLP07196 543 aa23.18■■□□□ 1.3
PRRT4-201ENST00000446477 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.17■■□□□ 1.3
PRRT4-201ENST00000446477 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PRRT4-201ENST00000446477 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PRRT4-201ENST00000446477 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PRRT4-201ENST00000446477 TONSLQ96HA7 1378 aa23.14■■□□□ 1.3
PRRT4-201ENST00000446477 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 PRDM2Q13029 1718 aa23.13■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.13■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 IFT140Q96RY7 1462 aa23.13■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 PTPRGP23470 1445 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.08■■□□□ 1.29
PRRT4-201ENST00000446477 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.07■■□□□ 1.28
PRRT4-201ENST00000446477 NBR1Q14596 966 aa23.06■■□□□ 1.28
PRRT4-201ENST00000446477 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PRRT4-201ENST00000446477 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT4-201ENST00000446477 OSCARQ8IYS5 282 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT4-201ENST00000446477 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.97■■□□□ 1.27
PRRT4-201ENST00000446477 NCOA2Q15596 1464 aa22.97■■□□□ 1.27
PRRT4-201ENST00000446477 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.96■■□□□ 1.27
PRRT4-201ENST00000446477 GRIN2AQ12879 1464 aa22.96■■□□□ 1.27
PRRT4-201ENST00000446477 PKD2Q13563 968 aa22.96■■□□□ 1.27
PRRT4-201ENST00000446477 MLECQ14165 292 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT4-201ENST00000446477 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT4-201ENST00000446477 AFAP1Q8N556 730 aa22.92■■□□□ 1.26
PRRT4-201ENST00000446477 TIAM1Q13009 1591 aa22.9■■□□□ 1.26
PRRT4-201ENST00000446477 GGT6Q6P531 493 aa22.89■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.87■■□□□ 1.25
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