RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.76■■□□□ 1.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR97A6NE52 1622 aa26.6■■□□□ 1.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.59■■□□□ 1.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.53■■□□□ 1.84
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGAEP38570 1179 aa26.51■■□□□ 1.83
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.5■■□□□ 1.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.49■■□□□ 1.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.48■■□□□ 1.83
RALGPS1-208ENST00000424082 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CUL7Q14999 1698 aa26.46■■□□□ 1.83
RALGPS1-208ENST00000424082 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.42■■□□□ 1.82
RALGPS1-208ENST00000424082 P3H3Q8IVL6 736 aa26.4■■□□□ 1.82
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.37■■□□□ 1.81
RALGPS1-208ENST00000424082 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPKBP1O60336 1514 aa26.33■■□□□ 1.81
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR62O43379 1518 aa26.31■■□□□ 1.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ERCC6Q03468 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TIAM1Q13009 1591 aa26.3■■□□□ 1.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.29■■□□□ 1.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.27■■□□□ 1.8
RALGPS1-208ENST00000424082 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.27■■□□□ 1.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNH8Q96L42 1107 aa26.26■■□□□ 1.79
RALGPS1-208ENST00000424082 PBRM1Q86U86 1689 aa26.25■■□□□ 1.79
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K1Q13233 1512 aa26.21■■□□□ 1.79
RALGPS1-208ENST00000424082 IFT140Q96RY7 1462 aa26.21■■□□□ 1.79
RALGPS1-208ENST00000424082 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.21■■□□□ 1.79
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.2■■□□□ 1.79
RALGPS1-208ENST00000424082 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.2■■□□□ 1.79
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.16■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.15■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIN2BQ13224 1484 aa26.15■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.15■■□□□ 1.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS12P58397 1594 aa26.13■■□□□ 1.77
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SAMD9Q5K651 1589 aa26.06■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.06■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 BCANQ96GW7 911 aa26.04■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.03■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.02■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP8Q14318 412 aa26.02■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.01■■□□□ 1.76
RALGPS1-208ENST00000424082 FMN1Q68DA7 1419 aa26■■□□□ 1.75
RALGPS1-208ENST00000424082 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
RALGPS1-208ENST00000424082 IQGAP2Q13576 1575 aa25.95■■□□□ 1.75
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.91■■□□□ 1.74
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIN2AQ12879 1464 aa25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.87■■□□□ 1.73
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL11AQ9H165 835 aa25.86■■□□□ 1.73
RALGPS1-208ENST00000424082 FBLN2P98095 1184 aa25.84■■□□□ 1.73
RALGPS1-208ENST00000424082 NEFLP07196 543 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.81■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM52Q96A61 297 aa25.8■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.8■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CCER2I3L3R5 266 aa25.8■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNJ2O15056 1496 aa25.78■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.78■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ANP32CO43423 234 aa25.78■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.77■■□□□ 1.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TONSLQ96HA7 1378 aa25.75■■□□□ 1.71
RALGPS1-208ENST00000424082 DISP1Q96F81 1524 aa25.75■■□□□ 1.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP170Q5SW79 1584 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ARID3CA6NKF2 412 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRKQ15262 1439 aa25.72■■□□□ 1.71
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0556O60303 1618 aa25.7■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.69■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 HFM1A2PYH4 1435 aa25.68■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 UACAQ9BZF9 1416 aa25.67■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 HECW1Q76N89 1606 aa25.66■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.66■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 NCOA2Q15596 1464 aa25.64■■□□□ 1.7
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP160Q12769 1436 aa25.63■■□□□ 1.69
RALGPS1-208ENST00000424082 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.61■■□□□ 1.69
RALGPS1-208ENST00000424082 NAIPQ13075 1403 aa25.61■■□□□ 1.69
RALGPS1-208ENST00000424082 JPH4Q96JJ6 628 aa25.59■■□□□ 1.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.57■■□□□ 1.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MSH5O43196 834 aa25.56■■□□□ 1.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.54■■□□□ 1.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF11O15085 1522 aa25.52■■□□□ 1.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms