RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SH3BP2-202ENST00000435136 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
SH3BP2-202ENST00000435136 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
SH3BP2-202ENST00000435136 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
SH3BP2-202ENST00000435136 PBRM1Q86U86 1689 aa28.7■■■□□ 2.18
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP2-202ENST00000435136 CHD1O14646 1710 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP2-202ENST00000435136 SYNJ2O15056 1496 aa28.63■■■□□ 2.17
SH3BP2-202ENST00000435136 APLP2Q06481 763 aa28.63■■■□□ 2.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-202ENST00000435136 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP2-202ENST00000435136 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SH3BP2-202ENST00000435136 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTS12P58397 1594 aa28.5■■■□□ 2.15
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP3K1Q13233 1512 aa28.5■■■□□ 2.15
SH3BP2-202ENST00000435136 GRIN2AQ12879 1464 aa28.47■■■□□ 2.15
SH3BP2-202ENST00000435136 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SH3BP2-202ENST00000435136 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGEF11O15085 1522 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP2-202ENST00000435136 NUP160Q12769 1436 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP170Q5SW79 1584 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP2-202ENST00000435136 TIAM1Q13009 1591 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP2-202ENST00000435136 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP2-202ENST00000435136 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP2-202ENST00000435136 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SAMD9Q5K651 1589 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP2-202ENST00000435136 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP2-202ENST00000435136 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 FMN1Q68DA7 1419 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SH3BP2-202ENST00000435136 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2-202ENST00000435136 JPH4Q96JJ6 628 aa28.17■■■□□ 2.1
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP2-202ENST00000435136 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-202ENST00000435136 IQGAP2Q13576 1575 aa28.11■■■□□ 2.09
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2-202ENST00000435136 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SH3BP2-202ENST00000435136 SHROOM2Q13796 1616 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP2-202ENST00000435136 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SH3BP2-202ENST00000435136 P3H3Q8IVL6 736 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP2-202ENST00000435136 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.01■■■□□ 2.08
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP2-202ENST00000435136 HECW1Q76N89 1606 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP2-202ENST00000435136 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.052e-6■□□□□ 10.9
SH3BP2-202ENST00000435136 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2-202ENST00000435136 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP2-202ENST00000435136 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA0556O60303 1618 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-202ENST00000435136 DISP1Q96F81 1524 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-202ENST00000435136 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.76■■■□□ 2.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRGP23470 1445 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP2-202ENST00000435136 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-202ENST00000435136 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
SH3BP2-202ENST00000435136 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP2-202ENST00000435136 NCOA2Q15596 1464 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP2-202ENST00000435136 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP2-202ENST00000435136 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.57■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
SH3BP2-202ENST00000435136 ITGAEP38570 1179 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-202ENST00000435136 UACAQ9BZF9 1416 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-202ENST00000435136 MIA2Q96PC5 1412 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-202ENST00000435136 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-202ENST00000435136 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2-202ENST00000435136 HFM1A2PYH4 1435 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCC2Q92887 1545 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-202ENST00000435136 MAPKBP1O60336 1514 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCA8O94911 1581 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-202ENST00000435136 AKNAQ7Z591 1439 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-202ENST00000435136 ARID3CA6NKF2 412 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-202ENST00000435136 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRKQ15262 1439 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-202ENST00000435136 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.33■■□□□ 1.96
SH3BP2-202ENST00000435136 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-202ENST00000435136 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP2-202ENST00000435136 ASXL2Q76L83 1435 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-202ENST00000435136 NAIPQ13075 1403 aa27.28■■□□□ 1.96
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