RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 SHROOM2Q13796 1616 aa29.62■■■□□ 2.33
UPP1-203ENST00000395564 JPH4Q96JJ6 628 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-203ENST00000395564 IQGAP2Q13576 1575 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-203ENST00000395564 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-203ENST00000395564 ARHGEF11O15085 1522 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-203ENST00000395564 GOLGA3Q08378 1498 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-203ENST00000395564 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-203ENST00000395564 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-203ENST00000395564 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-203ENST00000395564 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
UPP1-203ENST00000395564 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.45■■■□□ 2.31
UPP1-203ENST00000395564 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
UPP1-203ENST00000395564 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-203ENST00000395564 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.39■■■□□ 2.29
UPP1-203ENST00000395564 ARAP1Q96P48 1450 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-203ENST00000395564 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-203ENST00000395564 DISP1Q96F81 1524 aa29.33■■■□□ 2.29
UPP1-203ENST00000395564 KIAA0556O60303 1618 aa29.29■■■□□ 2.28
UPP1-203ENST00000395564 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.25■■■□□ 2.27
UPP1-203ENST00000395564 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.25■■■□□ 2.27
UPP1-203ENST00000395564 SAMD9Q5K651 1589 aa29.23■■■□□ 2.27
UPP1-203ENST00000395564 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.19■■■□□ 2.26
UPP1-203ENST00000395564 PTPRGP23470 1445 aa29.19■■■□□ 2.26
UPP1-203ENST00000395564 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
UPP1-203ENST00000395564 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.12■■■□□ 2.25
UPP1-203ENST00000395564 P3H3Q8IVL6 736 aa29.07■■■□□ 2.24
UPP1-203ENST00000395564 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.06■■■□□ 2.24
UPP1-203ENST00000395564 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
UPP1-203ENST00000395564 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-203ENST00000395564 CLIP1P30622 1438 aa29.01■■■□□ 2.24
UPP1-203ENST00000395564 UACAQ9BZF9 1416 aa29.01■■■□□ 2.24
UPP1-203ENST00000395564 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.99■■■□□ 2.23
UPP1-203ENST00000395564 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-203ENST00000395564 CEP162Q5TB80 1403 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-203ENST00000395564 ABCC2Q92887 1545 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-203ENST00000395564 ABCA8O94911 1581 aa28.95■■■□□ 2.23
UPP1-203ENST00000395564 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.94■■■□□ 2.22
UPP1-203ENST00000395564 FMN1Q68DA7 1419 aa28.92■■■□□ 2.22
UPP1-203ENST00000395564 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
UPP1-203ENST00000395564 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.86■■■□□ 2.21
UPP1-203ENST00000395564 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.84■■■□□ 2.21
UPP1-203ENST00000395564 MAPKBP1O60336 1514 aa28.76■■■□□ 2.19
UPP1-203ENST00000395564 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
UPP1-203ENST00000395564 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
UPP1-203ENST00000395564 HECW1Q76N89 1606 aa28.72■■■□□ 2.19
UPP1-203ENST00000395564 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.71■■■□□ 2.19
UPP1-203ENST00000395564 ATP10BO94823 1461 aa28.7■■■□□ 2.19
UPP1-203ENST00000395564 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.67■■■□□ 2.18
UPP1-203ENST00000395564 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
UPP1-203ENST00000395564 ASXL2Q76L83 1435 aa28.65■■■□□ 2.18
UPP1-203ENST00000395564 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.62■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 ARID3CA6NKF2 412 aa28.61■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.58■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.58■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
UPP1-203ENST00000395564 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.57■■■□□ 2.16
UPP1-203ENST00000395564 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
UPP1-203ENST00000395564 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.54■■■□□ 2.16
UPP1-203ENST00000395564 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
UPP1-203ENST00000395564 DIP2BQ9P265 1576 aa28.52■■■□□ 2.16
UPP1-203ENST00000395564 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.51■■■□□ 2.16
UPP1-203ENST00000395564 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
UPP1-203ENST00000395564 GLI2P10070 1586 aa28.48■■■□□ 2.15
UPP1-203ENST00000395564 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.47■■■□□ 2.15
UPP1-203ENST00000395564 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.46■■■□□ 2.15
UPP1-203ENST00000395564 KCNH8Q96L42 1107 aa28.4■■■□□ 2.14
UPP1-203ENST00000395564 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
UPP1-203ENST00000395564 MAP3K1Q13233 1512 aa28.37■■■□□ 2.13
UPP1-203ENST00000395564 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.35■■■□□ 2.13
UPP1-203ENST00000395564 TIAM1Q13009 1591 aa28.34■■■□□ 2.13
UPP1-203ENST00000395564 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.33■■■□□ 2.13
UPP1-203ENST00000395564 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.32■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.32■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 KIF14Q15058 1648 aa28.29■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.29■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 APLP2Q06481 763 aa28.28■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 CD109Q6YHK3 1445 aa28.28■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.27■■■□□ 2.12
UPP1-203ENST00000395564 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.21■■■□□ 2.11
UPP1-203ENST00000395564 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.21■■■□□ 2.11
UPP1-203ENST00000395564 TSPOAP1O95153 1857 aa28.2■■■□□ 2.11
UPP1-203ENST00000395564 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.2■■■□□ 2.1
UPP1-203ENST00000395564 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
UPP1-203ENST00000395564 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.13■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 PLCH2O75038 1416 aa28.13■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.12■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.09■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 NCOA2Q15596 1464 aa28.08■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 NEO1Q92859 1461 aa28.08■■■□□ 2.09
UPP1-203ENST00000395564 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.06■■■□□ 2.08
UPP1-203ENST00000395564 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.06■■■□□ 2.08
UPP1-203ENST00000395564 PREX2Q70Z35 1606 aa28.05■■■□□ 2.08
UPP1-203ENST00000395564 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
UPP1-203ENST00000395564 FANCAO15360 1455 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms