RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.43■■■□□ 2.62
TMEM200B-201ENST00000420504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.42■■■□□ 2.62
TMEM200B-201ENST00000420504 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.41■■■□□ 2.62
TMEM200B-201ENST00000420504 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
TMEM200B-201ENST00000420504 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.36■■■□□ 2.61
TMEM200B-201ENST00000420504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.36■■■□□ 2.61
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.33■■■□□ 2.61
TMEM200B-201ENST00000420504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.29■■■□□ 2.6
TMEM200B-201ENST00000420504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
TMEM200B-201ENST00000420504 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.26■■■□□ 2.6
TMEM200B-201ENST00000420504 TOPBP1Q92547 1522 aa31.26■■■□□ 2.6
TMEM200B-201ENST00000420504 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.25■■■□□ 2.59
TMEM200B-201ENST00000420504 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.24■■■□□ 2.59
TMEM200B-201ENST00000420504 P3H3Q8IVL6 736 aa31.23■■■□□ 2.59
TMEM200B-201ENST00000420504 CUL7Q14999 1698 aa31.23■■■□□ 2.59
TMEM200B-201ENST00000420504 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.21■■■□□ 2.59
TMEM200B-201ENST00000420504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
TMEM200B-201ENST00000420504 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.19■■■□□ 2.58
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR97A6NE52 1622 aa31.14■■■□□ 2.58
TMEM200B-201ENST00000420504 NESP48681 1621 aa31.13■■■□□ 2.57
TMEM200B-201ENST00000420504 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
TMEM200B-201ENST00000420504 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.08■■■□□ 2.57
TMEM200B-201ENST00000420504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.04■■■□□ 2.56
TMEM200B-201ENST00000420504 FMN1Q68DA7 1419 aa31.03■■■□□ 2.56
TMEM200B-201ENST00000420504 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.02■■■□□ 2.56
TMEM200B-201ENST00000420504 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
TMEM200B-201ENST00000420504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
TMEM200B-201ENST00000420504 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.99■■■□□ 2.55
TMEM200B-201ENST00000420504 SAMD9Q5K651 1589 aa30.97■■■□□ 2.55
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.96■■■□□ 2.55
TMEM200B-201ENST00000420504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.96■■■□□ 2.55
TMEM200B-201ENST00000420504 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.95■■■□□ 2.54
TMEM200B-201ENST00000420504 KCNH8Q96L42 1107 aa30.95■■■□□ 2.54
TMEM200B-201ENST00000420504 MYT1Q01538 1121 aa30.89■■■□□ 2.54
TMEM200B-201ENST00000420504 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.86■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.85■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPRKQ15262 1439 aa30.84■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 GRIN2BQ13224 1484 aa30.84■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 HFM1A2PYH4 1435 aa30.84■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.83■■■□□ 2.53
TMEM200B-201ENST00000420504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.82■■■□□ 2.52
TMEM200B-201ENST00000420504 NCOA2Q15596 1464 aa30.8■■■□□ 2.52
TMEM200B-201ENST00000420504 UACAQ9BZF9 1416 aa30.78■■■□□ 2.52
TMEM200B-201ENST00000420504 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.77■■■□□ 2.52
TMEM200B-201ENST00000420504 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
TMEM200B-201ENST00000420504 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.74■■■□□ 2.51
TMEM200B-201ENST00000420504 NAIPQ13075 1403 aa30.73■■■□□ 2.51
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.73■■■□□ 2.51
TMEM200B-201ENST00000420504 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
TMEM200B-201ENST00000420504 TONSLQ96HA7 1378 aa30.69■■■□□ 2.5
TMEM200B-201ENST00000420504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.68■■■□□ 2.5
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGEF11O15085 1522 aa30.68■■■□□ 2.5
TMEM200B-201ENST00000420504 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.68■■■□□ 2.5
TMEM200B-201ENST00000420504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
TMEM200B-201ENST00000420504 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.65■■■□□ 2.5
TMEM200B-201ENST00000420504 CCER2I3L3R5 266 aa30.62■■■□□ 2.49
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.61■■■□□ 2.49
TMEM200B-201ENST00000420504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
TMEM200B-201ENST00000420504 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.55■■■□□ 2.48
TMEM200B-201ENST00000420504 ANP32CO43423 234 aa30.55■■■□□ 2.48
TMEM200B-201ENST00000420504 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.55■■■□□ 2.48
TMEM200B-201ENST00000420504 PBRM1Q86U86 1689 aa30.54■■■□□ 2.48
TMEM200B-201ENST00000420504 HECW1Q76N89 1606 aa30.53■■■□□ 2.48
TMEM200B-201ENST00000420504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.5■■■□□ 2.47
TMEM200B-201ENST00000420504 IQGAP2Q13576 1575 aa30.48■■■□□ 2.47
TMEM200B-201ENST00000420504 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
TMEM200B-201ENST00000420504 AKNAQ7Z591 1439 aa30.46■■■□□ 2.47
TMEM200B-201ENST00000420504 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TMEM200B-201ENST00000420504 ADAMTS12P58397 1594 aa30.44■■■□□ 2.46
TMEM200B-201ENST00000420504 BCANQ96GW7 911 aa30.44■■■□□ 2.46
TMEM200B-201ENST00000420504 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.42■■■□□ 2.46
TMEM200B-201ENST00000420504 FKBP8Q14318 412 aa30.41■■■□□ 2.46
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM6BO15054 1643 aa30.41■■■□□ 2.46
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR62O43379 1518 aa30.39■■■□□ 2.46
TMEM200B-201ENST00000420504 TRIM52Q96A61 297 aa30.38■■■□□ 2.45
TMEM200B-201ENST00000420504 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
TMEM200B-201ENST00000420504 MIA2Q96PC5 1412 aa30.38■■■□□ 2.45
TMEM200B-201ENST00000420504 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.37■■■□□ 2.45
TMEM200B-201ENST00000420504 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.25■■■□□ 2.43
TMEM200B-201ENST00000420504 NEFLP07196 543 aa30.24■■■□□ 2.43
TMEM200B-201ENST00000420504 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TMEM200B-201ENST00000420504 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.23■■■□□ 2.43
TMEM200B-201ENST00000420504 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.23■■■□□ 2.43
TMEM200B-201ENST00000420504 ROCK1Q13464 1354 aa30.17■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 DAPK1P53355 1430 aa30.17■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA0556O60303 1618 aa30.16■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 ARID3CA6NKF2 412 aa30.16■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 DISP1Q96F81 1524 aa30.15■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.14■■■□□ 2.42
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.12■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
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