RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYNJ2O15056 1496 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRXQ9BXM0 1461 aa16.72■□□□□ 0.27
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UACAQ9BZF9 1416 aa16.11■□□□□ 0.17
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIAM1Q13009 1591 aa15.98■□□□□ 0.15
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.96■□□□□ 0.15
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP10BO94823 1461 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.92■□□□□ 0.14
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.86■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF14Q15058 1648 aa15.86■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASXL2Q76L83 1435 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAPKBP1O60336 1514 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNH8Q96L42 1107 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCOA2Q15596 1464 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.73■□□□□ 0.11
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