RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.22■□□□□ 0.67
PRAME-201ENST00000398741 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
PRAME-201ENST00000398741 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.18■□□□□ 0.66
PRAME-201ENST00000398741 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-201ENST00000398741 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.16■□□□□ 0.66
PRAME-201ENST00000398741 ERCC6Q03468 1493 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 ITGAEP38570 1179 aa19.13■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 MAP3K1Q13233 1512 aa19.12■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 TIAM1Q13009 1591 aa19.11■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 WDR62O43379 1518 aa19.1■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.1■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 WDR97A6NE52 1622 aa19.09■□□□□ 0.65
PRAME-201ENST00000398741 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.06■□□□□ 0.64
PRAME-201ENST00000398741 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.05■□□□□ 0.64
PRAME-201ENST00000398741 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PRAME-201ENST00000398741 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-201ENST00000398741 P3H3Q8IVL6 736 aa18.98■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.98■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.98■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PRAME-201ENST00000398741 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.95■□□□□ 0.62
PRAME-201ENST00000398741 MAPKBP1O60336 1514 aa18.93■□□□□ 0.62
PRAME-201ENST00000398741 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.93■□□□□ 0.62
PRAME-201ENST00000398741 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.92■□□□□ 0.62
PRAME-201ENST00000398741 IFT140Q96RY7 1462 aa18.92■□□□□ 0.62
PRAME-201ENST00000398741 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.91■□□□□ 0.62
PRAME-201ENST00000398741 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.9■□□□□ 0.62
PRAME-201ENST00000398741 CUL7Q14999 1698 aa18.89■□□□□ 0.61
PRAME-201ENST00000398741 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PRAME-201ENST00000398741 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.88■□□□□ 0.61
PRAME-201ENST00000398741 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.612e-41■■■■■ 46.3
PRAME-201ENST00000398741 PBRM1Q86U86 1689 aa18.85■□□□□ 0.61
PRAME-201ENST00000398741 FMN1Q68DA7 1419 aa18.83■□□□□ 0.6
PRAME-201ENST00000398741 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.82■□□□□ 0.6
PRAME-201ENST00000398741 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.63e-13■■■■■ 30.1
PRAME-201ENST00000398741 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
PRAME-201ENST00000398741 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.8■□□□□ 0.6
PRAME-201ENST00000398741 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.77■□□□□ 0.6
PRAME-201ENST00000398741 GRIN2BQ13224 1484 aa18.76■□□□□ 0.59
PRAME-201ENST00000398741 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.75■□□□□ 0.59
PRAME-201ENST00000398741 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.74■□□□□ 0.59
PRAME-201ENST00000398741 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.74■□□□□ 0.59
PRAME-201ENST00000398741 ADAMTS12P58397 1594 aa18.72■□□□□ 0.59
PRAME-201ENST00000398741 SAMD9Q5K651 1589 aa18.69■□□□□ 0.58
PRAME-201ENST00000398741 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PRAME-201ENST00000398741 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
PRAME-201ENST00000398741 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.65■□□□□ 0.58
PRAME-201ENST00000398741 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PRAME-201ENST00000398741 HFM1A2PYH4 1435 aa18.63■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 NCOA2Q15596 1464 aa18.63■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.63■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 TONSLQ96HA7 1378 aa18.62■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 KCNH8Q96L42 1107 aa18.62■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 UACAQ9BZF9 1416 aa18.61■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.6■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 PTPRKQ15262 1439 aa18.6■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.59■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PRAME-201ENST00000398741 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.57■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 NAIPQ13075 1403 aa18.56■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 GRIN2AQ12879 1464 aa18.56■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 SYNJ2O15056 1496 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 MYT1Q01538 1121 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 ANP32CO43423 234 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-201ENST00000398741 CCER2I3L3R5 266 aa18.5■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 HECW1Q76N89 1606 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 ARHGEF11O15085 1522 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 IQGAP2Q13576 1575 aa18.48■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.47■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 CEP170Q5SW79 1584 aa18.47■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 FBLN2P98095 1184 aa18.46■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.46■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PRAME-201ENST00000398741 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.45■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.44■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 CHD1O14646 1710 aa18.43■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 NUP160Q12769 1436 aa18.43■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 TRIM52Q96A61 297 aa18.42■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 AKNAQ7Z591 1439 aa18.4■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 MIA2Q96PC5 1412 aa18.4■□□□□ 0.54
PRAME-201ENST00000398741 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.39■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 FKBP8Q14318 412 aa18.38■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 NEFLP07196 543 aa18.37■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.36■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 ARID3CA6NKF2 412 aa18.36■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 BCANQ96GW7 911 aa18.35■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.33■□□□□ 0.53
PRAME-201ENST00000398741 DISP1Q96F81 1524 aa18.33■□□□□ 0.52
PRAME-201ENST00000398741 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms