RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 CUX2O14529 1486 aa26.02■■□□□ 1.76
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PTPRJ-202ENST00000440289 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-202ENST00000440289 NEFLP07196 543 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-202ENST00000440289 NESP48681 1621 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-202ENST00000440289 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
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PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-202ENST00000440289 IGF1RP08069 1367 aa25.9■■□□□ 1.74
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PTPRJ-202ENST00000440289 ANP32CO43423 234 aa25.86■■□□□ 1.73
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PTPRJ-202ENST00000440289 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.81■■□□□ 1.72
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PTPRJ-202ENST00000440289 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRJ-202ENST00000440289 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.77■■□□□ 1.72
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PTPRJ-202ENST00000440289 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.66■■□□□ 1.7
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PTPRJ-202ENST00000440289 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.65■■□□□ 1.7
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PTPRJ-202ENST00000440289 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-202ENST00000440289 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-202ENST00000440289 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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PTPRJ-202ENST00000440289 TIAM1Q13009 1591 aa25.46■■□□□ 1.67
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PTPRJ-202ENST00000440289 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.42■■□□□ 1.66
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PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC184Q52MB2 194 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRJ-202ENST00000440289 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRJ-202ENST00000440289 CCER2I3L3R5 266 aa25.34■■□□□ 1.65
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PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.27■■□□□ 1.64
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PTPRJ-202ENST00000440289 BCL11AQ9H165 835 aa25.24■■□□□ 1.63
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PTPRJ-202ENST00000440289 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-202ENST00000440289 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-202ENST00000440289 MSH5O43196 834 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-202ENST00000440289 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.19■■□□□ 1.62
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PTPRJ-202ENST00000440289 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PTPRJ-202ENST00000440289 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-202ENST00000440289 CUL7Q14999 1698 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-202ENST00000440289 FBLN2P98095 1184 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-202ENST00000440289 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRJ-202ENST00000440289 NBR1Q14596 966 aa25.08■■□□□ 1.61
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PTPRJ-202ENST00000440289 FMN1Q68DA7 1419 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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PTPRJ-202ENST00000440289 NAIPQ13075 1403 aa25.04■■□□□ 1.6
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PTPRJ-202ENST00000440289 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
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PTPRJ-202ENST00000440289 HFM1A2PYH4 1435 aa24.99■■□□□ 1.59
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PTPRJ-202ENST00000440289 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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PTPRJ-202ENST00000440289 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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