RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430570.5

CPNE1-212, Transcript of copine 1, humanhuman

TSL 5

Gene CPNE1, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1-212ENST00000430570 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
CPNE1-212ENST00000430570 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
CPNE1-212ENST00000430570 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.71■■■■■ 4.27
CPNE1-212ENST00000430570 JPH4Q96JJ6 628 aa41.66■■■■■ 4.26
CPNE1-212ENST00000430570 SHROOM2Q13796 1616 aa41.64■■■■■ 4.26
CPNE1-212ENST00000430570 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.57■■■■■ 4.24
CPNE1-212ENST00000430570 KIF21BO75037 1637 aa41.53■■■■■ 4.24
CPNE1-212ENST00000430570 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CPNE1-212ENST00000430570 IQGAP2Q13576 1575 aa41.51■■■■■ 4.24
CPNE1-212ENST00000430570 ARAP1Q96P48 1450 aa41.47■■■■■ 4.23
CPNE1-212ENST00000430570 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.46■■■■■ 4.23
CPNE1-212ENST00000430570 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.44■■■■■ 4.23
CPNE1-212ENST00000430570 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.43■■■■■ 4.22
CPNE1-212ENST00000430570 GOLGA3Q08378 1498 aa41.31■■■■■ 4.2
CPNE1-212ENST00000430570 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.31■■■■■ 4.2
CPNE1-212ENST00000430570 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
CPNE1-212ENST00000430570 DISP1Q96F81 1524 aa41.25■■■■■ 4.19
CPNE1-212ENST00000430570 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.22■■■■■ 4.19
CPNE1-212ENST00000430570 KIAA0556O60303 1618 aa41.13■■■■■ 4.17
CPNE1-212ENST00000430570 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
CPNE1-212ENST00000430570 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.11■■■■■ 4.17
CPNE1-212ENST00000430570 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CPNE1-212ENST00000430570 PTPRGP23470 1445 aa41.06■■■■■ 4.16
CPNE1-212ENST00000430570 P3H3Q8IVL6 736 aa41.01■■■■■ 4.16
CPNE1-212ENST00000430570 SAMD9Q5K651 1589 aa40.97■■■■■ 4.15
CPNE1-212ENST00000430570 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.92■■■■■ 4.14
CPNE1-212ENST00000430570 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.82■■■■■ 4.13
CPNE1-212ENST00000430570 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.81■■■■■ 4.12
CPNE1-212ENST00000430570 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.81■■■■■ 4.12
CPNE1-212ENST00000430570 UACAQ9BZF9 1416 aa40.79■■■■■ 4.12
CPNE1-212ENST00000430570 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.77■■■■■ 4.12
CPNE1-212ENST00000430570 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.74■■■■■ 4.11
CPNE1-212ENST00000430570 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
CPNE1-212ENST00000430570 ABCC2Q92887 1545 aa40.68■■■■■ 4.1
CPNE1-212ENST00000430570 ABCA8O94911 1581 aa40.68■■■■■ 4.1
CPNE1-212ENST00000430570 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.1
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CPNE1-212ENST00000430570 CEP162Q5TB80 1403 aa40.53■■■■■ 4.08
CPNE1-212ENST00000430570 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.52■■■■■ 4.08
CPNE1-212ENST00000430570 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.51■■■■■ 4.07
CPNE1-212ENST00000430570 ARID3CA6NKF2 412 aa40.45■■■■■ 4.07
CPNE1-212ENST00000430570 FMN1Q68DA7 1419 aa40.45■■■■■ 4.07
CPNE1-212ENST00000430570 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
CPNE1-212ENST00000430570 MAPKBP1O60336 1514 aa40.44■■■■■ 4.06
CPNE1-212ENST00000430570 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
CPNE1-212ENST00000430570 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CPNE1-212ENST00000430570 ATP10BO94823 1461 aa40.38■■■■■ 4.06
CPNE1-212ENST00000430570 ASXL2Q76L83 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
CPNE1-212ENST00000430570 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
CPNE1-212ENST00000430570 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.26■■■■■ 4.04
CPNE1-212ENST00000430570 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
CPNE1-212ENST00000430570 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
CPNE1-212ENST00000430570 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CPNE1-212ENST00000430570 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.22■■■■■ 4.03
CPNE1-212ENST00000430570 HECW1Q76N89 1606 aa40.21■■■■■ 4.03
CPNE1-212ENST00000430570 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.2■■■■■ 4.03
CPNE1-212ENST00000430570 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.19■■■■■ 4.02
CPNE1-212ENST00000430570 DIP2BQ9P265 1576 aa40.19■■■■■ 4.02
CPNE1-212ENST00000430570 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.18■■■■■ 4.02
CPNE1-212ENST00000430570 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CPNE1-212ENST00000430570 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CPNE1-212ENST00000430570 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.11■■■■■ 4.01
CPNE1-212ENST00000430570 KCNH8Q96L42 1107 aa40.11■■■■■ 4.01
CPNE1-212ENST00000430570 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.1■■■■■ 4.01
CPNE1-212ENST00000430570 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.04■■■■■ 4
CPNE1-212ENST00000430570 GLI2P10070 1586 aa40.03■■■■■ 4
CPNE1-212ENST00000430570 VPS8Q8N3P4 1428 aa40■■■■□ 3.99
CPNE1-212ENST00000430570 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.96■■■■□ 3.99
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CPNE1-212ENST00000430570 TSPOAP1O95153 1857 aa39.88■■■■□ 3.97
CPNE1-212ENST00000430570 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.86■■■■□ 3.97
CPNE1-212ENST00000430570 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.82■■■■□ 3.97
CPNE1-212ENST00000430570 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
CPNE1-212ENST00000430570 CD109Q6YHK3 1445 aa39.79■■■■□ 3.96
CPNE1-212ENST00000430570 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.79■■■■□ 3.96
CPNE1-212ENST00000430570 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
CPNE1-212ENST00000430570 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.79■■■■□ 3.96
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CPNE1-212ENST00000430570 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.68■■■■□ 3.94
CPNE1-212ENST00000430570 TIAM1Q13009 1591 aa39.66■■■■□ 3.94
CPNE1-212ENST00000430570 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.64■■■■□ 3.94
CPNE1-212ENST00000430570 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.61■■■■□ 3.93
CPNE1-212ENST00000430570 MAP3K1Q13233 1512 aa39.57■■■■□ 3.93
CPNE1-212ENST00000430570 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.54■■■■□ 3.92
CPNE1-212ENST00000430570 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
CPNE1-212ENST00000430570 APLP2Q06481 763 aa39.51■■■■□ 3.92
CPNE1-212ENST00000430570 PLCH2O75038 1416 aa39.51■■■■□ 3.92
CPNE1-212ENST00000430570 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.51■■■■□ 3.92
CPNE1-212ENST00000430570 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
CPNE1-212ENST00000430570 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.46■■■■□ 3.91
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CPNE1-212ENST00000430570 FANCAO15360 1455 aa39.42■■■■□ 3.9
CPNE1-212ENST00000430570 NEO1Q92859 1461 aa39.41■■■■□ 3.9
CPNE1-212ENST00000430570 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.37■■■■□ 3.89
CPNE1-212ENST00000430570 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.37■■■■□ 3.89
CPNE1-212ENST00000430570 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
CPNE1-212ENST00000430570 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.37■■■■□ 3.89
CPNE1-212ENST00000430570 NCOA2Q15596 1464 aa39.36■■■■□ 3.89
CPNE1-212ENST00000430570 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
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