RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392369.6

RAN-202, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAN, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAN-202ENST00000392369 GOLGA3Q08378 1498 aa48.78■■■■■ 5.4
RAN-202ENST00000392369 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.75■■■■■ 5.39
RAN-202ENST00000392369 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.75■■■■■ 5.39
RAN-202ENST00000392369 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.75■■■■■ 5.39
RAN-202ENST00000392369 ARHGEF11O15085 1522 aa48.71■■■■■ 5.39
RAN-202ENST00000392369 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.69■■■■■ 5.38
RAN-202ENST00000392369 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.66■■■■■ 5.38
RAN-202ENST00000392369 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
RAN-202ENST00000392369 SHROOM2Q13796 1616 aa48.56■■■■■ 5.36
RAN-202ENST00000392369 IQGAP2Q13576 1575 aa48.56■■■■■ 5.36
RAN-202ENST00000392369 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.53■■■■■ 5.36
RAN-202ENST00000392369 JPH4Q96JJ6 628 aa48.43■■■■■ 5.34
RAN-202ENST00000392369 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.41■■■■■ 5.34
RAN-202ENST00000392369 ARAP1Q96P48 1450 aa48.35■■■■■ 5.33
RAN-202ENST00000392369 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.31■■■■■ 5.32
RAN-202ENST00000392369 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.3■■■■■ 5.32
RAN-202ENST00000392369 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.28■■■■■ 5.32
RAN-202ENST00000392369 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
RAN-202ENST00000392369 DISP1Q96F81 1524 aa48.17■■■■■ 5.3
RAN-202ENST00000392369 KIAA0556O60303 1618 aa48.1■■■■■ 5.29
RAN-202ENST00000392369 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.09■■■■■ 5.29
RAN-202ENST00000392369 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.08■■■■■ 5.29
RAN-202ENST00000392369 SAMD9Q5K651 1589 aa48.07■■■■■ 5.29
RAN-202ENST00000392369 P3H3Q8IVL6 736 aa48■■■■■ 5.27
RAN-202ENST00000392369 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.98■■■■■ 5.27
RAN-202ENST00000392369 CEP162Q5TB80 1403 aa47.96■■■■■ 5.27
RAN-202ENST00000392369 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.95■■■■■ 5.27
RAN-202ENST00000392369 CLIP1P30622 1438 aa47.94■■■■■ 5.27
RAN-202ENST00000392369 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.87■■■■■ 5.25
RAN-202ENST00000392369 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.86■■■■■ 5.25
RAN-202ENST00000392369 PTPRGP23470 1445 aa47.8■■■■■ 5.24
RAN-202ENST00000392369 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.61■■■■■ 5.21
RAN-202ENST00000392369 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.56■■■■■ 5.2
RAN-202ENST00000392369 FMN1Q68DA7 1419 aa47.52■■■■■ 5.2
RAN-202ENST00000392369 UACAQ9BZF9 1416 aa47.51■■■■■ 5.2
RAN-202ENST00000392369 ABCA8O94911 1581 aa47.5■■■■■ 5.19
RAN-202ENST00000392369 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.44■■■■■ 5.19
RAN-202ENST00000392369 ABCC2Q92887 1545 aa47.42■■■■■ 5.18
RAN-202ENST00000392369 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.39■■■■■ 5.18
RAN-202ENST00000392369 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
RAN-202ENST00000392369 VPS8Q8N3P4 1428 aa47.3■■■■■ 5.16
RAN-202ENST00000392369 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
RAN-202ENST00000392369 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.27■■■■■ 5.16
RAN-202ENST00000392369 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.16
RAN-202ENST00000392369 HECW1Q76N89 1606 aa47.24■■■■■ 5.15
RAN-202ENST00000392369 ARID3CA6NKF2 412 aa47.23■■■■■ 5.15
RAN-202ENST00000392369 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.21■■■■■ 5.15
RAN-202ENST00000392369 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.18■■■■■ 5.14
RAN-202ENST00000392369 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.16■■■■■ 5.14
RAN-202ENST00000392369 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
RAN-202ENST00000392369 MAPKBP1O60336 1514 aa47.15■■■■■ 5.14
RAN-202ENST00000392369 ATP10BO94823 1461 aa47.13■■■■■ 5.13
RAN-202ENST00000392369 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.11■■■■■ 5.13
RAN-202ENST00000392369 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
RAN-202ENST00000392369 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
RAN-202ENST00000392369 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.03■■■■■ 5.12
RAN-202ENST00000392369 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.01■■■■■ 5.12
RAN-202ENST00000392369 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
RAN-202ENST00000392369 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.98■■■■■ 5.11
RAN-202ENST00000392369 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.97■■■■■ 5.11
RAN-202ENST00000392369 DIP2BQ9P265 1576 aa46.91■■■■■ 5.1
RAN-202ENST00000392369 ASXL2Q76L83 1435 aa46.9■■■■■ 5.1
RAN-202ENST00000392369 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.85■■■■■ 5.09
RAN-202ENST00000392369 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.83■■■■■ 5.09
RAN-202ENST00000392369 TIAM1Q13009 1591 aa46.8■■■■■ 5.08
RAN-202ENST00000392369 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.78■■■■■ 5.08
RAN-202ENST00000392369 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.76■■■■■ 5.08
RAN-202ENST00000392369 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
RAN-202ENST00000392369 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.74■■■■■ 5.07
RAN-202ENST00000392369 MAP3K1Q13233 1512 aa46.72■■■■■ 5.07
RAN-202ENST00000392369 APLP2Q06481 763 aa46.72■■■■■ 5.07
RAN-202ENST00000392369 KCNH8Q96L42 1107 aa46.66■■■■■ 5.06
RAN-202ENST00000392369 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.65■■■■■ 5.06
RAN-202ENST00000392369 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.64■■■■■ 5.06
RAN-202ENST00000392369 GLI2P10070 1586 aa46.61■■■■■ 5.05
RAN-202ENST00000392369 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.61■■■■■ 5.05
RAN-202ENST00000392369 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
RAN-202ENST00000392369 TSPOAP1O95153 1857 aa46.58■■■■■ 5.05
RAN-202ENST00000392369 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.58■■■■■ 5.05
RAN-202ENST00000392369 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.55■■■■■ 5.04
RAN-202ENST00000392369 KIF14Q15058 1648 aa46.54■■■■■ 5.04
RAN-202ENST00000392369 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.52■■■■■ 5.04
RAN-202ENST00000392369 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
RAN-202ENST00000392369 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.43■■■■■ 5.023e-9■□□□□ 10.9
RAN-202ENST00000392369 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.4■■■■■ 5.02
RAN-202ENST00000392369 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.4■■■■■ 5.02
RAN-202ENST00000392369 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
RAN-202ENST00000392369 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.01
RAN-202ENST00000392369 NCOA2Q15596 1464 aa46.3■■■■■ 5
RAN-202ENST00000392369 CD109Q6YHK3 1445 aa46.25■■■■■ 4.99
RAN-202ENST00000392369 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.22■■■■■ 4.99
RAN-202ENST00000392369 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.19■■■■■ 4.99
RAN-202ENST00000392369 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.17■■■■■ 4.98
RAN-202ENST00000392369 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.98
RAN-202ENST00000392369 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.12■■■■■ 4.97
RAN-202ENST00000392369 PLCH2O75038 1416 aa46.12■■■■■ 4.97
RAN-202ENST00000392369 PREX2Q70Z35 1606 aa46.12■■■■■ 4.97
RAN-202ENST00000392369 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.09■■■■■ 4.97
RAN-202ENST00000392369 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.08■■■■■ 4.97
RAN-202ENST00000392369 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.07■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms