RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.73■■■■□ 3.79
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HOXD13-201ENST00000392539 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.69■■■■□ 3.78
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HOXD13-201ENST00000392539 NESP48681 1621 aa38.6■■■■□ 3.77
HOXD13-201ENST00000392539 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.6■■■■□ 3.77
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HOXD13-201ENST00000392539 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.56■■■■□ 3.76
HOXD13-201ENST00000392539 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
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HOXD13-201ENST00000392539 WDR97A6NE52 1622 aa38.53■■■■□ 3.76
HOXD13-201ENST00000392539 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.52■■■■□ 3.76
HOXD13-201ENST00000392539 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.51■■■■□ 3.76
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HOXD13-201ENST00000392539 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.46■■■■□ 3.75
HOXD13-201ENST00000392539 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.46■■■■□ 3.75
HOXD13-201ENST00000392539 P3H3Q8IVL6 736 aa38.45■■■■□ 3.75
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HOXD13-201ENST00000392539 MAPKBP1O60336 1514 aa38.41■■■■□ 3.74
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HOXD13-201ENST00000392539 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.21■■■■□ 3.71
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HOXD13-201ENST00000392539 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.69
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HOXD13-201ENST00000392539 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXD13-201ENST00000392539 GRIN2BQ13224 1484 aa38.02■■■■□ 3.68
HOXD13-201ENST00000392539 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
HOXD13-201ENST00000392539 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.96■■■■□ 3.67
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HOXD13-201ENST00000392539 NCOA2Q15596 1464 aa37.89■■■■□ 3.66
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HOXD13-201ENST00000392539 HFM1A2PYH4 1435 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXD13-201ENST00000392539 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.83■■■■□ 3.65
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HOXD13-201ENST00000392539 MIA2Q96PC5 1412 aa37.46■■■■□ 3.59
HOXD13-201ENST00000392539 IFT140Q96RY7 1462 aa37.46■■■■□ 3.59
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HOXD13-201ENST00000392539 CCER2I3L3R5 266 aa37.34■■■■□ 3.57
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HOXD13-201ENST00000392539 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
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HOXD13-201ENST00000392539 DAPK1P53355 1430 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXD13-201ENST00000392539 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.12■■■■□ 3.53
HOXD13-201ENST00000392539 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
HOXD13-201ENST00000392539 ABCC5O15440 1437 aa37.05■■■■□ 3.52
HOXD13-201ENST00000392539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
HOXD13-201ENST00000392539 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.98■■■■□ 3.51
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