RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP170Q5SW79 1584 aa27.2■■□□□ 1.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHD1O14646 1710 aa27.19■■□□□ 1.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP162Q5TB80 1403 aa27.17■■□□□ 1.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.15■■□□□ 1.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 IQGAP2Q13576 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLIP1P30622 1438 aa27.11■■□□□ 1.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSCARQ8IYS5 282 aa27.09■■□□□ 1.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.04■■□□□ 1.92
TOP3BP1-201ENST00000420768 JPH4Q96JJ6 628 aa27.03■■□□□ 1.92
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.03■■□□□ 1.92
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.01■■□□□ 1.91
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.99■■□□□ 1.91
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAMD9Q5K651 1589 aa26.93■■□□□ 1.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.93■■□□□ 1.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHROOM2Q13796 1616 aa26.9■■□□□ 1.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 DISP1Q96F81 1524 aa26.9■■□□□ 1.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARAP1Q96P48 1450 aa26.88■■□□□ 1.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 P3H3Q8IVL6 736 aa26.87■■□□□ 1.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0556O60303 1618 aa26.85■■□□□ 1.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.85■■□□□ 1.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.81■■□□□ 1.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 FMN1Q68DA7 1419 aa26.8■■□□□ 1.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRGP23470 1445 aa26.69■■□□□ 1.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.69■■□□□ 1.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.65■■□□□ 1.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.62■■□□□ 1.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF11O15085 1522 aa26.58■■□□□ 1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 APLP2Q06481 763 aa26.55■■□□□ 1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.55■■□□□ 1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 UACAQ9BZF9 1416 aa26.52■■□□□ 1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCA8O94911 1581 aa26.52■■□□□ 1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.51■■□□□ 1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 HECW1Q76N89 1606 aa26.5■■□□□ 1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K1Q13233 1512 aa26.48■■□□□ 1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.46■■□□□ 1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.46■■□□□ 1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC2Q92887 1545 aa26.44■■□□□ 1.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIAM1Q13009 1591 aa26.39■■□□□ 1.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP10BO94823 1461 aa26.34■■□□□ 1.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARID3CA6NKF2 412 aa26.33■■□□□ 1.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.33■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.32■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.31■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.31■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.29■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.29■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.28■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.27■■□□□ 1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.24■■□□□ 1.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.22■■□□□ 1.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.19■■□□□ 1.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.08■■□□□ 1.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASXL2Q76L83 1435 aa26.08■■□□□ 1.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOA2Q15596 1464 aa26.07■■□□□ 1.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPKBP1O60336 1514 aa26.04■■□□□ 1.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF14Q15058 1648 aa26.03■■□□□ 1.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.01■■□□□ 1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNH8Q96L42 1107 aa25.99■■□□□ 1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.98■■□□□ 1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.97■■□□□ 1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.96■■□□□ 1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIA2Q96PC5 1412 aa25.9■■□□□ 1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.89■■□□□ 1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.85■■□□□ 1.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.84■■□□□ 1.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLCH2O75038 1416 aa25.83■■□□□ 1.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.81■■□□□ 1.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLI2P10070 1586 aa25.8■■□□□ 1.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.79■■□□□ 1.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD109Q6YHK3 1445 aa25.77■■□□□ 1.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 PREX2Q70Z35 1606 aa25.76■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.76■■□□□ 1.71
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