RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
ATG4B-204ENST00000402096 FBLN2P98095 1184 aa32.53■■■□□ 2.8
ATG4B-204ENST00000402096 CHD1O14646 1710 aa32.43■■■□□ 2.78
ATG4B-204ENST00000402096 IQGAP2Q13576 1575 aa32.39■■■□□ 2.78
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.39■■■□□ 2.77
ATG4B-204ENST00000402096 CEP170Q5SW79 1584 aa32.37■■■□□ 2.77
ATG4B-204ENST00000402096 ARAP1Q96P48 1450 aa32.34■■■□□ 2.77
ATG4B-204ENST00000402096 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.32■■■□□ 2.76
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.32■■■□□ 2.76
ATG4B-204ENST00000402096 NUP160Q12769 1436 aa32.28■■■□□ 2.76
ATG4B-204ENST00000402096 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.28■■■□□ 2.76
ATG4B-204ENST00000402096 P3H3Q8IVL6 736 aa32.25■■■□□ 2.75
ATG4B-204ENST00000402096 SAMD9Q5K651 1589 aa32.25■■■□□ 2.75
ATG4B-204ENST00000402096 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.18■■■□□ 2.74
ATG4B-204ENST00000402096 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.18■■■□□ 2.74
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0556O60303 1618 aa32.07■■■□□ 2.72
ATG4B-204ENST00000402096 JPH4Q96JJ6 628 aa32.04■■■□□ 2.72
ATG4B-204ENST00000402096 DISP1Q96F81 1524 aa32.03■■■□□ 2.72
ATG4B-204ENST00000402096 APLP2Q06481 763 aa32.02■■■□□ 2.72
ATG4B-204ENST00000402096 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
ATG4B-204ENST00000402096 FMN1Q68DA7 1419 aa32.01■■■□□ 2.71
ATG4B-204ENST00000402096 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
ATG4B-204ENST00000402096 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.96■■■□□ 2.71
ATG4B-204ENST00000402096 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.95■■■□□ 2.71
ATG4B-204ENST00000402096 SHROOM2Q13796 1616 aa31.93■■■□□ 2.7
ATG4B-204ENST00000402096 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
ATG4B-204ENST00000402096 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
ATG4B-204ENST00000402096 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.9■■■□□ 2.7
ATG4B-204ENST00000402096 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.89■■■□□ 2.7
ATG4B-204ENST00000402096 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
ATG4B-204ENST00000402096 TIAM1Q13009 1591 aa31.8■■■□□ 2.68
ATG4B-204ENST00000402096 OSCARQ8IYS5 282 aa31.8■■■□□ 2.68
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.79■■■□□ 2.68
ATG4B-204ENST00000402096 HECW1Q76N89 1606 aa31.77■■■□□ 2.68
ATG4B-204ENST00000402096 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.77■■■□□ 2.68
ATG4B-204ENST00000402096 MAP3K1Q13233 1512 aa31.74■■■□□ 2.67
ATG4B-204ENST00000402096 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.74■■■□□ 2.67
ATG4B-204ENST00000402096 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.73■■■□□ 2.67
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
ATG4B-204ENST00000402096 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
ATG4B-204ENST00000402096 PTPRGP23470 1445 aa31.66■■■□□ 2.66
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.64■■■□□ 2.66
ATG4B-204ENST00000402096 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.64■■■□□ 2.66
ATG4B-204ENST00000402096 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.64■■■□□ 2.65
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.61■■■□□ 2.65
ATG4B-204ENST00000402096 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
ATG4B-204ENST00000402096 ABCA8O94911 1581 aa31.59■■■□□ 2.65
ATG4B-204ENST00000402096 ARID3CA6NKF2 412 aa31.59■■■□□ 2.65
ATG4B-204ENST00000402096 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
ATG4B-204ENST00000402096 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
ATG4B-204ENST00000402096 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.5■■■□□ 2.63
ATG4B-204ENST00000402096 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
ATG4B-204ENST00000402096 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
ATG4B-204ENST00000402096 UACAQ9BZF9 1416 aa31.47■■■□□ 2.63
ATG4B-204ENST00000402096 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.46■■■□□ 2.63
ATG4B-204ENST00000402096 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.43■■■□□ 2.62
ATG4B-204ENST00000402096 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
ATG4B-204ENST00000402096 ABCC2Q92887 1545 aa31.4■■■□□ 2.62
ATG4B-204ENST00000402096 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
ATG4B-204ENST00000402096 ATP10BO94823 1461 aa31.35■■■□□ 2.61
ATG4B-204ENST00000402096 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.3■■■□□ 2.6
ATG4B-204ENST00000402096 NCOA2Q15596 1464 aa31.3■■■□□ 2.6
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF11O15085 1522 aa31.29■■■□□ 2.6
ATG4B-204ENST00000402096 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.29■■■□□ 2.6
ATG4B-204ENST00000402096 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.25■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.23■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.2■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.2■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.2■■■□□ 2.59
ATG4B-204ENST00000402096 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.18■■■□□ 2.58
ATG4B-204ENST00000402096 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.18■■■□□ 2.58
ATG4B-204ENST00000402096 KIF14Q15058 1648 aa31.16■■■□□ 2.58
ATG4B-204ENST00000402096 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.15■■■□□ 2.58
ATG4B-204ENST00000402096 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.11■■■□□ 2.57
ATG4B-204ENST00000402096 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
ATG4B-204ENST00000402096 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.05■■■□□ 2.56
ATG4B-204ENST00000402096 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.03■■■□□ 2.56
ATG4B-204ENST00000402096 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
ATG4B-204ENST00000402096 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31■■■□□ 2.55
ATG4B-204ENST00000402096 ITGAEP38570 1179 aa31■■■□□ 2.55
ATG4B-204ENST00000402096 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.98■■■□□ 2.55
ATG4B-204ENST00000402096 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.98■■■□□ 2.55
ATG4B-204ENST00000402096 MIA2Q96PC5 1412 aa30.97■■■□□ 2.55
ATG4B-204ENST00000402096 KCNH8Q96L42 1107 aa30.97■■■□□ 2.55
ATG4B-204ENST00000402096 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.545e-9■■■■□ 24.7
ATG4B-204ENST00000402096 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
ATG4B-204ENST00000402096 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.93■■■□□ 2.54
ATG4B-204ENST00000402096 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.92■■■□□ 2.54
ATG4B-204ENST00000402096 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
ATG4B-204ENST00000402096 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
ATG4B-204ENST00000402096 ASXL2Q76L83 1435 aa30.89■■■□□ 2.54
ATG4B-204ENST00000402096 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
ATG4B-204ENST00000402096 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.88■■■□□ 2.53
ATG4B-204ENST00000402096 PREX2Q70Z35 1606 aa30.87■■■□□ 2.53
ATG4B-204ENST00000402096 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.84■■■□□ 2.53
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
ATG4B-204ENST00000402096 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms