RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 PRDM2Q13029 1718 aa30.57■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.56■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 MIER1Q8N108 512 aa30.55■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 ARID3CA6NKF2 412 aa30.49■■■□□ 2.47
SPRN-201ENST00000414069 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.43■■■□□ 2.46
SPRN-201ENST00000414069 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SPRN-201ENST00000414069 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.42■■■□□ 2.46
SPRN-201ENST00000414069 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SPRN-201ENST00000414069 BCL11AQ9H165 835 aa30.37■■■□□ 2.45
SPRN-201ENST00000414069 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.35■■■□□ 2.45
SPRN-201ENST00000414069 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.33■■■□□ 2.45
SPRN-201ENST00000414069 TIAM1Q13009 1591 aa30.3■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.3■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.29■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.26■■■□□ 2.43
SPRN-201ENST00000414069 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.24■■■□□ 2.43
SPRN-201ENST00000414069 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.21■■■□□ 2.43
SPRN-201ENST00000414069 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.16■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.14■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.11■■■□□ 2.41
SPRN-201ENST00000414069 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.09■■■□□ 2.41
SPRN-201ENST00000414069 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.08■■■□□ 2.41
SPRN-201ENST00000414069 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.07■■■□□ 2.4
SPRN-201ENST00000414069 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.02■■■□□ 2.4
SPRN-201ENST00000414069 FBLN2P98095 1184 aa30■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 CUL7Q14999 1698 aa29.99■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 FMN1Q68DA7 1419 aa29.98■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.97■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.95■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 MAP3K1Q13233 1512 aa29.93■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.93■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 MAPKBP1O60336 1514 aa29.93■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.91■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.91■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 KCNH8Q96L42 1107 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 WDR97A6NE52 1622 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 PTPRKQ15262 1439 aa29.84■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.82■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 TRIM52Q96A61 297 aa29.8■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 NCOA2Q15596 1464 aa29.79■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.73■■■□□ 2.35
SPRN-201ENST00000414069 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SPRN-201ENST00000414069 FOXD1Q16676 465 aa29.71■■■□□ 2.35
SPRN-201ENST00000414069 GRIN2BQ13224 1484 aa29.7■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.7■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 ERCC6Q03468 1493 aa29.69■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.67■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 SAMD9Q5K651 1589 aa29.67■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.67■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.66■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 TONSLQ96HA7 1378 aa29.64■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SPRN-201ENST00000414069 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SPRN-201ENST00000414069 PBRM1Q86U86 1689 aa29.6■■■□□ 2.33
SPRN-201ENST00000414069 IQGAP2Q13576 1575 aa29.59■■■□□ 2.33
SPRN-201ENST00000414069 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SPRN-201ENST00000414069 NAIPQ13075 1403 aa29.55■■■□□ 2.32
SPRN-201ENST00000414069 ADAMTS12P58397 1594 aa29.53■■■□□ 2.32
SPRN-201ENST00000414069 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SPRN-201ENST00000414069 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.52■■■□□ 2.32
SPRN-201ENST00000414069 HFM1A2PYH4 1435 aa29.5■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.48■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 IFT140Q96RY7 1462 aa29.47■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.46■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 UACAQ9BZF9 1416 aa29.44■■■□□ 2.3
SPRN-201ENST00000414069 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.43■■■□□ 2.3
SPRN-201ENST00000414069 HECW1Q76N89 1606 aa29.38■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.37■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 JPH4Q96JJ6 628 aa29.36■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 GRIN2AQ12879 1464 aa29.35■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 DISP1Q96F81 1524 aa29.35■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 KDM6BO15054 1643 aa29.34■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.34■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.33■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 WDR62O43379 1518 aa29.33■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 BCANQ96GW7 911 aa29.3■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.3■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 ANP32CO43423 234 aa29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms